Poly[N]catenanes: synteza molekularnych łańcuchów połączonych

trochę cynku sprawia, że pierścienie wszystkie ogniwa

chociaż nici polimerowe są często nieformalnie nazywane łańcuchami, topologie molekularne, które faktycznie przypominają rozszerzone makroskopowe ogniwa łańcuchowe, okazały się zaskakująco trudne do wykonania. Większość podejść osiedliła się na uwięzi pary połączonych pierścieni wśród segmentów dystansowych. Wu et al. teraz zgłoś pomyślną syntezę polikatenanów, w których dziesiątki pierścieni są kolejno ze sobą powiązane. Kluczem było użycie jonów cynku do szablonu gwintowania jednego prekursora makrocyklu przez flankowanie wstępnie uformowanych makrocykli, po czym kataliza metatezy zamknęła pierwszy pierścień, a metal mógł zostać wypłukany.

Science, this issue P. 1434

Streszczenie

jako makromolekularna wersja mechanicznie blokowanych cząsteczek, mechanicznie blokowane polimery są obiecującymi kandydatami do tworzenia wyrafinowanych maszyn molekularnych i inteligentnych miękkich materiałów. Polikatenany, gdzie łańcuchy molekularne składają się wyłącznie z makrocykli, zawierają jedno z najwyższych stężeń wiązań topologicznych. Przedstawiamy tutaj syntetyczne podejście do tej charakterystycznej architektury polimerów o wysokiej wydajności (~75%) poprzez skuteczne zamykanie pierścieni racjonalnie zaprojektowanych polimerów metalosupramolekularnych. Rozpraszanie światła, spektrometria mas i magnetyczny rezonans jądrowy charakterystyka frakcjonowanych próbek wspierają przypisanie produktu o wysokiej masie molowej (liczba-średnia Masa molowa ~21.4 kilogramy na mol) do mieszaniny polikatenanów liniowych, polikatenanów rozgałęzionych i polikatenanów cyklicznych. Po metalizacji Zn2 + zaobserwowano zwiększony promień hydrodynamiczny (w roztworze) i temperaturę zeszklenia (w materiałach sypkich).

cząsteczki mechanicznie sprzężone (Mims), takie jak katenany, rotaksany i węzły, przyciągają coraz większą uwagę ze względu na ich estetyczne struktury topologiczne (1-3) i ich potencjał w zastosowaniach od maszyn molekularnych (4) do katalizy (5), dostarczania leków (6) i powierzchni przełączalnych (7). Imponujący zestaw małocząsteczkowych mimów został z powodzeniem zsyntetyzowany, głównie poprzez właściwą orientację składników prekursorowych za pomocą niekowalentnego zdarzenia szablonowego, które wykorzystuje, na przykład, Metal-ligand (1, 2, 8-10), akceptor-dawca (11) lub wiązanie wodorowe (12) lub efekt hydrofobowy (3), a następnie kowalencyjny etap mocowania. Mims o wysokiej masie molowej lub mechanicznie blokowane polimery (MIP), takie jak polirotaksany i polikatenany, oferują dostęp do użytecznych właściwości dla funkcjonalnych platform z miękkimi materiałami (13). Być może najbardziej godnym uwagi przykładem do tej pory są żele z pierścieniami ślizgowymi (podzbiór polirotaksanów), w których mechanicznie połączone pierścienie działają jako mobilne miejsca sieciowania. Materiały te wykazują właściwości zapobiegające zarysowaniom i gojeniu i zostały z powodzeniem zastosowane jako powłoki zapobiegające zarysowaniom w telefonach komórkowych i samochodach (14). Jak podkreśla ten przykład, nietypowe elementy mobilności w MIPs (np., niskoenergetyczna bariera do przesuwania pierścienia wzdłuż gwintu lub obracania pierścieni) czynią z nich wyspecjalizowaną klasę polimerów, o potencjale wykazania bardzo nietypowej matrycy właściwości.

Katenany składają się z N kolejno zazębiających się pierścieni. Polikatenany są łańcuchami polimerowymi składającymi się w całości z połączonych ze sobą pierścieni i można je traktować jako katenany, dla których N jest duże i generalnie dyspersja > 1. Te połączone polimery zawierają bardzo wysokie stężenie wiązań topologicznych i mogą być uważane za molekularny odpowiednik łańcucha makroskopowego (Fig. 1a). Takie konstrukcje zachowują swoją elastyczność bez względu na sztywność ich elementów pierścieniowych ze względu na mobilność konformacyjną ich struktur topologicznych, umożliwiając dostęp zarówno do wysokiej wytrzymałości, jak i doskonałej elastyczności. Rysunek 1B przedstawia główne ruchomości konformacyjne (ruchy obrotowe, wydłużające i kołyszące) w jednostce powtórzeń szkieletu takiego łańcucha dla odpowiednich rozmiarów pierścieni (13). Badania teoretyczne sugerują, że polikatenany z takimi elementami mobilności mogą wykazywać duży moduł strat i niską energię aktywacji dla przepływu i mogą potencjalnie działać jako lepsze materiały tłumiące energię i / lub elastomery o doskonałej wytrzymałości i właściwościach mechanicznych reagujących na bodźce (13, 15, 16).

rys. 1 Struktura i mobilność konformacyjna i syntetyczne podejście do polikatenanów.

(A) Schematyczne przedstawienie architektury polikatenanu, które można uznać za molekularny odpowiednik wytrzymałego i elastycznego łańcucha metalowego . B) wspólne ruchy konformacyjne obserwowane w katenanach. C) porównanie ruchomości obrotowych pierścienia w poli (catenane) w porównaniu z polikatenanem. D) ukierunkowana synteza polikatenanu 3 poprzez Połączenie 1 i 2 w POLIMER metalosupramolekularny (MSP), a następnie zamknięcie pierścienia w celu uzyskania polikatenanu (tj. metalizowanego polikatenanu) i demetalację. E) Struktura 1, 2 i 4 (iloczyn pierścieniowy 1). Kilka kluczowych protonów jest oznaczonych niebieskimi dużymi literami W 4 i czerwonymi małymi literami W 2. Ramka podkreśla strukturę grupy ligandowej Bip.

synteza polikatenanów stanowi jednak poważne wyzwanie. Potwierdzona synteza tych polimerowych topologii o dużej masie molowej nie została jeszcze zgłoszona. Większość wcześniejszych prac nad polikatenanami koncentrowała się na poli(katenanie)s (ogólnie dostępnym przez polimeryzację bisfunkcjonalizowanego katenanu) (15, 17-23), Poli-i oligokatenanach o nieostrożnie zdefiniowanej architekturze (24, 25) i polimerowych katenanach (tj. dwóch połączonych cyklicznych polimerów) (26). Materiały te dały wgląd w potencjalnie użyteczne właściwości MIP. Na przykład, Poli(catenane)s wykazują elastyczność konformacyjną wzdłuż łańcucha polimeru w roztworze (na co wskazuje długość segmentu Kuhna, która jest krótsza niż długość jego ugrupowania catenane) (15) i zależny od temperatury ruch pierścieni w roztworze (18) lub w materiałach sypkich (22). Jednak ze względu na kowalencyjne jednostki łączące obecne w kręgosłupie Poli(catenane) stopień rotacji elementów pierścieniowych w ugrupowaniach catenane jest ograniczony (Fig. 1C). Z drugiej strony polikatenany mają pierścienie połączone wyłącznie wiązaniami topologicznymi, umożliwiając pełną mobilność obrotową każdego pierścienia (przy wystarczającej wielkości pierścienia) i jako takie powinny wykazywać większą elastyczność konformacyjną. Jedną z najbardziej udanych prób dostępu do oligokatenanów z co najmniej siedmioma połączonymi pierścieniami była niedawno przeprowadzona przez Meijera, Di Stefano i współpracowników polimeryzacja metalokatenanów z otwarciem pierścienia (25). Specyficzna Architektura produktu nie mogła być jednak jasno określona. Do tej pory najdłuższym połączonym łańcuchem molekularnym o jasno określonej strukturze jest liniowy catenane (olympiadane) zgłoszony przez Stoddarta i współpracowników (27), a ostatnio przez Iwamoto et al. (28), zarówno poprzez stopniowe podejścia. Stoddart i współpracownicy również zastosowali podobną strategię dostępu do rozgałęzionego catenane (29). Te etapowe strategie nie są jednak skutecznymi metodykami syntezy długołańcuchowych polikatenanów. Jednym z kluczowych wyzwań w syntezie polikatenanów są sprzeczne warunki reakcji dostępu do makrocykli (wymagające niskiego stężenia) i polimerów (wymagające wysokiego stężenia). Takata, Kihara i współpracownicy zaproponowali eleganckie rozwiązanie tego konfliktu, przekształcając mostkowany Poli (catenane) w polikatenan (20), ale do tej pory nie ma doniesień o polikatenanie zsyntetyzowanym tą drogą.

