キャピラリー電気泳動

キャピラリー電気泳動による自動DNAシークエンシング

放射性標識または蛍光ジデオキシ配列決定反応の生成物の分離は、歴史的に、例えば96レーンabi377で使用される種類のポリアクリルアミドスラブゲル この方法の欠点には、シーケンシング実行ごとに新鮮なゲルを調製する必要性、ゲルへのサンプルの手動ロード、比較的長い実行時間（8-10時間1kb DNA断片の解

別の分離方法は、キャピラリー電気泳動を使用します。 一連の標準的なジデオキシDNA配列決定反応が、それぞれ8行x12列96ウェル板の一つのウェルに調製される。 シリーズの超薄型キャピラリーチューブ(0.穴の中の1つのmm、50~80cmの長さは樹脂のビードの混合物で）満ち、複数の毛管配列に置かれます。 アレイの一端は、負に帯電した陰極板に取り付けられ、それらの端部が試料板の各ウェルと整列するようになる。 高電圧を印加すると、各サンプルウェル中の標識されたDNAが対応する毛細管に入り、正に帯電したアノードリザーバに向かって移動する。 使用される高い電圧のために電気泳動の分離は1~3hrsだけ要求します。 スラブ-ゲル電気泳動と同様に，小さい断片は大きい断片よりも速く移動する。 端ラベルの染料は探知器の窓のレーザーによって活動化させ、各片の蛍光性の波長は測光器によって固定点を渡すと同時に読まれます。 平板のゲルシステムとは違って、レーザーおよび光度計は固定および不動で、別のデータ-ストリームとして多数の並んだ毛管を同時に活動化させ、読むことが 移動性データはコンピュータに送られ、平板のゲルシステムのそれらと本質的に同一である各サンプルのためにクロマトグラムは発生する。

キャピラリーシーケンサーは、通常、ロボットを使用してサンプルプレートのスタックを自動的にロードします。 毛管配列は版間の緩衝と機械が多くの操業のために監督無しに動くために残すことができるように、洗い流されます。 最大の施設では、PCR反応は、数十または数百のキャピラリーシーケンサーにサービスを提供するロボットワークステーションのシーケンシングプレートに直接 クロマトグラムデータはサーバー上に配置され、ユーザーが数百または数千マイル離れてダウンロードすることができます。 規模の経済性は、社内の機械を購入、維持、人員配置するのではなく、DNA配列決定を外部委託することをより安くすることができます。