Charles McBurney föddes 1845. Han tog examen i konsten från Harvard College 1866 och kvalificerade sig i medicin vid College of Physicians and Surgeons Of Columbia University i New York City med en MD 1870. Han tränade vidare i Europa i 2 år och började träna i New York 1873. Han blev assisterande kirurg vid Bellevue Hospital 1880 och chefskirurg för Roosevelt Hospital (nu Mount Sinai West) 1888. Här gjorde han sitt mest kända arbete med appendicit och presenterade sin rapport om operativ ledning till New York Surgical Society 1889. Han beskrev punkten med största ömhet i blindtarmsinflammation, som nu kallas Mcburneys punkt. Han var professor i kirurgi från 1889 till 1907 och blev därefter emeritus professor i kirurgi. Han fortsatte att främja behandlingen av blindtarmsinflammation, och 1894 beskrev han snittet som han använde; även om snittet tidigare hade beskrivits av Louis L. MacArthur, blev det känt som Mcburneys snitt. Han tilldelades ett hedersstipendium av Royal College of Surgeons of Edinburgh 1905 under högskolans 400-årsjubileum. Honorary fellowship tilldelades de 36 mest kända kirurgerna av tiden.
förutom sitt arbete med blindtarmsinflammation publicerade McBurney också artiklar om behandling av pylorisk stenos, hantering av axelförskjutning med fraktur av humerus och gallstenssjukdom. Han introducerade också användningen av gummihandskar under sin verksamhet för att förbättra aseptisk teknik, efter ledning av William Halsted.efter att USA: s President William McKinley sköts den 6 September 1901 ledde Dr.McBurney det medicinska teamet som övervakade hans återhämtning efter akutoperation och meddelade pressen den 10 September att presidentens tillstånd förbättrades och att han var ute av fara.
Han var en ivrig jägare och fiskare och dog 1913 på en jakttur i Massachusetts.
hans sonson var amerikansk arkeolog Charles McBurney och hans barnbarnsbarn är engelsk skådespelare, författare och regissör Simon McBurney.