ChEBI

Chemical Entities of Biological Interest, noto anche come ChEBI, è un database chimico e ontologia di entità molecolari focalizzate su “piccoli” composti chimici, che fa parte dello sforzo aperto Biomedical Ontologies (OBO) presso l’Istituto Europeo di Bioinformatica (EBI). Il termine “entità molecolare” si riferisce a qualsiasi ” atomo costituzionalmente o isotopicamente distinto, molecola, ion, coppia di ioni, radicale, ion radicale, complesso, conformatore,ecc., identificabile come entità distinguibile separatamente”. Le entità molecolari in questione sono prodotti della natura o prodotti sintetici che hanno potenziale bioattività. Le molecole direttamente codificate dal genoma, come acidi nucleici, proteine e peptidi derivati da proteine mediante scissione proteolitica, non sono di regola incluse in ChEBI.

Entità chimiche di interesse biologico (ChEBI)

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Content

Description

Chemical database

Data types
captured

Small chemical compounds

Contact

Research center

European Molecular Biology Laboratory European Union

Laboratory

European Bioinformatics Institute United Kingdom

Primary citation

de Matos et al

Access

Website

www.ebi.ac.uk/chebi

Download URL

ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi

Web service URL

www.ebi.ac.uk/chebi/webServices.do

Sparql endpoint

BIO2RDF

Tools

Web

www.ebi.ac.uk/chebi

Varie

Data di rilascio di
frequenza

mensile

Curation politica

Manualmente a cura di

ChEBI utilizza la nomenclatura, simbologia e la terminologia approvato dall’Unione Internazionale di Chimica Pura e Applicata (IUPAC) e il comitato della nomenclatura dell’Unione Internazionale di Biochimica e Biologia Molecolare (NC-IUBMB).

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