Endringer i primær DNA-sekvenskompleksitet påvirker fenotypiske konsekvenser av mutasjoner i humane genregulatoriske regioner

det er ikke foreslått noen generelle regler for å redegjøre for de funksjonelle konsekvensene av genregulatoriske mutasjoner. I et første forsøk på å fastslå arten av slike regler ble det utført en analyse AV DNA-sekvenskonteksten av 153 forskjellige enkeltbaseparsubstitusjoner i regulatoriske regioner av 65 forskjellige humane gener som ligger til grunn for arvelig sykdom. Bruk av et nylig foreslått mål PÅ dna-sekvenskompleksitet (tatt i betraktning nivået av strukturell repetitivitet av EN DNA-sekvens, i stedet for bare oligonukleotidsammensetningen) har tjent til å demonstrere at den samtidige endringen i lokal DNA-sekvenskompleksitet rundt et substituert nukleotid er relatert til sannsynligheten for at en regulatorisk mutasjon kommer til klinisk oppmerksomhet. Mutasjoner som førte til en økning i kompleksitet viste høyere odds-forhold til fordel for patologiske konsekvenser enn mutasjoner som førte til en reduksjon eller venstre kompleksitet uendret. Dette forholdet var imidlertid merkbar bare for pyrimidin-til-purin-transversjoner. Oddsforhold for andre typer substitusjon ble ikke funnet å være signifikant assosiert med lokale endringer i sekvenskompleksitet, selv om en trend som ligner den som ble observert For Y–> r transversjoner også var tydelig for overganger. Disse funnene antyder at vedlikehold av et definert NIVÅ AV DNA-sekvenskompleksitet, eller i det minste unngåelse av en økning i sekvenskompleksitet, er en kritisk forutsetning for funksjonen av genregulatoriske regioner.

Legg igjen en kommentar

Din e-postadresse vil ikke bli publisert.