värdar-en databas över världens Lepidopteran Hostplants

e-post kommentarer, korrigeringar och tillägg till: Adrian Hine

programmering och gränssnitt av Mike Lowndes och Sven Loberg
datainmatning av författare och volontärer (se bekräftelser)

sök i databasen – introduktion och hjälp

  1. vad värdar innehåller
  2. hur man använder värdar
  3. utgången
  4. begränsningar och fel
  5. protokoll och nomenklatur
  6. mer i detalj – publikationer från värdar
  7. specialiserad data tillhandahållande
  8. Roll författare
  9. bekräftelser
  10. Citation
  11. bibliografi
  12. Internetresurser

1. Vad värdar innehåller

larv av euploea kärna

register över caterpillar hostplants är utspridda genom publicerade och manuskript källor över hela världen och är svåra att hämta. Många uppfödningsposter publiceras aldrig och är därför inte tillgängliga för andra entomologer. Men samlade hostplant-poster utgör en värdefull vetenskaplig resurs som så småningom kan användas för att svara på bredare biologiska frågor om hur Lepidoptera och växter interagerar (t.ex. Letourneau, Hagen & Robinson, 2001). Det ger information av omedelbar relevans för jordbruk, ekologi, skogsbruk, bevarande och taxonomi.

värdar samlar en enorm mängd information om vad världens fjäril och mal (Lepidoptera) larver äter. Den webbaserade versionen som presenteras här erbjuder en synoptisk datamängd ritad från cirka 180 000 poster som omfattar taxonomiskt ’rengjorda’ hostplantdata för cirka 22 000 Lepidoptera-arter ritade från cirka 1600 publicerade och manuskriptkällor. Det är inte (och kan inte vara) uttömmande, men det är förmodligen den bästa och mest omfattande sammanställningen av tillgängliga värdplantdata.

Vi hoppas att det kommer att vara användbart för ett brett spektrum av biologer och att det kommer att fungera som en sporre för ytterligare inspelning och analys av larv-växtinteraktioner.

2. Hur man använder värdar

värdar kan sökas på två sätt, med hjälp av textsökning och Drill-down söklägen.

i textsökningsläge, använd antingen Lepidoptera eller Hostplant kriterier eller en kombination av de två. Värdar fungerar endast med vetenskapliga namn. Det är inte möjligt att söka efter värdväxter av Red Admiral butterfly men en sökning efter värdväxter med sitt vetenskapliga namn, Vanessa atalanta, kommer att lyckas. Ange det generiska namnet (Vanessa) i rutan – Lepidoptera Criteria-Genus; ange atalanta i rutan Art:; klicka på SÖK.

tips: lämna kommandot ’börjar med’ som standard och i rutan Art entry utelämna de sista bokstäverna i artnamnet (t.ex. atalant). Detta kommer att komma runt problemet med variabla könsändringar. Värdar använder original ortografi av artgruppsnamn så långt som möjligt, men vissa checklistor följer konventionen om att ändra artgruppsnamnet för att överensstämma med det antagna könet för det generiska namnet (t.ex. flava, flavus).

begränsa eller förfina sökningar med hjälp av ytterligare kriterier; att välja ’ USA ’i listrutan och ange’ Urt ’ i rutan Hostplant Family returnerar hostplant-poster för Vanessa atalanta från Urticaceae i USA.

tips: att begränsa platsen kan leverera en mycket ofullständig delmängd av poster: i det föregående exemplet skulle alla poster som anges från Nearctic-regionen (USA + Kanada) missas.

Drill-down sökläge gör det möjligt för användaren att komma hem från startpunkten för antingen Lepidoptera eller växtfamiljen. Välj en familjegrupp i listrutan och ge tid för alla släkten i den familjen i databasen att ladda till listrutan Genus; välj ett släkte och vänta tills arten laddas. Sökknappen kan tryckas när som helst, men postleveransgränsen kan överskridas vid högre taxonomiska nivåer. Drill-down sökning tillåter användaren att se genom att bläddra alla taxa som är representerade i databasen.
Följ föregående exempel, välj Nymphalidae, välj sedan Vanessa från listrutan genus och sedan atalanta från de tio möjliga arterna av Vanessa som ingår i värdar.