syntetyczna strategia wobec polikatenanów przedstawiona w niniejszym dokumencie i zilustrowana na Fig. 1D, ma na celu oddzielenie wyżej wymienionych sprzecznych wymagań syntetycznych poprzez wstępny montaż polimeru metalosupramolekularnego (MSP) jako szablonu, a następnie skuteczną reakcję zamykania pierścienia i demetalację otrzymanego metalizowanego polikatenanu. Zapoczątkowana przez Sauvage ’ a i współpracowników, koordynacja metal-ligand była jedną z najbardziej udanych syntetycznych dróg w kierunku MIMs (1, 2, 8, 9). Ligand terdentanu, 2,6-bis (N-alkilo-benzimidazolilo) pirydyna (BIP) (Fig. 1e), który wiąże jony metali przejściowych, takie jak Zn2+ lub Fe2+ w 2:1 Stechiometria została wybrana, ponieważ wykazano, że ma dostęp do szerokiego wyboru funkcjonalnych polimerów metalosupramolekularnych, które wykazują właściwości fotooddrawiające (30), reagujące na bodźce (31), pamięć kształtu (32) i właściwości uruchamiające (33). Ponadto niedawno wykazaliśmy, że katenany można uzyskać poprzez prawie ilościową reakcję zamykania pierścienia pseudorotaksanu zmontowanego z monotopowego makrocyklu zawierającego Bip, Zn2+ i nitki ditopowej (1 Z R = heksylem) w stosunku 2:2:1 (9).

opierając się na tych badaniach, skierowaliśmy na montaż MSP racjonalnie zaprojektowanego 68-członowego ditopowego makrocyklu Bip 2 z cząsteczką gwintującą 1 i późniejszym zamknięciem pierścienia 1 (Fig. 1e). Po dodaniu 2 odpowiedników Zn2+ do mieszaniny 1: 1 i 2, składniki samoskładały się w naprzemienny kopolimer supramolekularny . Zmiana jest konsekwencją Zasady maksymalnego zajętości obiektu (34): dwie grupy Bip w tym samym (lub innym) makrocyklu 2 nie mogą wiązać tego samego jonu Zn2+; dlatego każda jednostka Bip w 2 musi tworzyć Bip 2:1:Kompleks jonowy Zn2+ z jednostką Bip w 1 W Celu maksymalizacji wzmocnienia entalpicznego (rys. S2). Powstawanie MSP zostało potwierdzone za pomocą spektroskopii uporządkowanej dyfuzyjnie (dosy) (fig. S3). Duża stała wiązania (>106 m–1 w acetonitrylu) między Bip i Zn2+ (35) utrzymuje MSP w stosunkowo rozcieńczonych warunkach wymaganych do sprzyjania reakcji zamykania pierścienia (chociaż cykliczne MSP powinny być preferowane w bardzo rozcieńczonych warunkach). Reakcja metatezy zamykającej pierścień wykazała doskonałą konwersję olefin przy 2,5 mM (w odniesieniu do 1) (fig. S4), a otrzymaną mieszaninę reakcyjną można łatwo demetalować wodorotlenkiem tetrabutyloamonu. 2A przedstawia porównanie częściowego widma 1H NMR zdemetalowanego surowego produktu (skupiając się na protonach pirydylowych HA/a) ze wszystkimi możliwymi nieinterlockowanymi produktami ubocznymi 4 (makrocykl otrzymany z 1), 2 i 5 . Większość pików HA / a surowego produktu wykazuje przesunięcie chemiczne w górę pola, które nie odpowiada żadnemu z możliwych gatunków nieinterlockowanych, ale jest w dobrej zgodzie z przesunięciami chemicznymi obserwowanymi w poprzednich badaniach nad katenanami zawierającymi Bip (9), zgodnymi z tworzeniem połączonych struktur. Surowy produkt zawiera również niewielki procent (~20%) nieinterlockowanych cząsteczek, które zostały przypisane do unreacted 2 i polimer/oligomer 5 na podstawie ich przesunięcia chemicznego 1H NMR.

rys. 2 Charakterystyka NMR i oczyszczanie polikatenanów.

(A) częściowe widmo 1H NMR (600 MHz, CDCl3) obszaru HA/a oczyszczonego polikatenanu w porównaniu z widmami poszczególnych pierścieni 2 i 4 oraz produktem ubocznym polimeru ADMET 5 (struktura, patrz fig. S5). W żółtym obszarze zaznaczone są protony odpowiadające zespolonym ugrupowaniom Bip. B) Oczyszczanie polikatenanów bez chromatografii poprzez selektywną metalizację i ekstrakcję. C) częściowe widmo 1H-1H NOESY oczyszczonego roztworu polikatenanu (1% w/v w CDCl3) mierzone w temperaturze -17°C. Niektóre szczyty Noe krzyżują się między 2 i 4 ugrupowaniami. Czerwone i niebieskie litery są jak na Rys. 1E. pełne spektrum patrz rys. S13.

aby łatwo usunąć nieinterlockowany produkt uboczny, opracowaliśmy procedurę (rys. 2B), który wykorzystał wstępnie zorganizowaną strukturę połączoną docelowego polikatenanu. Zgodnie z interlocked ligand effect (tj., efekt catenanda) (8, 36), jony metali preferencyjnie wiążą się z mechanicznie połączonymi ligandami, a nie nieinterlockowanymi wolnymi ligandami, ze względu na obniżony koszt entropii połączenia ligandów. 1h badania miareczkowania NMR (rys. S5B) potwierdził, że po dodaniu Zn2+ do surowego produktu, gatunki związane z przesuniętymi w górę protonami pirydylowymi znikają, gdy ~70% ugrupowań Bip jest metalizowane, zgodnie z selektywną remetalacją połączonych gatunków. Nieinterlockowane produkty uboczne pozostały niezmetalowane, umożliwiając ich łatwe oddzielenie przez ekstrakcję ciało stałe-ciecz (z chloroformem/heksanem 2:1 V/v), pozostawiając czysty polikatenan 3 jako ciało stałe z wydajnością ~75%. Ten etap oczyszczania usuwa również niektóre oligomeryczne produkty zblokowane, głównie ze względu na mniejszą liczbę połączonych miejsc wiązania metalu z jonami, co statystycznie zmniejsza prawdopodobieństwo wiązania wystarczającej ilości jonów metali, aby zmienić ich rozpuszczalność.

na podstawie dwuwymiarowych badań NMR (fig. S6 do S8). Spektroskopia potwierdza, że 3 zawiera ~50% makrocyklu 2 i ~50% składnika (lub składników) pochodzącego z 1 (na podstawie integracji 1H NMR) (rys. S10), co jest zgodne z tworzeniem docelowej naprzemiennej struktury polikatenanowej. Struktura sprzężona jest dodatkowo potwierdzona przez spektroskopię efektu Nadhausera jądrowego (NOESY) (Fig. 2C). Obniżenie temperatury (-17°C) w celu zmniejszenia ruchów pierścienia w polikatenanie powoduje powstanie licznych pików krzyżowych NOE w rozcieńczonych (1% w/v) roztworach 3. Szczególnie interesujące są interkomowe piki krzyżowe NOE między protonami w różnych makrocyklach (2 i 4). Co najmniej cztery międzyskładnikowe piki krzyżowe NOE—w tym, na przykład, jeden między HL 4 A Hn/o 2—obserwowano w 3 (Fig. 2C), ale nie w prostych mieszaninach 2 i 4 lub 2 i 5 (fig. S11 i S12). Biorąc pod uwagę, że sygnały NOE zwykle wymagają, aby protony były oddalone od siebie o <o 0,5 nm, dane te zdecydowanie sugerują, że makrocykle 2 i 4 muszą być ze sobą połączone, a 3 to polikatenan.

