Poli [n]katenánok: molekuláris összekapcsolt láncok szintézise

egy kis cink a gyűrűket összekapcsolja

bár a polimer szálakat gyakran informálisan láncoknak nevezik, a molekuláris topológiák, amelyek valóban hasonlítanak a kiterjesztett makroszkopikus láncszemekre, meglepően nehéznek bizonyultak. A legtöbb megközelítés úgy döntött, hogy összekapcsolt gyűrűk párjait köti össze a távtartó szegmensek között. Wu et al. most jelentse be a polikatenánok sikeres szintézisét, amelyben tíz gyűrű van egymás után összekapcsolva. A kulcs az volt, hogy cinkionokat használtak az egyik makrociklus prekurzor menetének sablonozására az előformázott makrociklusokon keresztül, majd a metatézis katalízis lezárta az első gyűrűt, és a fém kiöblíthető.

tudomány, ez a szám p. 1434

absztrakt

mivel a mechanikusan összekapcsolt molekulák makromolekuláris változata, a mechanikusan összekapcsolt polimerek ígéretes jelöltek kifinomult molekuláris gépek és intelligens puha anyagok létrehozására. A polikatenánok, ahol a molekuláris láncok kizárólag egymásba kapcsolt makrociklusokból állnak, a topológiai kötések egyik legnagyobb koncentrációját tartalmazzák. Itt beszámolunk egy szintetikus megközelítésről ennek a megkülönböztető polimer architektúrának a magas hozamában (~75%) a racionálisan tervezett metalloszupramolekuláris polimerek hatékony gyűrűzárásával. A frakcionált minták fényszórási, tömegspektrometriás és magmágneses rezonancia jellemzése támogatja a nagy moláris tömegtermék hozzárendelését (szám-átlagos moláris tömeg ~21.4 kg / MOL) lineáris polikatenánok, elágazó polikatenánok és ciklikus polikatenánok keverékéhez. Megnövekedett hidrodinamikai sugarat (oldatban) és üveg átmeneti hőmérsékletet (ömlesztett anyagokban) figyeltek meg a Zn-vel történő metallálás során2+.

a mechanikusan összekapcsolt molekulák (Mim-ek), mint például a katenánok, a rotaxánok és a csomók, egyre nagyobb figyelmet kapnak esztétikai topológiai szerkezetük (1-3) és a molekuláris gépektől (4) a katalízisig (5), a gyógyszeradagolásig (6) és a kapcsolható felületekig (7) terjedő alkalmazásokban rejlő lehetőségeik miatt. A kis molekulájú Mim-ek lenyűgöző tömbjét sikeresen szintetizálták, elsősorban a prekurzor komponensek megfelelő orientálásával egy nem kovalens sablonozó esemény révén, amely például fém-ligandum (1, 2, 8-10), donor-akceptor (11) vagy hidrogénkötés (12) kölcsönhatásokat vagy hidrofób hatást (3) alkalmaz, amelyet kovalens rögzítési lépés követ. A nagy moláris tömegű Mim-ek vagy mechanikusan összekapcsolt polimerek (MIPS), mint például a polirotaxánok és a polikatenánok, hozzáférést biztosítanak a funkcionális lágyanyag-platformok hasznos tulajdonságaihoz (13). Talán az eddigi legnevezetesebb példát a csúszógyűrűs gélek (a polirotaxánok egy részhalmaza), ahol a mechanikusan összekapcsolt gyűrűk mobil térhálósító helyekként működnek. Ezek az anyagok karcolásgátló és gyógyító tulajdonságokkal rendelkeznek, és sikeresen alkalmazták karcolásgátló bevonatként mobiltelefonok és autók számára (14). Amint azt ez a példa is kiemeli, a MIPS szokatlan mobilitási elemei (pl., alacsony energiájú gát a gyűrű csúszásához egy szál mentén vagy a gyűrűk forgatásához) a polimerek speciális osztályává teszik őket, azzal a potenciállal, hogy nagyon szokatlan tulajdonságmátrixot jelenítsenek meg.

