ChEBI

entidades químicas de interesse biológico, também conhecido como ChEBI, é uma base de dados química e ontologia de entidades moleculares focadas em compostos químicos “pequenos”, que faz parte do esforço aberto de ontologias Biomédicas (OBO) no Instituto Europeu de Bioinformática (EBI). O termo “entidade molecular “refere-se a qualquer” átomo constitucionalmente ou isotopicamente distinto, molécula, íon, par de íons, RADical, íon radical, complexo, conformador, etc., identificável como uma entidade distinguível separadamente”. As entidades moleculares em questão são produtos da natureza ou produtos sintéticos que têm potencial bioactividade. Moléculas diretamente codificadas pelo genoma, tais como ácidos nucleicos, proteínas e peptídeos derivados de proteínas por clivagem proteolítica, não são, como regra, incluídas no ChEBI.

Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI)

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Content

Description

Chemical database

Data types
captured

Small chemical compounds

Contact

Research center

European Molecular Biology Laboratory European Union

Laboratory

European Bioinformatics Institute United Kingdom

Primary citation

de Matos et al

Access

Website

www.ebi.ac.uk/chebi

Download URL

ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi

Web service URL

www.ebi.ac.uk/chebi/webServices.do

Sparql endpoint

BIO2RDF

Tools

Web

www.ebi.ac.reino unido/chebi

Diversos

lançamento de Dados
frequência

mensal

Curadoria de diretiva

Manualmente, com curadoria

ChEBI usa a nomenclatura, simbologia e terminologia endossada pela União Internacional de Química Pura e Aplicada (IUPAC) e o comitê de nomenclatura da União Internacional de Bioquímica e Biologia Molecular (NC-IUBMB).

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