Po potwierdzeniu struktury sprzężonej, następnie zastosowaliśmy chromatografię przenikania żelu połączoną z detektorem rozproszenia światła wielościeżkowego (GPC-MALS) do pomiaru bezwzględnej masy molowej polimerów (37). Chromatogram GPC 3 (rys. 3A, czarna linia) wykazuje szeroki pik zgodny ze średnią masą molową mn = 21,4 kg/mol i dyspersją Đ = 1,44 (Tabela 1). Przy każdej objętości elucji bezwzględna Masa molowa jest pokazana jako czerwona kropkowana linia, wskazująca, że Dystrybucja produktu 3 zawiera gatunki o masie molowej do ~200 kg/mol, co odpowiada polikatenanowi. Dekonwolucja szerokiego piku w chromatogramie daje trzy podpowiedzi (od I do III), co oznacza, że produkt polikatenanu może zawierać trzy różne architektury. Zmierzone bezwzględne masy molowe (z MALS) tych trzech pików wynoszą około 20 do 200, 10 do 40 i 6 do 10 kg/mol, co odpowiadałoby odpowiednio polikatenanom, polikatenanom i polikatenanom. Względny procent trzech pików szacuje się (na podstawie obszarów szczytowych) na odpowiednio 28, 61 i 11%.

rys. 3 Masa molowa i charakterystyka architektury polikatenanów.

(A) chromatogram GPC, absolutny pomiar masy molowej MALS i dekonwolucja szczytowa 3. a. u., dowolne jednostki. B) proponowane architektury odpowiadające trzem dekonwolutowym pikom, mechanizmowi tworzenia i odpowiadającej im średniej liczbie końców łańcucha (NC). RCM, metateza zamykająca pierścień. C) chromatogramy GPC frakcjonowanych frakcji polikatenanu (3A do 3d, intensywność znormalizowana przez ich względny procent masy) w porównaniu z CHROMATOGRAMAMI niefrakcjonowanego polikatenanu 3. Przedstawiono również zakresy objętości elucji trzech dekonwolucyjnych pików (od I do III). (D) widma MALDI-TOF frakcji polikatenanowej 3b. dolne piki (oznaczone gwiazdkami) pochodzą z wielokrotnie naładowanych jonów molekularnych. m / z, stosunek masy do ładunku. E) częściowe widmo 1H NMR (500 MHz, CDCl3) pokazujące region HA/a od 3A do 3D w porównaniu z widmem dwóch kontroli: katenanu (6) i polikatenanu cyklicznego (7). Cztery regiony (α, β, γ, δ) są zdefiniowane. Piki końców łańcucha i specyficzne piki dla cyklicznych katenanów są zaznaczone odpowiednio na Żółto i zielono.

Tabela 1 Masa molowa i architektura 3 i 3a do 3d.

mn, liczba-średnia Masa molowa; DP, stopień polimeryzacji; Đ, dyspersja; NC, średnia liczba końców łańcucha; NCEx, średnia liczba końców łańcucha dla acyklicznych polikatenanów.

wbudowany obraz
zobacz tę tabelę:

  • View popup
  • View inline

jednym z możliwych wyjaśnień dla pików od I do III jest tworzenie odpowiednio architektur rozgałęzionych, liniowych i cyklicznych, jak pokazano na Fig. 3b. oprócz ukierunkowanych liniowych polikatenanów, jest z pewnością możliwe, że mogą wystąpić reakcje między łańcuchami (dimeryzacja i oligomeryzacja 4), prowadzące do rozgałęzionych polikatenanów o większej masie molowej. Ponadto możliwe jest również, że procent MSP to struktury cykliczne o masie mniejszej niż molowa, co z kolei prowadziłoby do cyklicznych polikatenanów. Jednym z dowodów sugerujących cykliczne polikatenany jest obserwowany pik przejścia między pikami II I III w bezwzględnym pomiarze masy molowej (Fig. 3A, w ~9,2 ml). Jeśli pik III odpowiada geometrii cyklicznej, spodziewamy się, że te bardziej zwarte struktury będą współeluować z polimerami liniowymi o masie mniejszej niż molowa (38).

aby dokładniej scharakteryzować mieszaninę polikatenanu, wykonaliśmy preparatywne GPC na 3, uzyskując cztery frakcje 3a do 3d. 1h badania NMR potwierdziły, że wszystkie cztery frakcje zawierają ~50% makrocyklu 2, przy czym wszystkie są polikatenanami (fig . S14). GPC-MALS każdej frakcji potwierdziły udaną separację opartą na rozmiarach (rys. 3C i rys. S15), a cztery frakcje wykazały zmniejszającą się masę molową (Tabela 1) przy stosunkowo wąskim Đ (1,11-1,18) (Tabela 1). Na podstawie czasów elucji frakcje 3A i 3b odpowiadają głównie pikowi i, 3C odpowiada głównie pikowi II, a 3d zawiera mieszaninę pików II i III. spektrometria masowa wspomagana matrycą desorpcji laserowej/jonizacji-time–of-flight (MALDI-TOF)potwierdziła obecność polimerów o wysokiej masie molowej z pikami jonów cząsteczkowych odpowiadającymi polikatenanowi w 3b (Fig . 3D) i do polikatenanu dla 3c (rys. S16).