a Katenánok n egymás után egymásba illeszkedő gyűrűből állnak. A polikatenánok olyan polimer láncok, amelyek teljes egészében összekapcsolt gyűrűkből állnak, és olyan katenánoknak tekinthetők, amelyeknél n nagy, és általában diszpergálhatósággal rendelkezik! > 1. Ezek az összekapcsolt polimerek nagyon nagy koncentrációban tartalmaznak topológiai kötéseket, és egy makroszkopikus lánc molekuláris ekvivalensének tekinthetők (ábra. 1A). Az ilyen szerkezetek megtartják rugalmasságukat, függetlenül a gyűrűkomponensek merevségétől, topológiai szerkezeteik konformációs mobilitása miatt, lehetővé téve mind a nagy szilárdság, mind a kiváló rugalmasság elérését. Az 1B. ábra mutatja a fő konformációs mozgásokat (forgási, megnyúlási és lengési mozgások) egy ilyen lánc gerinc ismétlődő egységében a megfelelő gyűrűméretekhez (13). Elméleti tanulmányok azt sugallják, hogy az ilyen mobilitási elemekkel rendelkező polikatenánok nagy veszteségmodulust és alacsony aktiválási energiát mutathatnak az áramláshoz, és potenciálisan kiváló energia-csillapító anyagként és/vagy elasztomerként működhetnek, kiváló szívóssággal és ingerekre reagáló mechanikai tulajdonságokkal (13, 15, 16).

ábra. 1 A polikatenánok szerkezete és konformációs mobilitása és szintetikus megközelítése.

(a) A polikatén architektúra sematikus ábrázolása, amely egy robusztus és rugalmas fémlánc molekuláris megfelelőjének tekinthető. B) a katenánokban megfigyelt közös konformációs mozgások. C) A Gyűrű forgási mozgásának összehasonlítása poli(katenán) versus polikatenán. D) A polikatenán 3 célzott szintézise az 1.és 2. metalloszupramolekuláris polimerré (MSP) történő összeszerelés útján, majd gyűrűzárás polikatenát (azaz metallált polikatenán) és demetallálás céljából. E) 1, 2 és 4 szerkezete (1 gyűrűs zárt szorzata). Néhány kulcsfontosságú protont 4-es kék nagybetűvel, 2-es piros kisbetűvel jelölnek. A doboz kiemeli a BIP ligandumrész szerkezetét.

a polikatenánok szintézise azonban nagy kihívást jelent. Ezeknek a nagy moláris tömegű polimer topológiáknak a megerősített szintéziséről még nem számoltak be. A polikatenánokkal kapcsolatos korábbi munkák nagy része a poli(katenán)s-re (általában bisz – funkcionalizált katenán polimerizálásával érhető el) (15, 17-23), a poli-és oligokatenánokra (24, 25), valamint a polimer katenánokra (azaz két összekapcsolt ciklikus polimerre) (26) összpontosított. Ezek az anyagok betekintést nyújtottak a MIPS potenciálisan hasznos tulajdonságaiba. Például a poli (katenán) s konformációs rugalmasságot mutatott a polimer lánc mentén oldatban (ezt a Kuhn szegmens hossza jelzi, amely rövidebb, mint a katenánrész hossza) (15), valamint a gyűrűk hőmérsékletfüggő mozgását oldatban (18) vagy ömlesztett anyagokban (22). A poli(katenán) gerincben jelen lévő kovalens összekötő egységek miatt azonban a katenán részekben a gyűrűkomponensek forgásának mértéke korlátozott (ábra. 1C). A polikatenánok gyűrűi viszont kizárólag topológiai kötésekkel vannak összekötve, lehetővé téve minden gyűrű teljes forgási mobilitását (elegendő gyűrűmérettel), és mint ilyen, nagyobb konformációs rugalmasságot kell mutatniuk. Az oligokatenánok legalább hét összekapcsolt gyűrűvel való elérésének egyik legsikeresebb kísérletét a közelmúltban Meijer, Di Stefano és munkatársai a metallo-catenanes gyűrűnyitó polimerizációjával érték el (25). A termék egyedi architektúráját azonban nem lehetett egyértelműen meghatározni. A mai napig a leghosszabb összekapcsolt molekuláris lánc egyértelműen meghatározott szerkezettel egy lineáris katenán (olympiadane), amelyet Stoddart és munkatársai jelentettek (27), újabban pedig Iwamoto et al. (28), mindkettő lépésenkénti megközelítéssel. Stoddart és munkatársai szintén hasonló stratégiát alkalmaztak egy elágazó katenán eléréséhez (29). Ezek a lépésenkénti stratégiák azonban nem hatékony módszerek a hosszú láncú polikatenánok szintézisére. A polikatenánok szintézisének egyik fő kihívása a makrociklusok (alacsony koncentrációt igénylő) és a polimerek (magas koncentrációt igénylő) eléréséhez szükséges ellentétes reakciófeltételek. Takata, Kihara és munkatársai elegáns megoldást javasoltak erre a konfliktusra egy áthidalt poli(katenán) átalakításával polikatenánná (20), de a mai napig nincs jelentés ezen az úton szintetizált polikatenánról.

