Primeiro se estabeleceram no período Pré-histórico, no local hoje conhecido como Magoula Balomenou (Μαγούλα Μπαλωμένου), seu nome antigo era Arne, e ele foi originalmente na margem do Lago Copais (posteriormente drenado). Chaeronea estava sujeita a Orchomeno que era, a partir de 600 a. C., um membro da Liga Boeotiana. No final do século V a. C., Chaironeia pertencia a um dos 11 distritos Boeotianos, juntamente com Acraéfnio e Copia.Chaeronea foi o local de várias batalhas históricas. O mais conhecido é o de 338 A. C., Entre Filipe II da Macedônia e uma coalizão de vários estados gregos, principalmente Tebas e Atenas. Durante a batalha, a unidade de elite dos soldados Tebas, conhecida como o Grupo sagrado de Tebas, foi completamente exterminada (ver Batalha de Queroneia). Em 1818, o chamado Leão de Queroneia, com quase 6 metros de altura (6.1 m) monumento funerário erguido em honra da banda Sagrada, foi redescoberto por viajantes ingleses. O monumento fragmentário foi remontado e instalado em 1902 por uma organização chamada Ordem de Chaeronea em cima de um pedestal no local de sua descoberta. O antigo biógrafo e ensaísta Plutarco nasceu em Queroneia, e várias vezes se refere a estes e outros fatos sobre seu lugar nativo em seus escritos.outras batalhas em torno de Chaeronea:
- Após a captura de Queroneia em 447 A.C., os Atenienses foram atacados e derrotados no mesmo ano por Beócios na Batalha de Coronea.em 146 a. C., O general romano Matelo derrotou uma unidade de 1.000 Arkadianos.em 86 A. C., Arquelau e Taxilo, generais de Mitrídates VI do ponto, desembarcaram em Boeotia. Eles foram recebidos pelo general romano Lúcio Cornélio Sula perto de Queroneia e na batalha que se seguiu os Mitrídicos foram derrotados e recuaram para Cálcis. batalha entre catalães e Francos em 15 de Março de 1311. A companhia catalã derrotou os francos e assumiu o controle de grande parte da Grécia. Os turcos participaram com o lado dos catalães. A batalha é descrita por Ramon Muntaner, um soldado Catalão.batalha entre gregos e turcos em 1823 e 1825 durante a Revolução grega (1821-1828).
O site de Tebas vala foi escavada em 1879-80 por P. Stamatakis, e o sítio pré-histórico de Magoula Balamenou, 23 anos depois, pelo arqueólogo G. Soteriadis.