3. Utgången

de preliminära sökresultatsidorna ger familj, släkt och arter av larven och dess värdväxt. Observera att många värdväxter registreras endast som ett växtsläkte. Om du klickar på caterpillar-namnet får du hela posten. Den fullständiga rekordlistan ger dessutom författaren till Lepidoptera-arten, subspecifik information om insekten och växten, om tillgänglig, tillsammans med detaljer om larvskador. Laboratorieuppfödningar där det använda livsmedlet kanske inte är den naturliga värdväxten anges. Statusen för posten (oavsett om den anses vara sann, felaktig eller misstänkt) är för närvarande inte implementerad i den här versionen av värdar.

förkortningar:

Leguminosae (C) – Caesalpinioideae.
Leguminosae (M) – Mimosoideae.
Leguminosae (P) – Papilionoideae.

4. Begränsningar och fel

begränsningar

alla Lepidoptera-grupper omfattas och underspecifika taxa differentieras. Den ursprungliga källan till posten, den ursprungliga formen av de namn som används (före taxonomisk rengöring och standardisering av nomenklaturen) och validerings-och verifieringsfält ingår inte. Denna information finns dock kvar i de databaser som används för att generera denna webbplats. Medan vi har inkluderat arter som inte matar på gröna växter, listas de kända matsubstraten av dessa inte uttömmande. Sådana arter innefattar detritofager och rovdjur och inkluderar till exempel de flesta Tineidae och de lagrade produkterna skadedjur.
de publicerade sammanställningar från värdar (se mer i detalj – publikationer från värdar) inkluderar poststatus och källorna till alla poster.

fel

de potentiella felkällorna i någon sammanställning av hostplant-poster som denna är mångfaldiga. Vid roten ligger felidentifiering av antingen växt eller insekt av den ursprungliga observatören eller inspelaren. Ytterligare fel kan uppstå vid transkription av poster. Förvirring kan uppstå mellan liknande eller identiska växt – och insektsnamn (t.ex. Aristotelia-Gelechiidae eller Elaeocarpaceae) eller en transkriberare kan förvirra liknande generiska namn som Asperugo (Boraginaceae) och asperula (Rubiaceae). Förvirring kan uppstå när sammanhanget är på ett språk som abstraktorn eller transkriberaren inte känner till. En historia som involverar synonymi eller felidentifiering som senare vänds kan resultera i att en helt giltig värdpost byts från en art till en annan.
det finns många register över Arctiidae (Lithosiinae) som tydligen matar på lövverk av kärlväxter. Lithosiinae är nu bara tänkt att beta epifytiska alger och algdelen av lavar (Rawlins, 1984; Kitching & Rawlins, 1999) och alla poster som hänvisar till kärlväxtvärdar är förmodligen Felaktiga, med hänvisning endast till utfodringsplatsen. Register över Lithosiinae från Mossor är lika misstänkta.register över vuxna Lepidoptera som matar på frukt eller blommor kan förväxlas med larval foodplant-poster och registreras som sådana i litteraturen – många händelser misstänks bland catocaline Noctuidae, till exempel.uppfödning av larver som erhållits från ägg från en fångad kvinna på en värdväxt som är acceptabel genom försök och fel kan leda till publicering av en värdpost som är felaktig genom att förhållandet är helt artificiellt. Sådana laboratorieuppställningar nämns inte alltid tydligt som sådana.
felaktiga hostplant-poster är kumulativa-upprepade citat ger dem en falsk auktoritet och de är extremt svåra att upptäcka och ta bort. Som fel ackumuleras, det finns en risk att’ buller ’ av olika felaktiga register kan utplåna en korrekt insekt-växt relation särskilt om detta är en enda observation på en ovanlig värdväxt.
mycket av den ursprungliga abstraktionen för detta arbete utfördes av frivilliga som inte kände till växt-och insektsnomenklaturen och osäker på betydelsen av vissa sammanhang. Manuskriptkällor var inte alltid helt läsbara. Så det finns potential för att ytterligare fel läggs till i abstraktionsprocessen. Således kan vi ha omedvetet upprepade felaktiga register här och vi har utan tvekan genererat några nya. Vi skulle uppskatta att bli informerade om bristerna. Samtidigt bör användarna vara medvetna om de fallgropar som är förknippade med att använda en sammanställning som denna.