a szintetikus stratégia felé polycatenanes itt vázolt, illusztrált ábra. Az 1D célja a fent említett, egymásnak ellentmondó szintetikus követelmények szétválasztása egy metalloszupramolekuláris polimer (MSP) mint sablon előszerelésével, majd egy hatékony gyűrűzáró reakcióval és a kapott metallált polikatenán demetallálásával. A Sauvage és munkatársai által úttörő fém-ligand koordináció az egyik legsikeresebb szintetikus út a MIMs felé (1, 2, 8, 9). A terdentát ligandum, 2,6-bisz(n-alkil-benzimidazolil)piridin (Bip) (ábra. 1E), amely megköti az átmeneti fémionokat, például a Zn-T2+ vagy Fe2+ egy 2-ben:1 sztöchiometria, azért választottuk, mert már kimutatták, hogy a funkcionális metalloszupramolekuláris polimerek széles választékához fér hozzá, amelyek fotógyógyító (30), ingerekre reagáló (31), alakmemória (32) és működtető tulajdonságokkal rendelkeznek (33). Továbbá a közelmúltban megmutattuk, hogy a katenánok egy monotópos BIP-tartalmú makrociklusból összeállított pszeudorotaxán közel kvantitatív gyűrűzáró reakciójával érhetők el, Zn2+, és egy ditópos szál (1 R = hexil) 2:2:1 arányban (9).

ezekre a tanulmányokra építve a racionálisan megtervezett 68 tagú ditopic BIP makrociklus 2 MSP összeállítását céloztuk meg az 1 menetes molekulával, majd az azt követő 1 gyűrűzárással (ábra. 1E). Miután 2 ekvivalens Zn2+-t adtunk az 1:1 arányú 1 és 2 keverékhez, a komponensek önállóan összeálltak a váltakozó szupramolekuláris kopolimerbe . A váltakozás a maximális helyfoglaltság elvének következménye (34): két Bip-rész ugyanabban (vagy különböző) makrociklusban 2 nem tudja megkötni ugyanazt a Zn2 + iont; ezért a 2-ben lévő minden Bip-egységnek 2:1 Bip-t kell alkotnia:Zn2 + ionkomplex Bip egységgel az 1-ben az entalpikus nyereség maximalizálása érdekében (ábra. S2). Az MSP kialakulását diffúziós rendezett spektroszkópia (DOSY) igazolta (ábra. S3). A nagy kötési állandó (>106 m–1 acetonitril) a Bip és a Zn között2+ (35) fenntartja az MSP-t a gyűrűzáró reakció elősegítéséhez szükséges viszonylag híg körülmények között (bár a ciklikus MSP-ket nagyon híg körülmények között kell előnyben részesíteni). A gyűrűzáró metatézis reakció kiváló olefin konverziót mutatott 2,5 mM-nél (az 1-hez képest) (ábra. S4), és a kapott reakcióelegyet tetrabutilammónium-hidroxiddal könnyen demetallálhatjuk. A 2A. ábra a demetallált nyerstermék részleges 1H NMR spektrumának összehasonlítását mutatja (A ha / a piridil-protonokra összpontosítva) az összes lehetséges nem-blokkolt melléktermékkel 4 (az 1-ből nyert makrociklus), 2 és 5 . A nyerstermék HA / a csúcsainak többsége olyan upfield kémiai eltolódást mutat, amely nem felel meg a lehetséges nem egymásba zárt Fajok egyikének sem, de jó összhangban van a Bip-tartalmú katenánokkal (9) kapcsolatos korábbi vizsgálatokban megfigyelt kémiai eltolódásokkal, összhangban az összekapcsolt struktúrák kialakulásával. A nyerstermék kis százalékban (~20%) tartalmaz olyan nem interinterlokált molekulákat is, amelyeket a reakció nélküli 2-hez és a polimer/oligomer 5-hez rendeltek az 1H NMR kémiai eltolódásuk alapján.

