asettui esihistoriallisella ajalla ensimmäisen kerran paikalle, joka nykyään tunnetaan nimellä Magoula balomenou (μαγούλα μπαλωμένου), sen vanhempi nimi oli Arne, ja se sijaitsi alun perin copais-järven (myöhemmin ojitettu) rannalla. Chaeronea alistettiin Orchomenus joka oli, alkaen 600 eaa, jäsen Boiotian League. 500-luvun lopulla eaa, Chaironeia kuului yhteen 11 Boiotian piirikuntaan yhdessä Akraefniumin ja Copian kanssa.
Chaeroneassa käytiin useita historiallisia taisteluja. Parhaiten se tunnetaan Makedonian Filippos II: n ja useiden kreikkalaisten valtioiden, lähinnä Theban ja Ateenan, välisen liiton ajalta 338 eaa. Taistelun aikana Theban pyhänä joukkona tunnettu Theban sotilaiden eliittiyksikkö tuhottiin kokonaan (katso Chaeroneian taistelu). Vuonna 1818 niin sanottu Chaeronean leijona, lähes 20-metrinen (6.1 m) Pyhän bändin kunniaksi pystytetty hautamuistomerkki, jonka englantilaiset matkailijat löysivät uudelleen. Hajanaisen muistomerkin kokosi uudelleen ja asensi vuonna 1902 järjestö nimeltä Chaeronean ritarikunta jalustan päälle sen löytöpaikalla. Antiikin elämäkerran kirjoittaja ja esseisti Plutarkhos syntyi Chaeroneiassa, ja viittaa useita kertoja näihin ja muihin faktoihin synnyinpaikastaan kirjoituksissaan.
muut chaeronean ympärillä käydyt taistelut:
- vallattuaan Chaeroneian vuonna 447 eaa.boiotialaiset hyökkäsivät ateenalaisten kimppuun ja voittivat heidät samana vuonna Koroneian taistelussa.
- roomalainen kenraali Matellus kukisti 1000 Arkadialaisen yksikön vuonna 146 eaa.
- vuonna 86 eaa Pontoksen Mithridates VI: n kenraalit Arkelaos ja Taksilos nousivat maihin Boiotiassa. Heitä vastassa oli roomalainen kenraali Lucius Cornelius Sulla lähellä Chaeroneiaa ja seuranneessa taistelussa Mithridaatikot lyötiin ja he vetäytyivät Khalkikseen.
- katalaanien ja frankkien välinen taistelu 15. maaliskuuta 1311. Katalonian komppania kukisti frankit ja otti haltuunsa suuren osan Kreikkaa. Turkkilaiset osallistuivat katalaanien puolelle. Taistelua kuvaa katalonialainen Ramon Muntaner.
- kreikkalaisten ja turkkilaisten välinen taistelu vuosina 1823 ja 1825 Kreikan vallankumouksen (1821-1828) aikana.
Thebalaisten joukkohaudan paikalla kaivettiin 1879-80, P. Stamatakis, ja esihistoriallinen paikka Magoula Balamenou 23 vuotta myöhemmin arkeologi G. Soteriadis.