Az univerzum legkönnyebb és legbőségesebben előforduló eleme, a hidrogén az egész univerzum tömegének közel 3/4-ét teszi ki. Minden glükózmolekulában 12 hidrogénatom található. Bár elemi formájában közvetlenül nem kötődik jól a szénhez, a két elem nem elemi formái közötti reakciók olyan molekulákat képeznek, amelyek tartalmazzák a szén-hidrogén kötést, amely a legtöbb, ha nem az összes szerves vegyületben megtalálható-mint például a glükóz. Az elektronegatív elemekkel, köztük az oxigénnel szembeni magas reaktivitása erős kötéseket eredményez a hidrogénkötéseknek nevezett elemekkel. A hidrogénkötések és a hidrogén-szén kötések képezik az összes szénhidrát alapját, mint például a glükóz. A hidrogén elhelyezése egy glükózmolekulában szintén fontos, mivel a szénnel és oxigénnel való kötési sorrendjétől függően a hidrogén elhelyezése meghatározza, hogy egy glükózmolekula “dextro” vagy “levo” típusú cukor. Ez létfontosságú, mivel a dextro glükózmolekulák metabolizálhatók, a levo molekulák pedig nem.