larv av Lymantriidae, Malaysia

5. Protokoll och nomenklatur

för att förklara formatet och tillförlitligheten för de data som presenteras här, och den abstraktion och redigering som den har fått, behövs en kort beskrivning av databasen som används för att generera denna webbplats. Föräldravärdsdatabasen (se Robinson, 1999) är en’ platt ’ 23-fältsdatabas som för närvarande körs i Paradox bisexual V.4.5 (Corel). Fält för larven är ’släkt’, ’art’, ’underart’ och ’författare’; fält för växten är ’släkt’, ’art’ och ’underart’ (eller sort). Ytterligare fält som kan användas vid inledande abstraktion är en kort skadebeskrivning, ort, sekundär källa och datum (om de två sista anges). Ytterligare två fält används för att spela in om posten anses (av källans Författare, eller av andra inklusive oss) tveksamt eller inte, och om det är en fångenskap uppfödning. Många hobbyuppfödningar av de populära ’exotiska’ bombycoid-malarna faller i denna senare kategori. Fält för källa och datum fylls globalt.
i slutet av abstraktionsförfarandet kopieras insekts-och växtnamnen till fälten ’originalnamn’ och ’originalvärdnamn’ för att möjliggöra enkel hänvisning tillbaka till källan vid ett senare tillfälle, även om ett namn ändras drastiskt efter ytterligare studier.validering av Lepidoptera-namn börjar med att fylla familj-och underfamiljefälten från en relationsdatabas som härrör från generiska namn på Moths of the World (Nye, 1975 och efterföljande volymer); detta upptäcker felstavade generiska namn. Författare-namn på arter testas mot en standardlista och redigeras vid behov: författarnas namn förkortas om de inte passar inom fältgränsen på 17 tecken. Hela insektsnamnen (fyra fält) testas sedan mot en lista med aktuella namn (härledda från tidigare operationer) och om de inte valideras kontrolleras, ändras och uppdateras vid behov med hjälp av aktuella checklistor och databaser.
som den taxonomiska baslinjen för Lepidoptera i detta arbete har vi använt kortkatalogerna i Bmnh Lepidoptera-sektionen, vanligtvis uppdaterade till-i värsta fall-1982, kompletterat med nyare taxonomiska revideringar. Till exempel följer Sphingidae nomenklatur världens Hawkmoths: en kommenterad och illustrerad revisionär checklista (Kitching & Cadiou, 2000); Saturniidae nomenklatur följer en manuskriptlista utvecklad av Ian Kitching, Geometridae nomenklatur följer Scoble (1999); för fjärilarna (med undantag för Nymphalidae) har vi använt databaserna som utarbetats av den sena Charles A. Bridges. Artikel 34.2 i den internationella koden för Zoologisk nomenklatur (4: e edn) kräver ändring (’emendation’) av den ursprungliga stavningen av artgruppsnamn för att överensstämma med genusnamnet. Detta gör det svårt att effektivt manipulera namn i elektroniska databaser och introducerar potential för dubbelarbete. Könsavtal har nästan övergivits i moderna checklistor över Lepidoptera (t.ex. Nielsen et al., 1996; Scoble, 1999; Kitching & Cadiou, 2000). Av liknande skäl har vi inte parenteserat författarnas namn där den aktuella kombinationen skiljer sig från den ursprungliga beskrivningen.
den högre klassificeringen av Lepidoptera som antas här är konservativ. Nuvarande instabilitet på familje-och underfamiljenivåer i grupper som Yponomeutoidea och Gelechioidea gör det att föredra att ’klumpa’ små familje-eller underfamiljgrupper för att hjälpa till att återhämta sig. Detta har gjorts, särskilt i Cosmopterigidae och Yponomeutidae.Generisk nomenklatur och familjeplacering av växt taxa följer Brummitt (1992), och i värdar fylls växtfamiljfältet med en relationsdatabas som härrör från denna källa. Generiska namn på svampar, lavar och mossor tillskrivs inte familjer utan bara svampar, muski eller lavar.
familjenamnen på blommande växter som används är de välbekanta alternativen till ’-aceae’- avslutningarna, dvs.: Compositae (Asteraceae); Cruciferae (Brassicaceae); Gramineae (Poaceae); Guttiferae (Clusiaceae); Leguminosae (Fabaceae) (uppdelade i Leguminosae (C), Leguminosae (M) och Leguminosae (P); Labiatae (Lamiaceae); Palmae (Arecaceae) och Umbelliferae (Apiaceae).
Artgrupps-och sortväxtnamn har verifierats, redigerats och moderniserats vid behov med hjälp av den definitiva nordamerikanska checklistan av Kartesz (1994), tillsammans med en rad on-line resurser: Missouri Botanical Garden ’ s TROPICOS database, Flora Europaea, ILDIS Legume Web, Australian Plant Name Index och rbge Dipterocarpaceae database. Dessa kompletterades med publicerade resurser som Mabberley (1993) och nyligen floras eller, om inte dessa, Index Kewensis och dess senaste online-inkarnation som en del av IPNI. Ett växtnamn som endast finns i Index Kewensis är med all sannolikhet arkaiskt och sådana namn anges där de förekommer nedan.
registrerar att lista bara en växt släkte som värd (t.ex. Rosa), register som citerar en oidentifierad Art (Rosa sp.) och register som citerar flera ospecificerade arter (Rosa spp.) behandlas endast som generiska. Poster för vilka endast ett folkligt namn gavs som vi inte har kunnat identifiera ytterligare är uteslutna.
Vi har försökt att presentera uppgifterna nedan med hjälp av insekts-och växtnomenklatur som är enhetlig och samtida. Den högre klassificeringen som används för Lepidoptera är dock avsedd att vara funktionell snarare än förvirrande eller omtvistad.