ábra. 2 NMR a polikatenánok jellemzése és tisztítása.

(a) A tisztított polikatenán HA/a tartományának részleges 1H NMR (600 MHz, CDCl3) spektruma a 2.és 4. egyedi gyűrű és az admet 5. melléktermék spektrumával összehasonlítva (a szerkezetet lásd az ábrán. S5). A sárga régió kiemeli az összekapcsolt Bip-csoportoknak megfelelő protonokat. B) Polikatenánok kromatográfiamentes tisztítása szelektív fémezéssel és extrakcióval. (C) a tisztított polikatenánoldat részleges 1h-1h NOESIÁS spektruma (1% w/v CDCl3-ban) -17 ca-nál mérve. Néhány NOE keresztcsúcs a 2 és 4 rész között kiemelve van. Piros és kék betűk, mint az ábrán. 1E. a teljes spektrum, lásd ábra. S13.

a nem blokkolt melléktermék könnyű eltávolításához kidolgoztunk egy eljárást (ábra. 2B), amely kihasználta a célzott polikatenán előre szervezett összekapcsolt szerkezetét. Az összekapcsolt ligandumhatás szerint (pl., a catenand-effektus) (8, 36), a fémionok előnyösen mechanikusan összekapcsolt ligandumokkal kötődnek, nem pedig nem összekapcsolt szabad ligandumokkal, a ligandumok összehozásának csökkent entrópiai költsége miatt. 1H NMR titrálási vizsgálatok (ábra. S5B) megerősítette, hogy a Zn hozzáadásakor2+ a nyers termékhez, az upfield-eltolódott piridil protonokhoz kapcsolódó fajok eltűnnek, amikor a Bip-részek ~70% – a metallizálódik, összhangban az összekapcsolt Fajok szelektív újraszerelésével. A nem összekapcsolt melléktermékek fém nélkül maradtak, lehetővé téve számukra, hogy szilárd-folyadék extrakcióval (2:1 v/v kloroform/hexán) könnyen elválaszthatók legyenek, így a tiszta polikatenán 3 szilárd anyagként ~75% – os hozamban marad. Ez a tisztítási lépés eltávolít néhány oligomer összekapcsolt terméket is, elsősorban az összekapcsolt fém-ion kötő helyek kisebb száma miatt, így statisztikailag kevésbé valószínű, hogy elegendő fémionot kötnek meg oldhatóságuk megváltoztatásához.

