Chemical Entities of Biological Interest, auch bekannt als ChEBI, ist eine chemische Datenbank und Ontologie molekularer Entitäten, die sich auf ‚kleine‘ chemische Verbindungen konzentriert und Teil der Open Biomedical Ontologies (OBO) am European Bioinformatics Institute (EBI) ist. Der Begriff „molekulare Einheit“ bezieht sich auf jedes „konstitutionell oder isotopisch unterschiedliche Atom, Molekül, Ion, Ionenpaar, Radikal, Radikalion, Komplex, Konformer, etc., identifizierbar als separat unterscheidbare Einheit“. Die fraglichen molekularen Einheiten sind entweder Produkte der Natur oder synthetische Produkte, die potenzielle Bioaktivität haben. Moleküle, die direkt vom Genom kodiert werden, wie Nukleinsäuren, Proteine und Peptide, die durch proteolytische Spaltung von Proteinen abgeleitet sind, sind in der Regel nicht in ChEBI enthalten.

Chemische Einheiten von biologischem Interesse (ChEBI)

Content

Description

Chemical database

Data types
captured

Small chemical compounds

Contact

Research center

European Molecular Biology Laboratory

Laboratory

European Bioinformatics Institute

Primary citation

de Matos et al

Access

Website

www.ebi.ac.uk/chebi

Download URL

ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi

Web service URL

www.ebi.ac.uk/chebi/webServices.do

Sparql endpoint

BIO2RDF

Tools

Web

www.ebi.ac.uk/chebi

Verschiedenes

Datenfreigabe
Häufigkeit

monatlich

Kurationspolitik

Manuell kuratiert

ChEBI verwendet Nomenklatur, Symbolik und Terminologie, die von der Internationalen Union für reine und angewandte Chemie (IUPAC) und dem Nomenklaturausschuss der Internationalen Union für Biochemie und Molekularbiologie (NC-IUBMB) unterstützt werden.