6. Mer detaljer – publikationer från värdar

detaljerade publicerade sammanställningar från värdar finns i press. Dessa böcker ger större detaljer än webbplatsen, tillsammans med omfattande korsindex, rekordstatus och fullständiga bibliografier. De är oumbärliga verktyg för naturforskare och professionella entomologer.

Robinson, G. S., Ackery, P. R., Kitching, I. J., Beccaloni, G. W. & Hern Askorndez, L. M. 2001. Värdväxter av moth och fjäril larver i den orientaliska regionen. 744 s.

Robinson, G. S., Ackery, P. R., Kitching, I. J., Beccaloni, G. W. & Hern Askorndez, L. M. 2002. Värdväxter av moth och fjäril larver i Amerika norr om Mexiko. 824 s.

Beccaloni, G. W., Viloria, A. L., Hall,S. K. & Robinson, G. S. 2008. Katalog över Värdplanterna för de neotropiska fjärilarna. m3m-monografier tredje årtusendet, Volym 8. Zaragoza, Spanien: Sociedad Entomol Occurgica Aragonesa (SEA) / Red Iberoamericana de Biogeograf Occuba y entomolog Occuba Sistem Occurtica (RIBES) / Ciencia y tecnolog Occura para el Desarrollo (CYTED) / Natural History Museum, London, Storbritannien. (NHM)/Instituto Venezolano de Investigaciones cient Brasilificas, Venezuela (IVIC). 1-536 pp., 1 fig, 3 flikar.

8. Roll författare

Gaden Robinson var ansvarig för den övergripande projektdesign och hantering av värdar databasen, och för register över Lepidoptera exklusive fjärilar och bombycoid malar. Phillip Ackery och George Beccaloni var ansvariga för fjärilsdata, inklusive data hämtade från kortkataloger utvecklade av Ackery, medan Ian Kitching var ansvarig för värdplantdata för bombycoidmoths. Luis M. Hern ubicndez var ansvarig för abstraktion under de senare två åren av projektet och för utveckling av bibliografin för pappersversionerna av data.

