Dr.Chagas Filho a jucat un rol semnificativ ca lider internațional și reprezentant al științei braziliene în străinătate. A fost delegat și ambasador Brazilian (1966) la UNESCO la Paris și membru al Consiliului de Cercetare al Organizației Panamericane de sănătate (PAHO), în Washington, DC. La Națiunile Unite a fost președinte al Comitetului Special pentru aplicarea științei și tehnologiei pentru Dezvoltare. Împreună cu câștigătorul Premiului Nobel, fizicianul Abdus Salam (1926-1996), a fondat Federația Internațională a Institutelor pentru științe avansate (IFIAS).în 1972, a fost numit de Papa Paul al VI-lea la președinția Academiei Pontificale de științe, pe care a ocupat-o până în 1989. În timpul mandatului său, s-a distins cu sarcina istorică de reabilitare Galileo Galilei de către Biserica Romano-Catolică și cu coordonarea unui studiu al valabilității istorice și științifice a Giulgiului din Torino. El a fost profund religios și a căutat să reconcilieze știința și religia cât mai bine posibil. Astfel, el a condus Academia de științe printr-o serie de întâlniri și publicații importante, examinând probleme controversate precum creierul și conștiința și atrăgând mari personalități științifice în Academie, inclusiv un număr de laureați ai Premiului Nobel.
în Brazilia a fost membru, vicepreședinte și președinte al Academiei braziliene de științe (1941-2000) și membru al Academiei braziliene de Litere (1974-2000), membru al Consiliului Național de cercetare și unul dintre fondatorii și membru al Societății braziliene pentru progresul științei.Carlos Chagas Filho a fost distins cu 16 titluri de Doctor Honoris Causa în multe universități naționale și străine și 19 decorații, inclusiv cea a l-Centigion d ‘ Honneur (1979) și Ordinul Brazilian al Meritului științific. A fost membru al Academiei Franceze de științe și al Academiei Naționale de științe a Franței, al Academiei Americane de Arte și științe, al Academiei Americane de Filosofie, al Academiei Regale din Belgia, al Academiei Române de științe și al Academiei Internaționale de Istorie a științelor.
printre numeroasele sale premii științifice, a primit Premiul pentru știință Moinho Santista (1960); PR-ul Inktimio Inktlvaro Alberto para a ci Inktincncia e Tecnologia (1988); și Prix mondial Cino Del Duca, de Fundația Simone et Cino Del Duca, Franța (1989).
