Žádná obecná pravidla byly navrženy na účet pro funkční důsledky genových regulačních mutace. V prvním pokusu zjistit povahu těchto pravidel, analýza byla provedena DNA sekvence kontextu 153 rozdílných single base-pair substituce v regulačních oblastech 65 různých lidských genů hlubších dědičné onemocnění. Pomocí nedávno navrženého opatření z DNA sekvence složitost (s přihlédnutím k úrovni strukturálních repetitivnost DNA sekvence, spíše než jednoduše oligonukleotid složení) se podává prokázat, že současné změny v místních DNA sekvence složitost okolní substituovaný nukleotidů se vztahuje k pravděpodobnosti regulační mutace přichází do klinické pozornost. Mutace, které vedly ke zvýšení složitosti vykazovali vyšší šance poměry ve prospěch patologické důsledky než mutace, které vedly k poklesu nebo vlevo složitosti beze změny. Tento vztah, nicméně, byl rozpoznatelný pouze pro transverze pyrimidin-purin. Kurzy poměry jiných typů substituční zjistilo, že není výrazně spojena s lokální změny v pořadí složitosti, i když podobný trend jako pozorovat u Y – >R transversions bylo patrné i pro přechody. Tyto výsledky naznačují, že zachování definované úrovně DNA sekvence složitost, nebo alespoň zamezení zvýšení složitosti sekvence, je kritickým předpokladem pro funkci genových regulačních oblastí.