ユニット731は、特にすべての年齢の人々に人体実験を行うことにより、生物学的および化学的戦争を研究するために、中国ハルビン（当時 日中戦争と第二次世界大戦の間、日本は腺ペスト、コレラ、天然痘、ボツリヌス中毒、炭疽菌などの病気を爆弾に包んでおり、中国の戦闘員と非戦闘員に日常的に投下された。 2002年の細菌戦の犯罪に関する国際シンポジウムによると、大日本帝国陸軍の細菌戦と人体実験によって殺された人の数は約580,000人であった。

真珠湾攻撃後の米国との戦争の最初の数ヶ月の間に、日本はアメリカ人に対して生物兵器を使用することを計画しました。 1942年3月のフィリピン方面作戦では、日本軍は10回に分けて90kg(200ポンド)のペストを運ぶノミ(約1億5000万匹の昆虫)を解放することを検討したが、アメリカ軍は計画が実行される前にバターンで降伏した。 1944年11月ごろ、日本は10,000m(30,000ft)まで上昇するように設計された風船によって運ばれた合計9,300発の焼夷弾と対人爆弾を打ち上げ、その後ジェットストリームによって東に掃引されて大陸アメリカに送られた。 彼らはブライ、オレゴン州の近くに六人のアメリカ人の民間人を殺した;メドフォード、オレゴン州の農場に墜落した; そして、ワシントンのハンフォードサイトのマンハッタンプロジェクトの生産施設で原子炉冷却ポンプのための電気を供給する電力線に短絡を引き起こ バックアップシステムは、電源を復元しました。 硫黄島の戦いでは、侵略アメリカ人に対する別の生物学的攻撃が検討されました。 パイロットの松本正一は後に、病原体を運ぶグライダーが戦闘中に曳航されて解放されるはずだったが、攻撃に備えて本土から平方区の松本飛行場に離陸することになっていたグライダーは目的地に到達しなかったことを回想している。