a 3 összekapcsolt termék összes NMR-csúcsát kétdimenziós NMR-vizsgálatok alapján rendelték hozzá (ábra. S6-tól S8-ig). A spektroszkópia megerősíti, hogy 3 tartalmaz ~50% makrociklus 2 és ~50% egy komponens (vagy komponensek) származó 1 (alapján 1H NMR integráció) (ábra. S10), amely összhangban van a célzott váltakozó polikatenán szerkezet kialakulásával. Az összekapcsolt szerkezetet tovább erősíti a nukleáris Overhauser-effektus spektroszkópia (NOESY) (ábra. 2C). A hőmérséklet csökkentése (-17 C) a gyűrűmozgások csökkentése érdekében a polikatenánban számos NOE keresztcsúcsot eredményez híg (1% m/v) oldatokban 3. Különösen érdekesek az interkomponensű noe keresztcsúcsok a protonok között a különböző makrociklusokban (2 és 4). Legalább négy interkomponensű noe keresztcsúcsot—köztük például egyet a 4—es HL és a 2-es Hn/o között-figyeltek meg 3-ban (ábra. 2C), de nem a 2 és 4 vagy 2 és 5 egyszerű keverékeiben (ábra. S11 és S12). Mivel a NOE jelek általában megkövetelik, hogy a protonok <0,5 nm távolságra legyenek egymástól, ezek az adatok erősen azt sugallják, hogy a 2.és 4. makrociklust össze kell kapcsolni, és hogy a 3 polikatenán.

miután megerősítettük az összekapcsolt szerkezetet, a polimerek (37) abszolút móltömegének mérésére ezután egy többszögű fényszóró (GPC-MALS) detektorhoz kapcsolt gél permeációs kromatográfiát használtunk. A GPC kromatogramja 3 (ábra. 3A, fekete vonal) egy széles csúcsot mutat, amely megfelel az mn = 21,4 kg/mol átlagos móltömegnek és a diszpergáltság = 1,44 (1. táblázat). Minden elúciós térfogatnál az abszolút moláris tömeget piros szaggatott vonallal mutatjuk be, jelezve, hogy a 3 termékeloszlás ~200 kg/mol moláris tömegű fajokat tartalmaz, ami polikatenánnak felel meg. A kromatogram széles csúcsának dekonvolúciója három alpontot eredményez (I – III), ami azt jelenti, hogy a polikatenán termék három különböző architektúrát tartalmazhat. E három csúcs mért abszolút moláris tömege (MALS-tól) körülbelül 20-200, 10-40 és 6-10 kg/mol, ami megfelel a polikatenánoknak, polikatenánoknak és polikatenánoknak. A három csúcs relatív százalékos arányát (a csúcsterületek alapján) 28, 61, illetve 11% – ra becsülik.

ábra. 3 Moláris tömeg és a polikatenánok építészeti jellemzése.

(a) GPC kromatogram, MALS abszolút moláris tömegmérés, és a csúcs dekonvolúció 3. a. U., tetszőleges egységek. (B) javasolt architektúrák, amelyek megfelelnek a három dekonvolutált csúcsnak, a kialakulási mechanizmusnak és a megfelelő átlagos láncvégek számának (NC). RCM, gyűrűzáró metatézis. C) a frakcionált polikatenánfrakciók GPC-kromatogramjai (3A-3D, intenzitásuk relatív tömegszázalékukkal normalizálva) a nem frakcionált polikatenán 3 KROMATOGRAMJAIHOZ képest. A három dekonvolutált csúcs (I-III) elúciós térfogattartománya is látható. (D) A 3B polikatenán frakció MALDI-TOF spektruma. az alsó csúcsok (csillagokkal jelölve) többszörösen töltött molekuláris ionokból származnak. m / z, tömeg / töltés arány. (E) részleges 1H NMR (500 MHz, CDCl3) spektrumok, amelyek a 3a-3d HA/a tartományát mutatják a két kontrollhoz képest: katenán (6) és ciklikus polikatenán (7). A négy régió ( ~ ,~,~,~) meg van határozva. A láncvégi csúcsok és a ciklikus katenánok specifikus csúcsai sárga, illetve zöld színnel vannak kiemelve.

1. táblázat moláris tömege és architektúrája 3 és 3a-3d.

