enhed 731 blev specifikt oprettet af det japanske militær i Harbin, Kina (dengang en del af japansk-besatte Manchukuo) til at undersøge biologisk og kemisk krigsførelse ved at udføre menneskelig eksperimentering med mennesker i alle aldre. Under Anden kinesisk-japanske krig og senere Anden Verdenskrig, japanerne havde indkapslet byldepest, kolera, kopper, botulisme, miltbrandog andre sygdomme i bomber, som de rutinemæssigt blev kastet på kinesiske kombattanter og ikke-kombattanter. Ifølge 2002 International Symposium on the Crimes of Bacteriological krigsførelse, antallet af mennesker dræbt af den kejserlige japanske hær Kim krigsførelse og menneskelige eksperimenter var omkring 580.000.i løbet af de første par måneder af krigen mod USA efter angrebet på Pearl Harbor planlagde Japan at bruge biologiske våben mod amerikanere. Under Filippinerne kampagne i marts 1942 overvejede japanerne at frigive 90 kg (200 kg) pestbærende lopper (omkring 150 millioner insekter) i hvert af ti separate angreb, men amerikanerne overgav sig ved Bataan, før planen blev implementeret. Omkring November 1944 lancerede Japan i alt 9.300 brandbomber og antipersonelbomber båret af balloner, der var designet til at stige til 10.000 m (30.000 fod) og derefter blive fejet mod øst af jetstrømmen til det kontinentale USA. De dræbte seks amerikanske civile nær Bly, Oregon; styrtede ned på en gård i Medford, Oregon; og forårsagede en kortslutning i kraftledningerne, der leverer elektricitet til atomreaktorens kølepumper i Manhattanprojektets produktionsanlæg på Hanford-stedet. Et backup system gendannet strøm. Under Slaget ved Jima blev et andet biologisk angreb overvejet mod de invaderende amerikanere. Pilot Shoichi Matsumoto fortalte senere, hvordan to svævefly, der bærer patogener, skulle trækkes over slaget og frigives, men svæveflyene, der skulle starte fra det japanske fastland til Matsumotos flyveplads i Pingfang-distriktet som forberedelse til angrebet, nåede aldrig deres destination.