jednym ze sposobów scharakteryzowania architektury (rozgałęzionych, liniowych lub cyklicznych) polikatenanów we frakcjach 3a do 3d jest wyjaśnienie średniej liczby końców łańcucha (NC) polimerów w każdej frakcji. Z definicji, NC jest równe 0 dla polikatenanów cyklicznych, 2 dla polikatenanów liniowych i ≥4 dla polikatenanów rozgałęzionych (Fig. 3b). Przy bezwzględnej masie molowej każdej frakcji dostępnej z MALS, ich stopnie polimeryzacji (DPs, które definiujemy tutaj jako równoważne n) można łatwo obliczyć za pomocą MMALS/1544 (wyniki wymienione w tabeli 1), gdzie MMALS jest masą molową z GPC-MALS, a 1544 g/mol jest średnią masą molową z 2 i 4 (zakładając stosunek 1:1 w polimerze). Następnie można obliczyć NC, łącząc te dane z analizą łańcucha NMR (eq. S1). Kluczem do takich obliczeń jest znalezienie diagnostycznych szczytów łańcuchowych polikatenanów w widmie 1H NMR. Aby to zrobić, ukierunkowano (głównie) katenan 6 i zsyntetyzowano przez reakcję 1 w obecności dwóch odpowiedników jonów 2 i Zn2+ (fig. S17), a jego widmo NMR porównano z 3A do 3d na Fig. 3E. trzy grupy szczytów dla HA / a 6 z ~ 1: 1: 1 obszarów szczytowych (rys. S17) były obserwowane i definiowane jako odpowiednio regiony α (8,235 do 8,270 ppm), β (8,195 do 8,235 ppm) i γ (8,150 do 8,195 ppm). Niższa intensywność regionu α W 3A do 3D, w porównaniu z intensywnością w 6, wraz z dłuższym czasem relaksacji NMR protonów w regionie α (fig. S18), potwierdza, że region ten odpowiada końcowi łańcucha (zob. materiały dodatkowe). Dzięki temu przypisaniu można obliczyć średnią liczbę końców łańcucha, NC, za pomocą Eq. 1wbudowany obraz(1)Gdzie IA/a jest całkowitą całką szczytową HA/a, a Ia jest całką szczytową ha/a na końcu łańcucha (tj. region α; zob. eqs. S1 do S3 dla szczegółów wyprowadzenia). Wyniki obliczeń NC dla 3 i 3A-3D podsumowano w tabeli 1. Frakcje 3a (NC = 8,7) i 3b (NC = 4,7) są przeważnie rozgałęzione, natomiast 3C (NC = 1,7) i 3d (NC = 1.2) wydaje się, że zawierają różne ilości cyklicznych polikatenanów, co powoduje NC < 2. Aby określić udział cyklicznych polikatenanów w tych ostatnich frakcjach, podjęto dodatkowe badania w celu specyficznego ukierunkowania cyklicznego polikatenanu 7. Osiągnięto to poprzez wytworzenie MSP (przy użyciu Fe2+ jako jonu metalu) i reakcję zamykania pierścienia w znacznie niższych stężeniach (patrz materiały uzupełniające i fig. S19). Porównanie obszaru HA/a w widmie 1H NMR (rys. 3E) cyklicznych frakcji zawierających polikatenan (3c, 3d i 7) wykazuje dodatkowe przesunięcie w górę do 8,06 do 8,15 ppm (Fig. 3E, region zielony), który jest zdefiniowany jako region δ. W przeciwieństwie do tego, acykliczne próbki zawierające polikatenan (3a, 3b i 6) nie mają żadnych pików w tym regionie. W związku z tym uzasadnione jest stwierdzenie, że region δ jest specyficzny dla cyklicznych polikatenanów. W porównaniu z acyklicznymi polikatenanami (3a i 3b) lub katenanem 6, wydaje się, że ~50% pików a / a cyklicznego polikatenanu 7 jest przesuniętych bardziej w górę. Jednym z możliwych wyjaśnień jest cykliczna Architektura ograniczająca mobilność konformacyjną, w wyniku czego powstaje bardziej zwarta cząsteczka (rys. S19E) i umożliwiając dodatkowe efekty ekranowania przed sąsiednimi ugrupowaniami aromatycznymi. Biorąc pod uwagę, że Całka HA/a w 7 pokazuje, że ~50% jej protonów HA/a jest obecnych w regionie δ (rys. S20), możliwe jest określenie średniej liczby końców łańcucha dla acyklicznych polikatenanów (NCEx) obecnych w każdej frakcji za pomocą równania. 2 (dla wyprowadzenia, patrz eqs. S3 do S5)wbudowany obraz(2)gdzie Iδ jest szczytową integracją regionu δ w widmie NMR (rys. 3E). Wyniki tych obliczeń pokazują, że zarówno 3c, jak i 3d mają ncex ≈ 2 (z NC < 2), zgodnie z faktem, że oba zawierają mieszaninę liniowych i cyklicznych polikatenanów, przy czym procent cyklicznych polikatenanów w 3c i 3d wynosi odpowiednio ~15 i ~34% (obliczone za pomocą równania. S6). Tabela 1 podsumowuje masę molową i dane architektoniczne 3 oraz cztery frakcje 3a do 3d. Frakcję o najwyższej masie molowej (3a) przypisuje się wysoko rozgałęzionym polikatenanom (na podstawie analizy MALS) (fig. S15A) ze średnią DP = 55. Frakcja 3b składa się z mniejszego stopnia rozgałęzionych polikatenanów o średniej DP = 25. Frakcje 3C i 3D zawierają głównie liniowe (z pewnymi cyklicznymi) polikatenany o liczbie do 27 (średnia DP = 11) (rys. S15C) i 20 (średnia DP = 8) (rys. S15D) odpowiednio połączone pierścienie. Na podstawie danych z czterech frakcji możemy oszacować, że ogólny procent rozgałęzionych, liniowych i cyklicznych polikatenanów wynosi odpowiednio ~24, ~60 i ~16%, co dobrze pasuje do wyniku dekonwolucji szczytowej GPC (odpowiednio 28, 61, 11%) (rys. 3A). Zebrane razem dane są zgodne z polikatenanem 3 będącym mieszaniną rozgałęzionych polikatenanów, liniowych polikatenanów i cyklicznych polikatenanów, w przybliżeniu w wyżej wymienionych proporcjach.

wiadomo, że katenany przygotowane za pomocą szablonów metalowych wykazują działanie reagujące na metal (36). Jako takie, właściwości reagujące na bodźce metaliczne tych polikatenanów badano zarówno w roztworze, jak i w masie, mierząc promień hydrodynamiczny Rh (Fig. 4A i rys. S21) i temperatury zeszklenia (TG) (rys. 4B i rys. S22), odpowiednio. Dodanie jonów Zn2+ do polikatenanów powinno zablokować ruchy konformacyjne pierścieni, wywołując w ten sposób przejście z wysoce elastycznego polimeru na półsztywny polimer, gdzie elastyczność pochodzi głównie z ugrupowań glikolu tetraetylenowego (Teg) (Fig. 4a). Dla polikatenanów liniowych (3C, średnia DP = 11), dodanie Zn2+ wykazuje znaczny (~70%) wzrost Rh z 3,9 do 6,6 nm (Fig. 4a). Wynik ten zgadza się dobrze z symulacjami dynamiki molekularnej wszystkich atomów metalizowanego liniowego polikatenanu (patrz materiały uzupełniające). Cząsteczki symulowano za pomocą opls (optimized potentials for liquid simulations) all-atom force field (39) Z 1,1,2,2-tetrachloroetanem jako rozpuszczalnikiem, a właściwości polimeru zbadano za pomocą eksperymentu rozciągania siły. Aby modelować polikatenan pod napięciem, katenan został połączony z sobą poprzez okresowe warunki brzegowe (rys. 4C); wydłużenie było wymuszane przez długość układu (skrzynki), która jest systematycznie zmieniana; a odpowiednie napięcie wynika z tensora ciśnienia (równoważnik. S9). Zachowanie rozciągania siły jest dobrze opisane przez model rozszerzalnego łańcucha przypominającego robaka (EWLC) (40), Jak pokazano na Fig. 4C. zgodnie z tą interpretacją udział każdego makrocyklu w długości konturu, l = 2,40 ± 0,03 nm, jest znacznie mniejszy niż długość trwałości, lp = 7,46 ± 2.88 nm, co jest charakterystyczne dla polimeru półsztywnego. Ponownie, elastyczność tę można przypisać przede wszystkim segmentom TEG makrocyklu 2, o czym świadczą większe wahania odległości międzymetalicznych dla 2 w porównaniu z 4 (fig. S28 i S29). Na podstawie symulacji nieokresowego metalizowanego katenanu, Rh wynosi ~34% odległości od końca do końca (Ree). Dla metalizowanego polikatenanu dowolnego DP, Ree można obliczyć za pomocą statystyk łańcucha robaka (eq. S15) oraz wyniki symulacji rozciągania siły. Rh dla przeciętnego polikatenanu we frakcji 3c szacuje się w ten sposób na 6,89 ± 1.38 nm, w dobrej zgodzie z wynikami DLS (6,6 nm), co dodatkowo potwierdza wniosek, że frakcja 3C jest przede wszystkim liniowym polikatenanem (patrz materiały uzupełniające). Symulowaną strukturę metalizowanego liniowego polikatenanu pod napięciem ~15 pN przedstawiono na Fig. 4D, pokazujący segment 12 połączonych pierścieni.

rys. 4 eksperymentalne badania i symulacja metalowych polikatenanów.

