s-a stabilit pentru prima dată în perioada preistorică la situl cunoscut acum sub numele de Magoula Balomenou (inkt), numele său mai vechi era Arne și a fost inițial pe malul lacului copais (ulterior drenat). Chaeronea a fost supusă Orchomenus care a fost, începând din 600 î.hr., membru al Liga Beotiană. La sfârșitul secolului 5 î.hr., Chaironeia aparținea unuia dintre cele 11 districte Beotiene împreună cu Acraephnium și Copia.Chaeronea a fost locul mai multor bătălii istorice. Cel mai cunoscut este cel din 338 Î.hr., între Filip al II-lea al Macedoniei și o coaliție de diferite state grecești, în principal Teba și Atena. În timpul bătăliei, unitatea de elită a soldaților tebani cunoscută sub numele de trupa Sacră din Teba a fost distrusă complet (vezi Bătălia de la Chaeronea). În 1818, așa-numitul Leu din Chaeronea, o înălțime de aproape 20 de picioare (6.1 m) monumentul funerar ridicat în cinstea trupei Sacre, a fost redescoperit de călătorii englezi. Monumentul fragmentar a fost reasamblat și instalat în 1902 de o organizație numită Ordinul Chaeronea deasupra unui piedestal la locul descoperirii sale. Vechiul biograf și eseist Plutarh s-a născut în Chaeronea și se referă de mai multe ori la aceste și alte fapte despre locul său natal în scrierile sale.
alte bătălii în jurul Chaeronea:
- după capturarea Chaeronea în 447 Î.hr. atenienii au fost atacați și învinși în același an de către Beotieni la Bătălia de la Coronea.în 146 î.HR., generalul Roman Matellus a învins o unitate de 1.000 de Arkadieni.în 86 î.hr., Arhelau și Taxilos, generali ai lui Mithridates al VI-lea al Pontului, au debarcat în Beotia. Au fost întâmpinați de generalul Roman Lucius Cornelius Sulla lângă Chaeronea și în bătălia care a urmat Mithridatics au fost învinși și s-au retras la Chalcis.
- bătălia dintre catalani și franci la 15 martie 1311. Compania Catalană i-a învins pe Franci și a preluat controlul asupra unei mari părți a Greciei. Turcii au participat cu partea catalanilor. Bătălia este descrisă de Ramon Muntaner, un soldat Catalan.
- bătălia dintre greci și turci în 1823 și 1825 în timpul revoluției grecești (1821-1828).
locul mormântului comun Teban a fost excavat în 1879-80 de P. Stamatakis și situl preistoric Magoula Balamenou 23 de ani mai târziu de arheologul G. Soteriadis.
