Doña Carlota Joaquina von Spanien war von Geburt an Mitglied der spanischen Niederlassung des Hauses Bourbon und Infantin von Spanien und durch Heirat Königin Gemahlin von Portugal.Älteste Tochter von König Karl IV. von Spanien und Maria Luisa von Parma, wurde sie im Mai 1785 im Alter von 10 mit Infante John, Lord of the Infantado und Herzog von Beja, zweiter Sohn von Königin Maria I. von Portugal, in einem Versuch, zementieren die Beziehungen zwischen den Königreichen Spanien und Portugal verheiratet.
Vom portugiesischen Hof verabscheut — wo sie „die Spitzmaus von Queluz“ genannt wurde — gewann Carlota Joaquina auch allmählich die Abneigung der Menschen, die sie der Promiskuität beschuldigten und ihren Ehemann zugunsten der Interessen der spanischen Krone beeinflussten.Nach der Flucht des portugiesischen Hofes nach Brasilien begann Carlota Joaquina, sich gegen ihren Ehemann zu verschwören und behauptete, er habe keine geistige Fähigkeit, Portugal und seine Besitztümer zu regieren, und wollte so eine Regentschaft errichten. Ehrgeizig plante sie auch, die spanische Krone, die sich in den Händen von Napoleons Bruder Joseph Bonaparte befand, an sich zu reißen.