kemiska enheter av biologiskt intresse, även känd som ChEBI, är en kemisk databas och ontologi av molekylära enheter fokuserade på ’små’ kemiska föreningar, som är en del av Open Biomedical Ontologies (OBO) ansträngning vid European Bioinformatics Institute (EBI). Termen ” molekylär enhet ”avser någon” konstitutionellt eller isotopiskt distinkt atom, molekyl, Jon, jonpar, radikal, radikal Jon, komplex, konformer, etc., identifierbar som en separat urskiljbar enhet”. De molekylära enheterna i fråga är antingen produkter av natur eller syntetiska produkter som har potentiell bioaktivitet. Molekyler som direkt kodas av genomet, såsom nukleinsyror, proteiner och peptider härledda från proteiner genom proteolytisk klyvning, ingår som regel inte i ChEBI.

kemiska enheter av biologiskt intresse (ChEBI)

Content

Description

Chemical database

Data types
captured

Small chemical compounds

Contact

Research center

European Molecular Biology Laboratory

Laboratory

European Bioinformatics Institute

Primary citation

de Matos et al

Access

Website

www.ebi.ac.uk/chebi

Download URL

ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi

Web service URL

www.ebi.ac.uk/chebi/webServices.do

Sparql endpoint

BIO2RDF

Tools

Web

www.ebi.ac.uk/chebi

Diverse

data release
frekvens

månadsvis

Curation policy

manuellt curated

chebi använder nomenklatur, symbolik och terminologi som godkänts av International Union of pure and Applied Chemistry (IUPAC) och nomenklaturutskottet för International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-iubmb).