(A) Ilustracja metalo-reagującej zmiany konformacyjnej liniowego polikatenanu między elastycznymi i półsztywnymi strukturami, na co wskazuje zmiana promienia hydrodynamicznego (RH) (fig. S21). Elastyczność metalizowanego polikatenanu wynika przede wszystkim z grupy TEG makrocyklu 2. B) dane DSC dla polikatenanów liniowych (demetalowanych i metalizowanych) w porównaniu z danymi dla polimeru ADMET 5 (TG obliczone przez punkt środkowy połowy wysokości). „Exo Up” oznacza, że kierunek egzotermicznego przepływu ciepła jest w górę. C) symulowana krzywa rozciągania siły wytwarzana przez zmianę długości skrzynki metalizowanego katenanu liniowego połączonego ze sobą poprzez okresowe warunki brzegowe w kierunku Z. Dane z symulacji (zielone kółka, rozmiar punktu danych zawiera błąd) są dopasowywane przez model rozszerzalnego łańcucha robaka (EWLC) (Czarne myślniki). D) Wizualizacja metalizowanego liniowego polikatenanu (pokazującego segment 12 połączonych ze sobą pierścieni) pod napięciem ~15 pN z symulacji dynamiki molekularnej wszystkich atomów w rozpuszczalniku 1,1,2,2-tetrachloroetanu (Atomy rozpuszczalnika i wodoru pominięte dla jasności).

podobnie jak polikatenan liniowy, metalizacja rozgałęzionych polikatenanów (3b, średnia DP = 24,9) z Zn2+ wykazuje ~50% wzrost Rh po metalizacji (5,0 do 7,6 nm) (rys. S21B), prawdopodobnie w wyniku przedłużenia ramion. Metalizacja cyklicznego polikatenanu 7 (średnia DP = 6) wykazuje tylko stosunkowo niewielką zmianę Rh (~10%, od 2,4 do 2,6 nm) (rys. S21C), co jest zgodne z jego cykliczną architekturą ograniczającą rozszerzenie łańcucha. W masie stwierdzono, że wartości Tg polikatenanu o architekturze głównie liniowej (3c) i rozgałęzionych (3b) wynosiły odpowiednio 97° i 104°C, w porównaniu z 137°C dla 5 (liniowy polimer ADMET 1) . Ogólnie rzecz biorąc, polimery z większą swobodą ruchu segmentowego wykazują niższe wartości Tg, co jest zgodne z bardziej łatwymi konformacyjnymi ruchami molekularnymi oczekiwanymi w obrębie tylnych kości polikatenanu. Metalizacja za pomocą Zn2 + blokuje te ruchy konformacyjne i znacznie zmniejsza elastyczność polikatenanu; w związku z tym nie obserwuje się wartości Tg po podgrzaniu do 160°C zarówno dla próbek liniowych, jak i rozgałęzionych (rys. 4B i rys. S22).

podsumowując, skuteczna synteza polikatenanów łańcucha głównego za pomocą strategii szablonowej MSP została osiągnięta z wydajnością ~75%. Wyizolowana mieszanina produktów obejmuje polikatenany liniowe, polikatenany rozgałęzione i polikatenany cykliczne. Ta syntetyczna strategia otwiera drzwi do projektowania i syntezy różnych nowych polimerów.

Materiały uzupełniające

www.sciencemag.org / treść/358/6369/1434/suppl/DC1

materiały i metody

tekst uzupełniający

Od S1 do S29

tabele od S1 do S3

Bibliografia (41-93)

http://www.sciencemag.org/about/science-licenses-journal-article-reuse

jest to artykuł rozpowszechniany na warunkach domyślnej licencji czasopism naukowych.

Referencje i uwagi

    1. K. S. Chiczak,
    2. S. J. Cantrill,
    3. A. R. Pease,
    4. S.-H. Chiu,
    5. G. W. V. Cave,
    6. J. L. Atwood,
    7. J. F. Stoddart

    , molecular Borromean rings. Science 304, 1308-1312 (2004). 10.1126 / nauka1096914pmid:15166376

    1. J. J. Danon,
    2. A. Krüger,
    3. D. A. Leigh,
    4. J. F. Lemonnier,
    5. A. J. Stephens,
    6. I. J. vitorica-yrezabal,
    7. S. L. Woltering

    , oplatając węzeł molekularny ośmioma skrzyżowaniami. Science 355, 159-162 (2017). 10.1126 / naukaaal1619pmid: 28082585

    1. N. Ponnuswamy,
    2. F. B. L. Cougnon,
    3. J. M. Clough,
    4. G. D. Pantoş,
    5. J. K. M. Sanders

    , odkrycie organicznego węzła drzewnego. Science 338, 783-785 (2012). 10.1126 / nauka1227032pmid: 23139329

    1. S. Erbas-Cakmak,
    2. D. A. Leigh,
    3. C. T. McTernan,
    4. A. L. Nussbaumer

    , sztuczne maszyny molekularne. Chem. Rev.115, 10081-10206 (2015). doi: 10.1021 / acs.chemrev.5b00146pmid: 26346838

    1. P. Thordarson,
    2. E. J. A. Bijsterveld,
    3. A. E. Rowan,
    4. R. J. M. Nolte

    , Epoksydowanie polibutadienu za pomocą topologicznie związanego katalizatora. Natura 424, 915-918 (2003). DOI:10.1038/nature01925pmid:12931181

    1. KK Kochi, Me Belovich, M. Liong, MV Ambrogio,
    2. Yu.a. Lau, ha Khatib,
    3. j. I. cynk, N. M. Hashab,
    4. J. F. Stoddart

    , zmechanizowane nanocząstki do dostarczania leków. Nanoskali 1, 16-39 (2009). pmid: 20644858

    1. j.J. Davies,
    2. G. A. Orłowski, H. rzadko, P. D. piwo

    , mechanicznie połączone i przełączane cząsteczki na powierzchniach. Chim.. Wspólny. 46, 54-63 (2010). doi: 10.1039 / B915122Bpmid: 20024293

    1. K. O. Dietrich-Bucheker,
    2. j.P. Sauvage,
    3. j.P. Kintzinger

    , nowa rodzina cząsteczek: Metalokatenany. Czworościan, 24, 5095-5098 (1983). doi:10.1016/s0040-4039(00)94050-4

    1. RJ Wojtecki,
    2. Q. Wu,
    3. j.w. Si Johnson, D. G. Ray,
    4. L. T. J. Korley,
    5. S. J. Rowan

    , Optymalizacja tworzenia katenianów zawierających 2,6-bis(N-alkilo-benzimidazolilo)pirydynę poprzez projektowanie komponentów. Chem. Sci. 4, 4440 (2013). doi:10.1039/c3sc52082j

    1. H. Lahlali,
    2. K. Jobe,
    3. M. Watkinson,
    4. S. M. Goldup

    , wielkość Makrocyklu ma znaczenie: „małe” funkcjonalizowane rotaksany o doskonałej wydajności przy użyciu metoda cuaac Active Template. Angew. Chem. Int. Ed. 50, 4151–4155 (2011). doi: 10.1002 / ania201100415pmid:21462287

  • P. R. Ashton,
  • T. T. Goodnow,
  • A. E. Kaifer,
  • M. V. Reddington,
  • A. M. Z. Slawin,
  • N. Spencer,
  • J. F. Stoddart,
  • C. Vicent,
  • D. J. Williams
  • , Katenane wykonane na zamówienie. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 28, 1396–1399 (1989). doi: 10.1002 / ania198913961

    1. G. A. Breault,
    2. C. A. Hunter,
    3. P. C. Mayers

    , Topologia Supramolekularna. Tetrahedron 55, 5265-5293 (1999). doi: 10.1016 / S0040-4020(99)00282-3

    1. Z. NIU, H. U. Gibson

    , polikatenany. Chemia. Rev. 109, 6024-6046 (2009). doi: 10.1021 / cr900002hpmid: 19670889

    1. Y. Noda,
    2. Y. Hayashi, K. Ito

    , od żeli topologicznych po Materiały z pierścieniami ślizgowymi. J. Aplikacja. Polym. Sci. 131, 40509 (2014). doi: 10.1002 / załącznik.40509

    1. j. L. Weidmann,
    2. j.w. Kern,
    3. j.w. P. Sauvage, D. Muscat, s. Mullins,
    4. W. Köhler,
    5. C. Rosenauer,
    6. H. J. Räder,
    7. K. Martin,
    8. Y. Geerts

    , Polikatenany i cykliczne oligokatenany zawierające naprzemienne wiązania topologiczne i kowalencyjne: synteza i charakterystyka. Chemistry 5, 1841-1851 (1999). doi:10.1002/(SICI)1521-3765 (19990604)5: 6<1841:: AID-CHEM1841>3.0.CO; 2-Q

    1. T. Pakula,
    2. K. Jeszka

    , Symulacja pojedynczych złożonych makrocząsteczek. 1. Struktura i dynamika katenanów. Macromolecules 32, 6821-6830 (1999). doi:10.1021/ma990248c

  • J. Weidmann,
  • J. M. Kern,
  • J. Sauvage,
  • Y. Geerts,
  • D. Muscat,
  • K. Müllen
  • , poli-katenany zawierające naprzemienne wiązania topologiczne i kowalencyjne. Chem. Commun. 1996, 1243–1244 (1996). doi: 10.1039/CC9960001243

    1. C. Hamers,
    2. F. M. Raymo,
    3. J. F. Stoddart

    , Łańcuch główny i zawieszony Poli (katenan)s, zawierający dodatkowe składniki bogate w π-elektrony i rzadkie. Eur. J. Organizacja. Chemia. 1998, 2109-2117 (1998). doi: 10.1002/(SICI)1099-0690 (199810)1998:102109::AID-EJOC21093.0.CO ; 2.

