de fysiska och kemiska barriärerna som förhindrar patogener från att komma in i våra kroppsvävnader i första hand förbises ofta. Som Figur 1 visar är den mest omfattande barriären det vattentäta hudskiktet som täcker kroppens yta. Mänsklig hud håller de flesta patogener ute så länge den förblir intakt. Hastigheten med vilken ett snitt eller bete kan smittas är en påminnelse om det skydd vi normalt får från vår hud.
vektorburna infektioner (t.ex. malaria) överförs genom att bita ryggradslösa djur (t. ex. myggor) tränger in i huden när man tar en blodmjöl. Människor är också sårbara för invasion av patogener i luften, mat, vatten och jord, eller under fysisk kontakt med smittade människor, vissa djur (t. ex. svin, hundar, fjäderfä) eller deras avföring. Som Figur 1 illustrerar är andningsorganets inre yta (näsa, hals, luftvägar och lungor), mage, tarmar, urinblåsa och reproduktionsorgan fodrade med membran som utsöndrar gelliknande slem och presenterar en barriär mot patogener som kommer in i våra vävnader via dessa vägar. Mikroskopiska hårstrån som kallas cilier linje andningsorganen och’ slå ’ unisont att shunt slem som innehåller fångade patogener mot näsan och munnen, där de kan utvisas genom hosta och nysningar, eller sväljas in i magen där syra förstör dem.
Figur 1 avser konkurrens från kommensala bakterier (ibland kallad ’vänliga bakterier’) i tarmen och reproduktionssystemet. Commensal bakterier är icke-patogena invånare i tarmen och reproduktionssystemet. De upptar utrymme som annars skulle kunna koloniseras av patogena arter, och de använder näringsämnen för sin egen tillväxt, vilket minskar de resurser som finns tillgängliga för patogener att föröka sig och orsaka sjukdom.
kemiska barriärer mot infektion inkluderar enzymer i tårar, saliv och slem som bryter ner bakteriens yta. Syran i svett och i magen dödar cellulära patogener och det finns antibakteriella proteiner i sperma (vätskan som innehåller manlig sperma).
de mer komplexa mekanismerna i immunsystemet behövs bara om patogener bryter mot dessa fysiska och kemiska barriärer.