Er zijn geen algemene regels voorgesteld om rekening te houden met de functionele gevolgen van genregulerende mutaties. In een eerste poging om de aard van dergelijke regels vast te stellen, werd een analyse uitgevoerd van de DNA sequentie context van 153 verschillende single base-pair substituties in de regulerende gebieden van 65 verschillende menselijke genen die ten grondslag liggen aan erfelijke ziekte. Het gebruik van een recent voorgestelde maat voor de complexiteit van de DNA-sequentie (rekening houdend met het niveau van structurele herhaling van een DNA-sequentie, in plaats van simpelweg de oligonucleotidesamenstelling) heeft gediend om aan te tonen dat de gelijktijdige verandering in de complexiteit van de lokale DNA-sequentie rond een gesubstitueerd nucleotide gerelateerd is aan de waarschijnlijkheid van een regulerende mutatie die onder klinische aandacht komt. Mutaties die tot een toename in complexiteit leidden, vertoonden hogere odds ratio ‘ s ten gunste van pathologische gevolgen dan mutaties die tot een afname leidden of de complexiteit onveranderd lieten. Deze relatie was echter alleen waarneembaar voor pyrimidine-purine transversies. Odds ratio ‘ s voor andere soorten substitutie werden niet significant geassocieerd met lokale veranderingen in sequentiecomplexiteit, hoewel een trend vergelijkbaar was met die waargenomen voor Y–>R transversies ook duidelijk was voor transities. Deze bevindingen suggereren dat het behoud van een bepaald niveau van de complexiteit van de DNA-sequentie, of op zijn minst het vermijden van een toename van de complexiteit van de sequentie, een kritische voorwaarde is voor de functie van genregulerende gebieden.