La génétique chimique utilise divers composés à petites molécules pour élucider les processus biologiques d’une manière analogue aux stratégies de mutagenèse au cœur de la génétique classique. Le criblage de bibliothèques de petites molécules pour les composés induisant un phénotype d’intérêt représente l’approche chimico-génétique directe, tandis que l’approche inverse implique de petites molécules ciblant une seule protéine. Ici, nous passons en revue les principales différences entre les objectifs du criblage des petites molécules dans l’industrie et le milieu universitaire, les développements récents du criblage à haut débit et les ressources accessibles au public des collections de composés, des installations de criblage et des bases de données. Un résultat particulièrement excitant d’un criblage génétique chimique est la découverte d’un rôle jusque-là inconnu pour une protéine dans une voie ainsi que des composés qui affectent la fonction de cette protéine. Dans des cas illustratifs, de telles découvertes ont conduit à des progrès vers le développement thérapeutique et, plus généralement, ont augmenté la taille de la « boîte à outils » de petites molécules à la disposition de la communauté de recherche pour l’étude des processus biologiques.