Mn, szám-átlagos moláris tömeg; DP, polimerizációs fok; GmbH, diszperzió; NC, láncvégek átlagos száma; ncex, aciklusos polikatenánok átlagos láncvégeinek száma.

beágyazott kép
a táblázat megtekintése:

  • View popup
  • View inline

az I-III csúcsok egyik lehetséges magyarázata az elágazó, lineáris és ciklikus architektúrák kialakulása, az ábrán látható módon. 3B. a célzott lineáris polikatenánok mellett minden bizonnyal lehetséges, hogy interchain reakciók (dimerizáció és 4 oligomerizációja) fordulhatnak elő, ami nagyobb moláris tömegű elágazó polikatenánokhoz vezet. Továbbá az is lehetséges, hogy az MSP–k egy százaléka alacsonyabb moláris tömegű ciklikus szerkezet, ami viszont ciklikus polikatenánokhoz vezetne. A ciklikus polikatenánokra utaló egyik bizonyíték a II. és III. csúcsok közötti megfigyelt átmeneti csúcs az abszolút moláris tömegmérés során (ábra. 3A, ~9,2 ml-nél). Ha a III. csúcs megfelel egy ciklikus geometriának, akkor azt várnánk, hogy ezek a kompaktabb szerkezetek együtt eluáljanak alacsonyabb moláris tömegű lineáris polimerekkel (38).

a polikatenán keverék teljesebb jellemzése érdekében preparatív GPC-t végeztünk 3-on, négy 3A-3d frakciót kapva. 1H NMR vizsgálatok megerősítették, hogy mind a négy frakció ~50% makrociklust tartalmaz 2, összhangban azzal, hogy mindegyik polikatenán (ábra. S14). Az egyes frakciók GPC-mal-Jai megerősítették a sikeres méretalapú elválasztást (ábra. 3C és fig. S15), és a négy frakció csökkenő moláris tömeget mutatott (1.táblázat), viszonylag keskeny (1,11-1,18) (1. táblázat) mellett. Az elúciós idők alapján a 3a és 3b frakciók többnyire az I. csúcsnak felelnek meg, a 3c túlnyomórészt a II. csúcsnak felel meg, a 3D pedig a II.és III. csúcsok keverékét tartalmazza. a Mátrix-asszisztált lézeres deszorpciós/ionizációs repülési idő (MALDI–TOF) tömegspektrometria megerősítette a nagy moláris tömegű polimerek jelenlétét, amelyek molekuláris ioncsúcsai legfeljebb a 3B polikatenánnak felelnek meg (ábra. 3D), és akár egy polikatenán 3C (ábra. S16).

