ChEBI

Chemical Entities of Biological Interest, znany również jako ChEBI, jest chemiczną bazą danych i ontologią jednostek molekularnych skupionych na „małych” związkach chemicznych, która jest częścią projektu open Biomedical Ontologies (OBO) w Europejskim Instytucie bioinformatyki (EBI). Termin ” Jednostka molekularna „odnosi się do dowolnego” konstytucyjnie lub izotopowo odrębnego atomu, cząsteczki, jonu, pary jonowej, rodnika, jonu rodnikowego, kompleksu, konformatora itp., możliwe do zidentyfikowania jako odrębnie wyodrębniony podmiot”. Podmioty molekularne, o których mowa, są albo produktami natury, albo produktami syntetycznymi, które mają potencjalną bioaktywność. Cząsteczki bezpośrednio kodowane przez genom, takie jak kwasy nukleinowe, białka i peptydy pochodzące z białek przez rozszczepienie proteolityczne, z reguły nie są zawarte w ChEBI.

Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI)

logo ChEBI.png

Content

Description

Chemical database

Data types
captured

Small chemical compounds

Contact

Research center

European Molecular Biology Laboratory European Union

Laboratory

European Bioinformatics Institute United Kingdom

Primary citation

de Matos et al

Access

Website

www.ebi.ac.uk/chebi

Download URL

ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi

Web service URL

www.ebi.ac.uk/chebi/webServices.do

Sparql endpoint

BIO2RDF

Tools

Web

www.ebi.ac.uk/chebi

różne

data release
częstotliwość

miesięczny

Polityka kuratorska

ręcznie kuratorowana

chebi stosuje nomenklaturę, symbolikę i terminologię zatwierdzoną przez Międzynarodową Unię Chemii Czystej i Stosowanej (IUPAC) oraz Komitet ds. nomenklatury Międzynarodowej Unii biochemii i biologii molekularnej (NC-iubmb).

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.