Établir le diagnostic de fibrose kystique (FC) est simple chez la majorité des patients: ils présentent un tableau clinique clair (le plus souvent des symptômes respiratoires chroniques plus malabsorption), la valeur du chlorure de sueur est > 60mmol/L et deux maladies connues provoquant des mutations CFTR sont identifiées. Chez moins de 5% des sujets, principalement ceux avec un phénotype plus doux ou limité, le processus de diagnostic est plus complexe, car les résultats initiaux des tests de diagnostic ne sont pas concluants: concentration de chlorure de sueur dans la plage intermédiaire, inférieure à 2 FC provoquant des mutations identifiées ou les deux. Ces patients doivent être dirigés vers des centres experts où des essais biologiques de la fonction CFTR, tels que la mesure de la différence de potentiel nasale ou la mesure du courant intestinal, peuvent être effectués. Néanmoins, chez certains patients, malgré des symptômes compatibles avec la FC et une certaine indication d’un dysfonctionnement du CFTR (par exemple, seule une valeur intermédiaire en chlorure de sueur), les critères diagnostiques ne sont pas remplis (par exemple, seule une mutation du CFTR a été identifiée). Pour ces sujets, le terme trouble lié au CFTR (CFTR-RD) est utilisé. Les patients présentant une bronchectasie disséminée, une absence bilatérale congénitale du canal déférent et une pancréatite aiguë ou récurrente peuvent entrer dans cette catégorie. La mucoviscidose a un spectre de maladies très large et le diagnostic est de plus en plus posé à l’âge adulte, principalement chez des sujets présentant des phénotypes plus doux. Dans de nombreux pays, le dépistage néonatal de la mucoviscidose a été introduit à l’échelle nationale. Chez les bébés dépistés positifs, le diagnostic de mucoviscidose doit être confirmé par un test de sueur démontrant une concentration en chlorure de sueur supérieure à 60 mmol/L. Pour bénéficier du NBS, chaque bébé chez lequel le diagnostic de FK est confirmé doit recevoir un suivi et un traitement immédiats dans un centre de référence pour la FK. CF NBS n’est pas une preuve complète: certains diagnostics seront manqués et chez certains bébés, le diagnostic ne peut être ni confirmé ni exclu avec certitude. Les algorithmes de dépistage qui incluent le séquençage des gènes détecteront un nombre élevé de ces bébés qui sont positifs au dépistage avec un diagnostic non concluant (CFSPID). Même en 2016, le test de diagnostic le plus fiable et le plus largement disponible pour la FC est la mesure de la concentration en chlorure dans la sueur. La méthode de choix est l’induction de la sueur par ionophorèse pilocarpine, suivie d’une collecte de la sueur sur une gaze ou un papier filtre ou dans une bobine de Macroduct. Étant donné que des thérapies spécifiques aux mutations sont devenues disponibles, il est important d’identifier les mutations responsables de la mucoviscidose chez chaque patient.