Un analogue structurel (analogue en anglais du Commonwealth), également appelé analogue chimique ou simplement analogue, est un composé ayant une structure similaire à celle d’un autre composé, mais qui en diffère par rapport à un certain composant.

Il peut différer en un ou plusieurs atomes, groupes fonctionnels ou sous-structures, qui sont remplacés par d’autres atomes, groupes ou sous-structures. On peut imaginer qu’un analogue structurel soit formé, au moins théoriquement, à partir de l’autre composé. Les analogues structurels sont souvent isoélectroniques.

Malgré une forte similitude chimique, les analogues structuraux ne sont pas nécessairement des analogues fonctionnels et peuvent avoir des propriétés physiques, chimiques, biochimiques ou pharmacologiques très différentes.

Lors de la découverte de médicaments, soit une grande série d’analogues structuraux d’un composé de plomb initial sont créés et testés dans le cadre d’une étude de la relation structure–activité, soit une base de données est filtrée pour rechercher des analogues structuraux d’un composé de plomb.

Des analogues chimiques de drogues illégales sont développés et vendus afin de contourner les lois. Ces substances sont souvent appelées médicaments de synthèse. Pour cette raison, les États-Unis ont adopté le Federal Analogue Act en 1986. Ce projet de loi interdit la production de tout analogue chimique d’une substance de l’annexe I ou de l’annexe II qui a des effets pharmacologiques essentiellement similaires, dans le but de la consommation humaine.