după izbucnirea războiului, când trupele georgiene au intrat în Abhazia în August 1992, Confederația a ținut cea de-a 11-a sesiune parlamentară la Grozny. Un scop clar al înființării acestei organizații a devenit evident după această sesiune. Confederația a creat detașamente de asalt de voluntari care au fost ulterior dislocate în Abhazia în timpul războiului. Confederația a strâns aproximativ 1.500 de voluntari, dintre care jumătate din Cecenia. De asemenea, s-a raportat că notorietatul războinic cecen Shamil Basayev a devenit comandant al forțelor CMPC în 1992.
președintele Confederației, Musa Shanibov, și președintele Parlamentului, Iysuph Soslanbekov, au făcut o declarație oficială:
„deoarece nu există altă modalitate de a retrage armata ocupanților georgieni de pe teritoriul Abhaziei suverane și pentru a pune în aplicare rezoluția celei de-a 10-A sesiuni a CMPC, ordonăm retragerea armatei georgiene de pe teritoriul Abhaziei suverane:
- toate sediile Confederației trebuie să trimită voluntari pe teritoriul Abhaziei pentru a prăbuși agresorul militar.
- toate formațiunile militare ale Confederației trebuie să desfășoare acțiuni militare împotriva oricăror forțe care li se opun și să încerce să ajungă pe teritoriul Abhaziei prin orice metodă.
- să anunțe Tbilisi ca zonă de dezastru. La care folosesc toate metodele, inclusiv acte teroriste.
- să declare toți oamenii de etnie georgiană de pe teritoriul Confederației ca ostatici.
- toate tipurile de mărfuri direcționate către Georgia sunt reținute.”
sediul central al Confederației, condus de Yusup Soslanbekov, fusese însărcinat cu implementarea măsurilor practice împotriva”dușmanilor poporului abhazian”. Forțele CMPC au luat parte la operațiunea de asalt din Gagra, unde au fost uciși sute de civili.
pe 3 octombrie, formațiunile Abhaziene și Confederate au lansat un atac la scară largă asupra satelor Kamani și Shroma (lângă râul Gumista) care a fost respins de forțele georgiene.
Sukhumi MassacreEdit
la 27 septembrie 1993, partea abhază a încălcat acordul de încetare a focului mediat de ONU (partea georgiană a fost de acord să scoată toate artileria grea și tancurile din Sukhumi în schimbul unei încetări a focului) prin asaltul Sukhumi fără apărare. Confederații s-au mutat în Sukhumi și au început să măture pe străzile orașului. Pe măsură ce orașul a fost cuprins de lupte grele, civilii s-au refugiat în case abandonate și clădiri de apartamente. Unii dintre civilii de etnie georgiană au fost masacrați după descoperirea lor de către confederați. Până după-amiaza târziu, restul trupelor georgiene s-au predat părții abhaze. Majoritatea prizonierilor georgieni au fost executați în aceeași zi de formațiunile și confederații abhazi. Puțini civili și personal militar au reușit să supraviețuiască masacrului. Masacrul a continuat timp de două săptămâni după căderea Sukhumi (vezi epurarea etnică a Georgienilor din Abhazia).