Non sono state proposte regole generali per tenere conto delle conseguenze funzionali delle mutazioni regolatrici del gene. In un primo tentativo di stabilire la natura di tali regole, è stata eseguita un’analisi del contesto della sequenza di DNA di 153 diverse sostituzioni a singola coppia di basi nelle regioni regolatorie di 65 diversi geni umani alla base della malattia ereditaria. L’uso di una recente proposta di misura di sequenza di DNA complessità (tenendo conto del livello di ripetitività strutturale di una sequenza di DNA, piuttosto che semplicemente l’oligonucleotide composizione) è servita a dimostrare che il cambiamento concomitante di locali sequenza di DNA complessità circostante sostituita nucleotide è legato alla probabilità di una regolamentazione mutazione venuta di attenzione clinica. Le mutazioni che hanno portato ad un aumento della complessità hanno mostrato rapporti di probabilità più elevati a favore di conseguenze patologiche rispetto alle mutazioni che hanno portato ad una diminuzione o hanno lasciato la complessità invariata. Questa relazione, tuttavia, era distinguibile solo per le transversioni pirimidina-purina. I rapporti di probabilità per altri tipi di sostituzione non sono stati trovati significativamente associati a cambiamenti locali nella complessità della sequenza, anche se una tendenza simile a quella osservata per le transversioni Y>R era evidente anche per le transizioni. Questi risultati suggeriscono che il mantenimento di un livello definito di complessità della sequenza del DNA, o almeno l’evitare un aumento della complessità della sequenza, è un prerequisito critico per la funzione delle regioni regolatrici del gene.