Brève description de deux types de mort cellulaire programmée: l’apoptose et l’autophagie
L’apoptose, ou mort cellulaire programmée de type I, est la plus largement étudiée des formes de mort cellulaire. Ses caractéristiques morphologiques peuvent être identifiées en microscopie optique, et comprennent le rétrécissement cellulaire, le compactage de la chromatine, le blébinage de la membrane cytoplasmique et, enfin, la formation de corps apoptotiques (Figure 1). Biochemically, apoptosis is characterized by the participation of proteases called caspases, orderly internucleosomal DNA fragmentation, phosphatidylserine externalization, changes in mitochondrial membrane permeability, and the participation of members of the Bcl-2 protein family.
Les caspases sont des protéases spécifiques aux cystéinyl-aspartates qui sont synthétisées sous une forme inactive sous forme de zymogènes appelés pro-caspases (Figure 2). C’est cette forme inactive qui permet l’exécution contrôlée du processus de mort cellulaire. Les caspases ont d’abord été identifiées chez le nématode Ceanorhabditis elegans, mais des formes homologues sont présentes chez les mammifères.
Les caractéristiques de l’apoptose, telles que la fragmentation de l’ADN et la chromatine compactée, résultent de l’activité de la caspase. Pendant l’apoptose, l’ADN est fragmenté en taille de nucléosome (200 pb). Le facteur responsable de la fragmentation de l’ADN pendant l’apoptose est une DNase spécifique (CAD, DNase activée par la caspase) qui est activée par la caspase-3 active. La caspase-3 active, à son tour, est impliquée dans les modifications morphologiques des cellules au cours de l’apoptose, où elle clive la kinase-1 associée à la rho (ROCK-1) afin de l’activer et cela affecte finalement l’arrangement cytosquelettique provoquant la morphologie de retrait apoptotique.
La mort cellulaire apoptotique est fortement régulée par les membres de la famille des lymphomes à cellules B 2 (Bcl-2). Les membres de la famille Bcl-2 ont été classés comme protéines anti-apoptotiques et pro-apoptotiques selon leur homologie Bcl-2 (BH) et leur organisation de domaine (Figure 3). La présence des domaines BH1, BH2, BH3 et BH4 correspond au groupe qui inhibe l’apoptose. Le groupe pro-apoptotique, en revanche, est divisé en deux groupes: ceux avec des domaines BH1, BH2 et BH3, et ceux avec seulement les domaines BH3 (définis comme BH3 uniquement; voir la revue dans). Cette famille de protéines remplit ses fonctions au niveau intracellulaire à l’intérieur des mitochondries, un élément clé de l’apoptose.
L’apoptose peut être initiée par deux voies bien décrites : les voies extrinsèques et intrinsèques (Figure 4). L’activation extrinsèque est réalisée par la participation de ligands mortels (tels que la superfamille du facteur de nécrose tumorale– TNF et les ligands induits par l’apoptose liés au TNF, ou TRAIL) avec leurs récepteurs de mort de surface cellulaire apparentés (tels que le récepteur TNF 1, le SAF, le récepteur TRAIL 1 ou le récepteur TRAIL 2) (examiné dans). Une fois que le ligand reconnaît et se lie à son récepteur, une série de complexes intracellulaires se forment pour activer les caspases initiatrices (telles que -8 et -10), qui activent ensuite les caspases exécutrices (telles que -3, -6 et -7). In their activated form, these executioner caspases cleave multiple intracellular targets.
La voie apoptotique intrinsèque, en revanche, peut être activée par divers stimuli, y compris les dommages à l’ADN, la famine du facteur de croissance et le stress oxydatif. Lors de l’exposition des cellules à ces stimuli, les mitochondries sont affectées, car plusieurs membres de la famille Bcl-2 sont activés et favorisent la perméabilisation de la membrane externe des mitochondries (MOMP). La membrane mitochondriale externe imprégnée permet la libération du cytochrome c (cyt c), qui est associé à la protéine Apaf-1. L’union cyt c et Apaf-1 se lie ensuite à la caspase-9 initiatrice pour former le complexe qui constitue l’apoptosome, qui a la capacité d’activer les caspases initiatrices qui remplissent leurs fonctions en clivant des substrats cellulaires spécifiques.
Le deuxième processus de mort cellulaire, l’autophagie, est un processus génétiquement programmé et conservé de manière évolutive qui produit la dégradation d’organites et de protéines obsolètes. Il est activé par des stimuli extracellulaires tels que la privation de nutriments, l’hypoxie, la température élevée et les conditions intracellulaires altérées, y compris l’accumulation d’organites endommagés ou superflus (examinés dans).
Chez les organismes eucaryotes, trois types d’autophagie ont été décrits : la microautophagie, la macroautophagie (communément appelée simplement autophagie) et l’autophagie à médiation chaperon (Figure 5). La microautophagie implique l’engloutissement des composants cytoplasmiques directement au niveau du lysosome au moyen d’un processus d’invagination, tandis que la macroautophagie implique la formation de vésicules à double membrane contenant des composants cellulaires, qui fusionnent avec les lysosomes pour former un autophagolysosome. C’est à l’intérieur de l’autophagolysosome que les composants intra-vésiculaires sont dégradés et, si possible, recyclés par la cellule (revue en). Enfin, l’autophagie médiée par les chaperons implique la participation des chaperons à la reconnaissance des protéines désignées pour l’élimination par les lysosomes.
L’autophagie est dirigée par des gènes Atg (liés à l’autophagie), qui sont nécessaires pour activer le complexe de signalisation qui déclenche la formation d’autophagosomes. Des atggènes ont été découverts dans la levure, mais beaucoup ont des orthologues chez les eucaryotes supérieurs (Figure 6). La formation d’autophagosomes implique la participation de la protéine cytoplasmique LC3 (Atg8), qui subit une lipidation par la phosphatidyléthanolamine, puis est recrutée dans la membrane autophagosomique naissante (Figure 7). L’accumulation de la protéine LC3 lipidée (connue sous le nom de LC3-II) est utilisée comme marqueur de l’autophagie.
La mort cellulaire autophagique, ou mort cellulaire programmée de type II, est caractérisée par une engloutissement massif du cytoplasme par des vésicules autophagiques. Cette activité autophagique intense diffère sensiblement de l’autophagie qui se produit continuellement aux niveaux basaux. Des études ultrastructurales chez la Drosophile ont révélé l’accumulation de vacuoles autophagiques dans la plupart des tissus larvaires. Ce type de mort cellulaire programmée commence par la dégradation des organites cytoplasmiques par autophagie, bien que les éléments cytosquelettiques soient conservés jusqu’aux derniers stades du processus (examinés dans).