9. Bekräftelser

Vi är oerhört tacksamma för de många människor som bidragit med sina egna uppfödningsregister över Lepidoptera eller personliga ansamlingar av data för inkludering i värddatabasen, särskilt Mike Bigger (UK), John W. Brown (USA), Chris Conlan (USA), Rob Ferber (USA), Konrad Fiedler (Tyskland), Jeremy Holloway (Storbritannien), Frank Hsu (USA), Jurie Intachat (Malaysia), Alec McClay (Kanada), Bill Palmer (Australien), Pierre Plauzoles (USA) och de generösa individer som bidragit uppfödning poster via WorldWideWeb och som är kända för oss endast som en e-postadress.

Vi är särskilt tacksamma till Julian Donahue och Los Angeles County Museum of Natural History för att tillåta oss att inkludera data om Microlepidoptera från kortkatalogen som utarbetats av den sena J. A. Comstock och C. Henne, och för tillgång till manuskriptposter av Noel McFarland.Marian Fricano (Santa Clara University) och Aileen Giovanello (Clark University, international internship 1996) gjorde betydande bidrag av abstraherade data; Fran Love (North Carolina) kontrollerade noggrant skannade texter och omformaterade dem för import till Paradox.mycket av den enorma uppgiften att abstrahera och skriva in data från tryckta och manuskriptkällor samt preliminär redigering och namnkontroll utfördes av volontärer. Många av dessa var skolelever på praktikplatser under 1993-2000 från början Coopers ’ Company och Coborn School, Upminster, och senare från andra skolor i Greater London: Christopher Andrewes, Simon Bennett (1994 NHM vacation studentship), Steven Bond, Michael Brownlow, Emma Causer, Laurence Cooper, Ailsa Cranfield (1998 Nuffield Studentship), Emily Dwiar, Andrew Enever, Jane Feehan, Madeleine Ferry, Max Friedman, Edward Gold, Jennifer Hodgkinson, Christopher Joint, Fateha Khatun (1996 Nuffield Studentship), James Lowe, Louisa Marchant, Gemma Millward, Christopher Milne, han är en av de mest kända och mest kända i världen.

Vi står i skuld till alla våra hjälpare för deras flit, noggrannhet och tålamod, och för deras orubbliga tro på att detta skrämmande projekt skulle nå en slutsats.

våra kollegor här och utomlands gav betydande hjälp, råd och hjälp med kontrollen av namnen på Lepidoptera och med många andra aspekter av detta projekt: Kim och David Goodger och Jeremy Holloway (Macrolepidoptera familjer), Martin honung (Noctuoidea), Brian Pitkin (computing), Malcolm Scoble och Linda Pitkin (Geometroidea), Klaus Sattler (Gelechioidea), Michael Shaffer (Pyraloidea, Thyridoidea, Pterophoroidea), Alma Solis (USDA, Washington – Pyraloidea), Fernley Symons (Oxford University – teknisk support) och Kevin Tuck (Tortricoidea). Julie Harvey och personalen vid BMNH Entomology and general libraries gav ett gediget stöd för att hitta dunkelt källmaterial och intuitivt korrigera bowdleriserade referenser.

Vi tackar förvaltarna av Loke Wan Tho Memorial Foundation för deras generösa stöd för detta projekt.

10. Citation

Robinson, G. S., P. R. Ackery, I. J. Kitching, G. W. Beccaloni & L. M. Hern Portugalndez, 2010. Värdar-en databas över världens Lepidopteran värdväxter. Naturhistoriska Museet, London. http://www.nhm.ac.uk/hosts. (Åtkomst: 18 Aug.2010).

11. Bibliografi

Brummitt, R. K. 1992. Kärlväxter familjer och släkten. + 804 pp. Kungliga Botaniska Trädgården, Kew.

Kartesz, J. T. 1994. En synonymiserad checklista över Kärlfloran i Förenta staterna, Kanada och Grönland. Timber Press, Portland. 1, checklista , lxi + 622 s. 2, tesaurus, vii + 816 s.

Kitching, I. J. & Cadiou, J.-M. 2000. Hawkmoths of the world: en kommenterad och illustrerad revsionär checklista. xx + 500 s. Cornell University Press, Ithaca.

Kitching, I. J. & Rawlins, J. E. 1999. Den Noctuoidea. Pp. 355-401. I: Kristensen, N. P. (Red.) Lepidoptera, malar och fjärilar. 1. Evolution, systematik och biogeografi. Handbok för zoologi, 4 (35). Lepidoptera. x + 491 pp. de Gruyter, Berlin.

