Sir C. Wyville Thomson, i full Sir Charles Wyville Thomson, (født 5. Mars 1830, Bonsyde, West Lothian, Skottland-døde 10. Mars 1882, Bonsyde), Skotsk naturalist som var en av de første marine biologene som beskrev livet i havdypet.Etter å ha studert medisin ved Universitetet I Edinburgh foreleste Thomson i botanikk Ved University Of Aberdeen (1850-51) Og Marischal College (1851-52), men konsentrerte seg i økende grad om zoologi etter at Han ble utnevnt til chairs of natural history i Cork og Belfast (1853-68), I Irland.Da Han ble utnevnt til professor i naturhistorie Ved Edinburgh (1870), Hadde Thomson allerede vendt sin oppmerksomhet utelukkende til studiet av marine hvirvelløse dyr. Ombord på to dybhavs mudringsekspedisjoner nord for Skottland (1868-69) oppdaget han et bredt utvalg av hvirvelløse livsformer—mange tidligere antatt utdøde-til en dybde på 650 favner. Han fant også at dyphavstemperaturer ikke er så konstante som det hadde vært antatt, noe som indikerer tilstedeværelsen av havsirkulasjon. Thomson beskrev disse funnene i Havets Dyp (1873).

I 1872 la han ut på en utforskning ombord HMS Challenger. Mannskapet gjorde observasjoner og sonderinger av de tre store havbassengene på 362 stasjoner under en svært vellykket jordomseiling på 68 890 nautiske mil (127 600 kilometer). Thomson ble adlet da han kom tilbake i 1876.