Chauncy ble født inn i eliten Puritanske kjøpmann klasse som styrte Boston, Massachusetts. Hans oldefar, Charles Chauncy, etter hvem han ble kalt, var Den andre presidenten I Harvard College. Hans far var en Vellykket Kjøpmann I Boston. Chauncy ble utdannet Ved Boston Latin School og Ved Harvard, hvor han fikk både sin lavere grad og sin mastergrad i teologi. I 1727 Ble Chauncy ordinert som assisterende minister For Bostons Første Kirke, den eldste Congregational church i byen og en av De viktigste I New England. I 1762 Ble Chauncy pastor I First Church. Han tjente menigheten i 60 år til sin død.Chauncy var en motstander av Den Første Store Oppvåkning, som splittet Menighetskirkene mellom Gamle Lys og Nye lysfraksjoner. Som leder av De Gamle Lys, Chauncy snakket ut mot religiøs entusiasme hisset opp av vekkelse predikanter. Chauncy var også leder av opposisjonen mot å utnevne En Anglikansk biskop for De Amerikanske koloniene. Under Den Amerikanske Revolusjonen støttet Han Patriotenes sak gjennom prekener og pamfletter. Ifølge religiøse studier lærde Norman Og Lee Gibbs fortjener Chauncy tittelen «teolog av Den Amerikanske Revolusjonen».Chauncy var et charter medlem Av American Academy Of Arts And Sciences (1780) og ble tildelt en honorary Doctor Of Divinity grad fra University Of Edinburgh. Han ble anerkjent av Massachusetts Historical Society (da hans portrett ble hengt der) som «eminent for sine talenter, læring, og elsker av frihet, sivile og religiøse.»