La préparation transectée intercolliculaire a ouvert un champ riche pour l’étude des mécanismes veille-sommeil. Les premiers résultats ont montré que les influences ascendantes du tronc cérébral sont essentielles au maintien d’un cortex activé. Il a ensuite été montré que le cerveau antérieur développe également des influences activatrices, car la désynchronisation EEG du cortex réapparaît dans la préparation chronique du cerveau isolé, et un rythme thêta continu ou presque continu peut se produire dans la préparation aiguë du cerveau isolé. Une brève « étape intermédiaire » du sommeil se produit pendant le sommeil naturel juste avant et après le sommeil paradoxal. Il se caractérise par des sursauts du fuseau cortical, une activité thêta à basse fréquence de l’hippocampe (deux schémas de la préparation aiguë du cerveau isolé) et s’accompagne d’un niveau de transmission thalamique très faible, suggérant un état de type cervical isolé. La préparation chronique du cerveau isolé démontre également que les processus exécutifs du sommeil paradoxal sont situés dans le tronc cérébral inférieur, tandis que l’apparition de ce stade du sommeil semble être modulée par les structures du cerveau antérieur.