ChEBI

Chemical Entities of Biological Interest, ook bekend als ChEBI, is een chemische database en ontologie van moleculaire entiteiten gericht op ‘kleine’ chemische verbindingen, die deel uitmaakt van de Open Biomedische ontologieën (OBO) inspanning van het European Bioinformatics Institute (EBI). De term “moleculaire entiteit “verwijst naar elk” constitutioneel of isotopisch onderscheiden atoom, molecuul, ion, ion paar, radicale, radicale ion, complex, conformer, enz., identificeerbaar als een afzonderlijk te onderscheiden entiteit”. De moleculaire entiteiten in kwestie zijn producten van de natuur of synthetische producten met een potentiële bioactiviteit. De Molecules die direct door het genoom, zoals nucleic zuren, proteã nen en peptides worden gecodeerd die van proteã nen door proteolytic splitsing worden afgeleid, zijn in de regel niet inbegrepen in ChEBI.

Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI)

ChEBI logo.png

Content

Description

Chemical database

Data types
captured

Small chemical compounds

Contact

Research center

European Molecular Biology Laboratory European Union

Laboratory

European Bioinformatics Institute United Kingdom

Primary citation

de Matos et al

Access

Website

www.ebi.ac.uk/chebi

Download URL

ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi

Web service URL

www.ebi.ac.uk/chebi/webServices.do

Sparql endpoint

BIO2RDF

Tools

Web

www.ebi.ac.verenigd koninkrijk/chebi

Overige

Data-release
frequentie

maandelijks

Curation beleid

Handmatig samengesteld

ChEBI gebruikt nomenclatuur, symboliek en terminologie goedgekeurd door de International Union of Pure and Applied Chemistry (IUPAC) en de nomenclatuur comité van de Internationale vereniging voor Biochemie en Moleculaire Biologie (NC-IUBMB).

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.