ChEBI

Les entités chimiques d’intérêt biologique, également connues sous le nom de ChEBI, sont une base de données chimique et une ontologie d’entités moléculaires axées sur les « petits » composés chimiques, qui fait partie de l’effort d’Ontologies Biomédicales Ouvertes (OBO) de l’Institut Européen de Bioinformatique (EBI). Le terme « entité moléculaire » désigne tout « atome, molécule, ion, paire d’ions, radical, ion radicalaire, complexe, conformère, etc. constitutionnellement ou isotopiquement distincts., identifiable comme une entité distincte « . Les entités moléculaires en question sont soit des produits de la nature, soit des produits synthétiques ayant une bioactivité potentielle. Les molécules directement codées par le génome, telles que les acides nucléiques, les protéines et les peptides dérivés de protéines par clivage protéolytique, ne sont généralement pas incluses dans ChEBI.

Entités chimiques d’Intérêt Biologique (ChEBI)

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Content

Description

Chemical database

Data types
captured

Small chemical compounds

Contact

Research center

European Molecular Biology Laboratory European Union

Laboratory

European Bioinformatics Institute United Kingdom

Primary citation

de Matos et al

Access

Website

www.ebi.ac.uk/chebi

Download URL

ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi

Web service URL

www.ebi.ac.uk/chebi/webServices.do

Sparql endpoint

BIO2RDF

Tools

Web

www.ebi.ac.uk/chebi

Divers

Diffusion des données
fréquence

mensuelle

Politique de conservation

Organisée manuellement

ChEBI utilise la nomenclature, le symbolisme et la terminologie approuvés par l’Union Internationale de Chimie Pure et Appliquée (UICPA) et le comité de nomenclature de l’Union Internationale de Biochimie et de Biologie Moléculaire (NC-IUBMB).

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