    1. D.Muscat,
    2. w. Kohler, HJ. Reder, K. Martin, S. Mullins, B. Muller, K. Mullen,
    3. TH. Geerts

    , synteza i charakterystyka Poli-katenanów zawierających sztywne segmenty katenanu. Macromolecules 32, 1737-1745 (1999). doi: 10.1021 / ma981077z

    1. N. Watanabe,
    2. Y. Ikari,
    3. N. Kihara,
    4. T. Takata

    , Macromolecules 37, 6663-6666 (2004). doi: 10.1021/ma048782u

    1. C. Hamers,
    2. O. Kocian,
    3. F. M. Raymo,
    4. J. F. Stoddart

    , Poli(biscatenan) zawierający kombinację wiązań kowalencyjnych, mechanicznych i koordynacyjnych. ADV. Złomek. 10, 1366–1369 (1998). doi:10.1002/(SICI)1521-4095 (199811)10: 16<1366:: AID-ADMA1366>3.0.CO;2-d

    1. C. A. Fustin,
    2. C. Bailly,
    3. G. J. Clarkson,
    4. P. De Groote,
    5. T. H. Galow,
    6. D. A. Leigh,
    7. D. Robertson,
    8. A. M. Z. Sławin,
    9. J. K. Y. Wong

    , J. Am. Chem. Soc. 125, 2200–2207 (2003). doi:10.1021/ja0292546pmid:12590548

    1. B. N. Ahamed,
    2. P. Van Velthem,
    3. K. Robeyns,
    4. C. A. Fustin

    , wpływ singla catenane o właściwościach półprzewodnikowych mechanicznie połączonych polimerów. ACS Macro Lett. 6, 468–472 (2017). doi: 10.1021 / acsmacrolett.7b00204

    1. K. Endo,
    2. T. Shiroi,
    3. N. Murata,
    4. G. Kojima,
    5. T. Yamanaka

    , synteza i charakterystyka Poli(1,2-ditianu). Macromolecules 37, 3143-3150 (2004). doi:10.1021/ma021237d

    1. Berrocal J. A.,
    2. L. M. Pit,
    3. M. M. L. Nieuwenhuizen,
    4. L. Mandoliny,
    5. E. W. Meijer,
    6. S. Stefano

    , ring-opening metathesis polymerization of a diolefinic-catenane–Copper(i) complex: an easy route to polycatenanes. Makrocząsteczki 48, 1358-1363 (2015). doi:10.1021 / ma502392v

    1. P. F. Cao,
    2. J. D. Mangadlao,
    3. A. de Leon,
    4. Z. Su,
    5. R. C. Advincula

    , Catenated poly (ε-caprolactone) and poly (l-lactide) poprzez Ring-expansion strategy. Makrocząsteczki 48, 3825-3833 (2015). doi: 10.1021 / acs.macromol.5b00470

    1. D. B. Amabilino,
    2. P. R. Ashton,
    3. A. S. Reder,
    4. N. Spencer,
    5. J. F. Stoddart

    , Olimpiada. Enju. Hem. Int.Wyd. ANGLE. 33, 1286–1290 (1994). DOI: 10.1002 / Ani.199412861

    1. H. Iwamoto,
    2. S. Tafuku,
    3. Y. Sato,
    4. W. Takizawa,
    5. W. Katagiri,
    6. E. Tayama,
    7. E. Hasegawa,
    8. Y. Fukazawa,
    9. T. Haino

    , Synthesis of linear catenanes via olefin metathesis dimerization of pseudorotaxanes composed of a catenane and a secondary ammonium salt. Hem. Komun. 52, 319–322 (2016). doi:10.1039/C5CC07562Apmid:26515104

    1. D. B. atrakcyjny,
    2. P. R. Ashton,
    3. S. E. Boyd,
    4. J. Y. Lee,
    5. S. MENZER,
    6. J. F. Stoddart,
    7. D. J. Williams

    , pięciostopniowy samoczynny montaż rozgałęzionego heptakatenanu. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 36, 2070–2072 (1997). doi: 10.1002 / ania199720701

    1. M. Burnworth,
    2. L. Tang,
    3. J. R. Kumpfer,
    4. A. J. Duncan,
    5. F. L. Beyer,
    6. G. L. Fiore,
    7. S. J. Rowan,
    8. C. weder

    , optycznie uzdrawialne polimery supramolekularne. Nature 472, 334-337 (2011). doi:10.1038/nature09963pmid: 21512571

    1. R. J. Wojtecki,
    2. M. A. Meador,
    3. S. J. Rowan

    , wykorzystując Wiązanie dynamiczne do uzyskania dostępu do makroskopowo reagujących strukturalnie dynamicznych polimerów. Nat. Złomku. 10, 14–27 (2011). doi:10.1038/nmat2891pmid: 21157495

    1. J. R. Kumpfer,
    2. S. J. Rowan

    , właściwości termiczne, fotograficzne i chemiczne pamięci kształtu z fotosieciowanych polimerów metalo-supramolekularnych. J. Am. Chem. Soc. 133, 12866–12874 (2011). doi:10.1021/ja205332wpmid: 21790172

    1. B. T. Michał,
    2. B. M. McKenzie,
    3. S. E. Felder,
    4. S. J. Rowan

    , metalo-, termo-i fotoreaktywna pamięć kształtu i uruchamianie ciekłokrystalicznych elastomerów. Macromolecules 48, 3239-3246 (2015). doi: 10.1021 / acs.makromol.5b00646

    1. R. Kramer,
    2. J. M. Lehn,
    3. A. Marquis-Rigault
    4. Ol Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 90, 5394-5398 (1993). doi: 10.1073 / pnas.90.12.5394 pmid:11607405

    1. S. J. Rowan,
    2. J. Beck

    , polimeryzacja supramolekularna indukowana ligandem metalu: droga do materiałów reagujących. Faraday Dyskutuje. 128, 43–53 (2005). doi:10.1039/B403135Kpmid: 15658766

    1. J. E. M. Lewis,
    2. M. Galli,
    3. S. M. Goldup

    , właściwości i pojawiające się zastosowania mechanicznie blokowanych ligandów. Chem. Commun. 53, 298–312 (2016). doi:10.1039/C6CC07377Hpmid: 27819362

    1. P. J. Wyatt

    , rozpraszanie światła i absolutna charakterystyka makrocząsteczek. Anal. Chim. Acta 272, 1-40 (1993). doi: 10.1016/0003-2670(93)80373-s

    1. C. W. Bielawski,
    2. D. Benitez,
    3. R. H. Grubbs

    , „niekończąca się” droga do polimerów cyklicznych. Science 297, 2041-2044 (2002). 10.1126 / nauka1075401pmid: 12242440

    1. W. L. Jorgensen,
    2. D. S. Maxwell,
    3. J. Tirado-Rives

    , opracowanie i testowanie opls all-atom force field on conformational energetics and properties of organic liquids. J. Am. Chem. Soc. 118, 11225–11236 (1996). doi: 10.1021 / ja9621760