Letourneau, D. K., Hagen, J. A. & Robinson, G. S. 2001. BT-grödor: utvärdering av fördelar under odling och risker från flyktiga transgener i naturen. Pp. 33-98. I: Letourneau, D. K. & Burrows, B. E. (eds), genetiskt modifierade organismer: bedömning av miljö-och människors hälsoeffekter. + 438 sidor., CRC Press, Boca Raton.

Mabberley, D. J. 1987. Växtboken. En bärbar ordbok över de högre växterna. xii + 707 s., Cambridge University Press.

Nielsen, E. S., Edwards, E. D. & Rangsi, T.V. (eds) 1996. Checklist of the Lepidoptera of Australia. Monographs on Australian Lepidoptera. 4. xiv + 529 pp., CSIRO, Melbourne.

Nye, I.W.B. (ed.) 1975-91. The generic names of moths of the world. 1: 568 pp. (Noctuoidea (part) – Nye, I.W.B., 1975); 2: xiv + 228 pp. (Noctuoidea (part) – Watson, A., Fletcher, D.S. & Nye, I.W.B., 1980); 3: xx + 243 pp. (Geometroidea – Fletcher, D.S., 1979); 4: xiv + 192 pp. (Bombycoidea to Zygaenoidea – Fletcher, D.S. & Nye, I.W.B., 1982); 5: xv + 185 pp. (Pyraloidea-Fletcher, D. S. & Nye, 1984); 6: xxix + 368 s. (Microlepidoptera-Nye, I. W. B. & Fletcher, D. S., 1991). British Museum (Naturhistoria) / Naturhistoriska Museet, London.

Rawlins, J. E. 1984. Mykofagi i Lepidoptera. Pp. 382-483. I: Wheeler, Q. & Blackwell, M. (Red) svamp-insekt relationer. Perspektiv inom ekologi och evolution. 514 s. Från Columbia University Press.

Robinson, G. S. 1999. Värdar-en databas över värdenväxter av världens Lepidoptera. Nota Lepidopterologica, 22: 35-47.

Robinson, G. S., Ackery, P. R., Kitching, I. J., Beccaloni, G. W. & Hern Askorndez, L. M. 2001. Värdväxter av moth och fjäril larver i den orientaliska regionen. 744 s. Southdene Sdn Bhd, Kuala Lumpur.

Robinson, G. S., Ackery, P. R., Kitching, I. J., Beccaloni, G. W. & Hern Askorndez, L. M. 2002. Värdväxter av moth och fjäril larver i Amerika norr om Mexiko. Memoarer från American Entomological Institute, 69: 1-824.

Scoble, M. J. (Red.) 1999. En taxonomisk katalog till världens Geometridae (Insecta: Lepidoptera). 2 vols. CSIRO Publications, Melbourne.

12.INTERNET RESOURCES:

Caterpillars: especially Australian ones:
http://lepidoptera.butterflyhouse.com.au/

Electronic Resources on Lepidoptera:
http://www.chebucto.ns.ca/Environment/NHR/lepidoptera.html

Flora Europaea:
http://rbg-web2.rbge.org.uk/FE/fe.html

Global Tineidae database:
http://www.nhm.ac.uk/entomology/tineidae/index.html

International Plant Names Index (incorporateing Index Kewensis, The Gray Card Index and the Australian Plant Name Index):
http://www.ipni.org/index.html

LegumeWeb – the ILDIS World Database of Legumes:
http://www.ildis.org/LegumeWeb/

Life hierarchy – Markku Savela’s Lepidoptera database (includes hostplant data):
http://www.funet.fi/pub/sci/bio/life/insecta/lepidoptera/index.html

Missouri Botanical Garden’s VAST (VAScular Tropicos) nomenclatural database:
http://mobot.mobot.org/W3T/Search/vast.html

Butterflies and Moths of North America:
http://www.butterfliesandmoths.org

Royal Botanic Garden Edinburgh Dipterocarpaceae database:
http://193.62.154.38/diptero/

Web Images of North American Moth Species:
http://facweb.furman.edu/~snyderjohn/leplist/

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.