    1. T. Odijk

    , sztywne łańcuchy i włókna pod napięciem. Macromolecules 28, 7016-7018 (1995). doi: 10.1021 / ma00124a044

    1. M. P. Sibi,
    2. G. Petrovic

    , enantioselective radical reactions: the use of metal triflimides as Lewis acids. Tetrahedron Asymmetry 14, 2879-2882 (2003). doi: 10.1016/s0957-4166(03)00543-3

    1. B. M. McKenzie,
    2. A. K. Miller,
    3. R. J. Wojtecki,
    4. J. C. Johnson,
    5. K. A. Burke,
    6. K. A. tzeng,
    7. P. T. Mather,
    8. S. J. Rowan

    , improved synthesis of functionalized Mesogenic 2,6-bisbenzimidazolylpyridine ligandów. Tetrahedron 64, 8488-8495 (2008). doi: 10.1016 / j. tet.2008.05.075

    1. H. Sashiwa,
    2. Y. Shigemasa,
    3. R. Roy

    , Chemical modification of chitosan 11: Chitosan–dendrimer hybrid as a tree like molecule. Węglowodany. Polym. 49, 195–205 (2002). doi: 10.1016/S0144-8617(01)00322-8

  • F. Heatley, in NMR Spectroscopy of Polymers (Springer, 1993), PP.1-49.
    1. M. Enamullah,
    2. W. Linert

    , wpływ podstawników i rozpuszczalników na stabilność kompleksów żelaza(II) – 4-X-2,6-bis-(benzimidazol-2′-ilo)pirydynowych wykazujących zwrotnicę spinową w roztworze. J. Coord. Chem. 40, 193–201 (1996). doi: 10.1080/00958979608024344

    1. HJ S. Berendsen, D. van der spoel,
    2. R. van Drunen

    , GROMAX: implementacja równoległej dynamiki molekularnej z transmisją komunikatów. Obliczać. Fiz. 91, 43-56 (1995). doi: 10.1016/0010-4655(95)00042-E

    1. MJ Abraham, T. Murtola,
    2. R. Schulz, s. Pall,
    3. j. S. Smith, B. Hess, E. Lindahl

    , Gromaki: Wysokowydajne symulacje molekularne dzięki wielopoziomowej równoległości od laptopów po superkomputery. SoftwareX 1-2, 19-25 (2015). doi: 10.1016 / j.softx.2015.06.001

    1. N. A. McDonald,
    2. W. L. Jorgensen

    , opracowanie all-atomowego pola siłowego dla heterocykli. Właściwości ciekłego pirolu, furanu, diazoli i oksazoli. J. Phys. Chem. B 102, 8049-8059 (1998). doi: 10.1021/jp981200o

    1. W. L. Jorgensen,
    2. N. A. McDonald

    , Development of an all-atom force field for heterocycles. Właściwości ciekłej pirydyny i diazenów. J. Mol. Struct. THEOCHEM 424, 145-155 (1998). doi: 10.1016/S0166-1280(97)00237-6

    1. W. L. Jorgensen,
    2. J. Tirado-Rives

    , Potential energy functions for atomic-level simulations of water and organic and biomolecular systems. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 102, 6665-6670 (2005). doi: 10.1073 / pnas.0408037102pmid: 15870211

    1. M. K. Dahlgren,
    2. P. Schyman,
    3. J. Tirado-Rives,
    4. W. L. Jorgensen

    , Characterization of biaryl torsional energetics and its treatment in OPLS all-atom force fields. J. Chem. Inf. własna Model. 53, 1191–1199 (2013). doi:10.1021/ci4001597pmid: 23621692

  • M. P. Allen, D. J. Tildesley, Computer Simulation of Liquids (Oxford Science Publications, 1989).
    1. T. Darden,
    2. D. York,
    3. L. Pedersen

    , Particle mesh Ewald: an n-log(N) method for Ewald sums in large systems. J. Chem. Phys. 98, 10089-10092 (1993). doi: 10.1063/1.464397

    1. W. Essmann, L. Perera, M. L. Berkowitz, T. Darden, H. Lee, L. G. KP

    , metoda Ewalda z gładką siatką cząstek. J. Chem. Fizyk. 103, 8577-8593 (1995). doi: 10.1063/1.470117

    1. s.Nose

    , metoda dynamiki molekularnej do modelowania w zespole kanonicznym. Mól. Fizyk. 52, 255-268 (1984). doi: 10.1080/00268978400101201

    1. VG Hoover

    , Dynamics Canonical: Equilibrium phase-Space distributions. Phys. Rev. A 31, 1695-1697 (1985). doi: 10.1103 / PhysRevA.31.1695 pmid:9895674

    1. M. Parrinello,
    2. A. Rahman

    , polymorphic transitions in single crystals: a new molecular dynamics method. J. Appl. Phys. 52, 7182–7190 (1981). Doi: 10.1063/1.328693

  • Y. Markus, the Properties of Solvents (Wiley, 1998).
    1. C. Caleman,
    2. P. J. van Maaren,
    3. M. Hong,
    4. J. S. Hub,
    5. L. T. Costa,
    6. D. van der Spoel

    , force field benchmark of organic liquids: Density, entalpy of vaporization, heat capacity, surface tension, izotermiczna ściśliwość, volumetric expansion coefficient, and dielectric constant. J. Chem. Teoria Comput. 8, 61–74 (2012). doi:10.1021/ct200731vpmid: 22241968

    1. B. Hess,
    2. H. Bekker,
    3. H. J. C. Berendsen,
    4. J. G. E. M. Fraaije

    , LINCS:liniowy ogranicznik do symulacji molekularnych. J. Comput. Chem. 18, 1463–1472 (1997). doi:10.1002/(SICI)1096-987X (199709)18: 12<1463:: AID-JCC4>3.0.CO;2-h

    1. B. Hess

    , P-LINCS: równoległy liniowy ogranicznik do symulacji molekularnej. J. Chem. Teoria Comput. 4, 116–122 (2008). doi:10.1021/ct700200bpmid: 26619985

    1. W. F. van Gunsteren,
    2. H. J. C. Berendsen

    , Computer simulation of molecular dynamics: methodology, applications, and perspectives in chemistry. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 29, 992–1023 (1990). doi:10.1002 / ani.199009921

    1. W. Humphrey,
    2. A. Dalke,
    3. K. Schulten

    , VMD: Visual molecular dynamics. J. Hrabia. 14, 33–38 (1996). doi:10.1016/0263-7855(96)00018-5pmid:8744570

    1. G. Bussi,
    2. D. S,
    3. M. Parrinello

    , Canonical sampling through Velocity zoom. J. FIS. 126, 014101 (2007). doi: 10.1063 / 1.2408420 pmid: 17212484

    1. H. J. C. Berendsen,
    2. J. P. M. Postma,
    3. W. F. van Gunsteren,
    4. A. DiNola,
    5. J. R. Haak

    , Molecular dynamics with coupling to an external bath. J. Chem. Phys. 81, 3684–3690 (1984). doi: 10.1063 / 1.448118

    1. D. van der Spoel,
    2. P. J. van Maaren,
    3. C. Caleman

    , GROMACS molecule & liquid database. Bioinformatyka 28, 752-753 (2012). doi:10.1093/bioinformatics / bts020pmid: 22238269

    1. B. J. Palmer

    , autokorelacja poprzeczno-prądowa-obliczenia funkcji lepkości ścinania dla cieczy molekularnych. Phys. Rev.E 49, 359-366 (1994). doi: 10.1103 / PhysRevE.49.359 pmid: 9961225

    1. W. F. Van Gunsteren,
    2. H. J. C. Berendsen

    , algorytm skokowo-żabkowy do dynamiki stochastycznej. Mol. Simul. 1, 173–185 (1988). doi: 10.1080/08927028808080941

  • M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, X. Li, M. Caricato, A. Marenich, J. Bloino, B. G. Janesko, R. Gomperts, B. Mennucci, H. P. Hratchian, J. V. Ortiz, A. F. Izmaylov, J. L. Sonnenberg, D. Williams-Young, F. Ding, F. Lipparini, F. Egidi, J. Goings, B. Peng, A. Petrone, T. Henderson, D. Ranasinghe, V. G. Zakrzewski, J. Gao, N. Rega, G. Zheng, W. Liang, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, K. Throssell, J. A. Montgomery Jr., J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, T. Keith, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, J. M. Millam, M. Klene, C. Adamo, R. Cammi, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, O. Farkas, J. B. Foresman, D. J. Fox, Gaussian 09, revision A. 02 (Gaussian, Inc., 2009).
    1. R. Krishnan,
    2. J. S. Binkley,
    3. R. Seeger,
    4. J. A. Pople

    , samodzielne metody orbitalne molekularne. XX. zbiór podstaw skorelowanych funkcji falowych. J. Chem. Phys. 72, 650–654 (1980). doi: 10.1063/1438955

    1. R. A. Kendall,
    2. T. H. Dunning Jr..,
    3. R. J. Harrison

    , powinowactwo elektronowe atomów pierwszego rzędu. Zestawy podstaw systematycznych i funkcje falowe. J. Chem. Phys. 96, 6796–6806 (1992). doi: 10.1063 / 1.462569

    1. A. W. Schüttelkopf,
    2. D. M. F. van Aalten

    , PRODRG: narzędzie do wysokoprzepustowej krystalografii kompleksów białkowo-ligandowych. Acta Krystalogr. D 60, 1355-1363 (2004). doi: 10.1107 / S0907444904011679pmid:15272157

    1. P. It,
    2. K. M. Merz Junior

    , .. Modelowanie jonów metali z wykorzystaniem mechaniki klasycznej. Chem. Rev. 117, 1564-1686 (2017). doi: 10.1021/acs.chemrev.6b00440pmid: 28045509

    1. Rh STOT, M. Karplus

    , Wiązanie cynku w białkach i roztworze: prosta, ale możliwa dokładna reprezentacja bez wiązań. Wiewiórki 23, 12-31 (1995). doi:10.1002/prot.340230104pmid: 8539245

    1. X. Fan,
    2. j. Yuan,
    3. Yu Bai,
    4. J. Kong,
    5. H. Wu

    , biszync dipikrat metanol disolvate. Acta Krystalogr. E E68, m1072 (2012). doi: 10.1107/s1600536812031443

    1. T. G. A. Youngs,
    2. C. Hardacre

    , zastosowanie przenoszenia ładunku statycznego w polu sił jonowo-cieczowych i jego wpływ na strukturę i dynamikę. ChemPhysChem 9, 1548-1558 (2008). doi: 10.1002 / cphc.200800200pmid:18613196

    1. J. Schmidt,
    2. C. Krekeler,
    3. F. Dommert,
    4. Y. Zhao,
    5. R. Berger,
    6. L. Delle Site,
    7. C. Holm

    , redukcja ładunku jonowego i atomowych ładunków cząstkowych z obliczeń pierwszej zasady chlorku 1,3-dimetyloimidazoliowego. J. Phys. Chem. B 114, 6150-6155 (2010). doi:10.1021/jp910771qpmid:20397676

    1. W. Beichel,
    2. N. Trapp,
    3. C. Hauf,
    4. O. Kohler,
    5. G. Eickerling,
    6. W. Scherer,
    7. I. krossing

    , efekt skalowania ładunku w cieczach jonowych z analizy gęstości ładunku metylosiarczanu n,n’-dimetyloimidazolu. Angew. Chem. Int. Ed. 53, 3143–3146 (2014). doi: 10.1002 / ania201308760pmid: 24677323

    1. F. Müller-Plathe,
    2. W. F. van Gunsteren

    , symulacja komputerowa elektrolitu polimerowego: jodek litu w amorficznym Poli(tlenku etylenu). J. Chem. Phys. 103, 4745–4756 (1995). doi: 10.1063 / 1.470611

    1. K. J. Lin,
    2. J. K. Maranas

    , czy zmniejszenie asocjacji jonowo-jonowej poprawia mobilność kationów w przewodach jedno jonowych? Phys. Chem. Chem. Phys. 15, 16143–16151 (2013). doi: 10.1039 / c3cp51661jpmid:23986076

    1. B. M. Savoie,
    2. M. A. Webb,
    3. T. F. Miller III

    , wzmacniający dyfuzję kationów i tłumiący dyfuzję anionów przez elektrolity polimerowe z kwasem Lewisa. J. Phys. Chem. Lett. 8, 641–646 (2017). doi: 10.1021 / acs.jpclett.6b02662pmid: 28075599

    1. H. Lee,
    2. R. M. Venable,
    3. A. D. Mackerell Jr..,
    4. R. W. Pastor

    , Molecular dynamics studies of polyethylene oxide and polyethylene glycol: hydrodynamic radius and shape anizotropy. Biophys. J. 95, 1590–1599 (2008). doi: 10.1529 / biophysj.108.133025 pmid: 18456821

    1. I. C. Yeh,
    2. G. Hummer

    , system-size dependence of diffusion coefficients and viscosities from molecular dynamics simulations with periodic boundary conditions. J. Phys. Chem. B 108, 15873-15879 (2004). doi: 10.1021/jp0477147

  • P. G. de Gennes, Scaling Concepts in Polymer Physics (Cornell Univ. Press, 1979).
    1. M. D. Wang,
    2. H. Yin,
    3. R. Landick,
    4. J. Gelles,
    5. S. M. Block

    , Rozciąganie DNA pęsetą optyczną. Biophys. J. 72, 1335-1346 (1997). doi:10.1016/S0006-3495(97)78780-0pmid: 9138579

  • M. Frenkel, K. N. Marsh, Eds., Densities of Halohydrocarbons (vol. 8J of Landolt-Börnstein-Group IV Physical Chemistry Series, Springer, 2003).
  • Design Institute for Physical Properties, Project 801 (American Institute for Chemical Engineering, 2010); www.aiche.org/dippr/projects/801.
  • O. Madelung, Ed., Statyczne stałe dielektryczne czystych cieczy i dwuskładnikowych mieszanin cieczy (vol. 6 of Landolt-Börnstein-Group IV Physical Chemistry Series, Springer, 1991).
  • C. L. Yaws, Yaws’ Handbook of Thermodynamic and Physical Properties of Chemical Compounds (Knovel, 2003).
  • D. R. Lide, CRC Handbook of Chemistry and Physics (CRC Press, ed. 90, 2009).
    1. G. Sivaramprasad,
    2. M. V. Rao,
    3. D. H. L. Prasad

    , Density and viscosity of ethanol + 1,2-dichloroethane, ethanol + 1,1,1-trichloroethane, and ethanol + 1,1,2,2-tetrachloroethane binary mixtures. J. Chem. Eng. Data 35, 122–124 (1990). doi:10.1021/je00060a006

    1. G. Pranami,
    2. M. H. Lamm

    , Estimating error in diffusion coefficients derived from molecular dynamics simulations. J. Chem. Theory Comput. 11, 4586–4592 (2015). doi:10.1021/acs.jctc.5b00574pmid:26889517

  • M. Rubinstein, R. H. Colby, Polymer Physics (Oxford Univ. Press, ed. 1, 2003).

  • podziękowania: Dziękujemy K. Herbertowi za pomoc w projektowaniu figur i sugestie dotyczące analizy danych DSC, P. Agrawalowi za pomiary DOSY i F. Etheridge za pomocne dyskusje. Specjalne podziękowania dla S. Shang za zdjęcie Bransoletki Dla Fot. 1A i R. Rauschera za pomoc przy kilku figurach. Praca ta jest finansowana przez NSF w ramach grantów CHE 1700847, che 1402849 i CHE 1151423 oraz przez University of Chicago Materials Research Science and Engineering Center, który jest finansowany przez NSF pod numerem nagrody DMR-1420709. Dodatkowe dane są dostępne w materiałach uzupełniających.

    Dodaj komentarz

    Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.