a polikatenánok architektúráinak (elágazó, lineáris vagy ciklikus) jellemzésének egyik módja a 3a-3D frakciókban a polimerek láncvégeinek átlagos számának (NC) tisztázása az egyes frakciókban. Definíció szerint az NC a ciklikus polikatenánok esetében 0, a lineáris polikatenánok esetében 2, az elágazó polikatenánok esetében pedig 4 (ábra. 3B). A MALS-ból rendelkezésre álló egyes frakciók abszolút móltömege mellett polimerizációs fokuk (DPs, amelyet itt N-vel egyenértékűnek határozunk meg) könnyen kiszámítható az mmal/1544-gyel (az eredményeket az 1.táblázat tartalmazza), ahol az mmal-ok a GPC-mal-ok móltömege, az 1544 g/mol pedig a 2 és 4 átlagos móltömege (feltételezve, hogy a polimerben 1:1 arány van). Ezután lehetséges az NC kiszámítása ezen adatok kombinálásával NMR lánc-vég elemzés (eq. S1). Az ilyen számítások kulcsa a polikatenánok diagnosztikai láncvégi csúcsainak megtalálása az 1H NMR spektrumban. Ehhez egy (túlnyomórészt) 6 katenánt céloztunk meg és szintetizáltunk úgy, hogy 1-et reagáltattunk 2 és Zn2+ ionok két ekvivalensének jelenlétében (ábra. S17), és NMR spektrumát összehasonlítottuk a 3a-3d-vel az ábrán. 3E. a három csoport csúcsok HA/a 6 ~ 1: 1: 1 csúcs területek (ábra. S17) volt megfigyelhető, és a következő régiókat határozták meg: (8,235-8,270 oldal / perc), (8,195-8,235 oldal / perc) és (8,150-8,195 oldal / perc). A 3a-tól 3D-ig terjedő tartományok alacsonyabb intenzitása, összehasonlítva a 6-os intenzitással, valamint a protonok hosszabb NMR relaxációs ideje a régióban (ábra. S18), megerősíti, hogy ez a régió megfelel a lánc végének (lásd kiegészítő anyagok). Ezzel a hozzárendeléssel a láncvégek átlagos száma, NC, kiszámítható Eq-val. 1beágyazott kép (1)ahol IA/a A HA/a teljes csúcsintegrációja, Ia pedig a ha/a lánc-vég csúcsintegrációja (azaz régió (region)). S1-S3 a levezetés részleteihez). A 3-as és 3a-3D-s NC-számítások eredményeit az 1. táblázat foglalja össze. A 3a (NC = 8,7) és a 3B (NC = 4,7) frakciók túlnyomórészt elágazóak, míg a 3c (NC = 1,7) és a 3D (NC = 1.2) Úgy tűnik, hogy különböző mennyiségű ciklikus polikatenánt tartalmaz, amelyek eredményeként NC < 2. A ciklikus polikatenánok arányának azonosítása ez utóbbi frakciókban, további vizsgálatokat végeztek a ciklikus polikatenán célzott megcélzására 7. Ezt MSP képződéssel (Fe2+ fémion felhasználásával) és gyűrűzáró reakcióval érték el sokkal alacsonyabb koncentrációban (lásd kiegészítő anyagok és ábra. S19). A HA / a régió összehasonlítása az 1H NMR spektrumban (ábra. 3e) a ciklikus polikatenánt tartalmazó frakciók (3C, 3D, és 7) további upfield eltolódást mutat 8,06-8,15 ppm-re (ábra. 3e, zöld régió), amelyet régióként határoznak meg. Ezzel szemben az aciklusos polikatenánt tartalmazó minták (3a, 3b és 6) nem rendelkeznek csúcsokkal ebben a régióban. Ezért ésszerű azt a következtetést levonni, hogy a régió a ciklikus polikatenánokra jellemző. Összehasonlítva az aciklusos polikatenánokkal (3a és 3b) vagy a catenane 6-tal, úgy tűnik, hogy a ciklikus polikatenán 7 A/a csúcsainak ~50% – a eltolódott felfelé. Az egyik lehetséges magyarázat az, hogy a ciklikus architektúra korlátozza a konformációs mobilitást ,ami kompaktabb molekulát eredményez (ábra. S19E), és lehetővé teszi a szomszédos aromás részek további árnyékoló hatásait. Tekintettel arra, hogy a HA/a integrálja a 7-ben azt mutatja, hogy HA/a protonjainak ~50% – a van jelen a 6. S20), meg lehet határozni az egyes frakciókban jelen lévő aciklusos polikatenánok (NCEx) láncvégeinek átlagos számát Eq-val. 2 (a levezetést lásd: eqs. S3 S5)Embedded Image(2)amennyiben Iδ a csúcs integráció a δ régióban az NMR spektrumok (Fig. 3E). E számítások eredményei azt mutatják, hogy mind a 3c, mind a 3D ncex 2 (NC < 2), összhangban azzal a ténnyel, hogy mindkettő lineáris és ciklikus polikatenánok keverékét tartalmazza, a ciklikus polikatenánok százalékos aránya a 3C-ben és a 3D-ben ~15, illetve ~34% (EQ-n keresztül számítva. S6). Az 1. táblázat összefoglalja a 3 és a négy 3A-3D frakció moláris tömegét és építészeti adatait. A legnagyobb moláris tömegű (3a) frakciót erősen elágazó polikatenánokhoz rendeljük (MALS-elemzés alapján) (ábra. S15A) átlagos DP = 55. A 3B frakció alacsonyabb fokú elágazó polikatenánokból áll, átlagos DP = 25. A 3C és 3D frakciók főleg lineáris (néhány ciklikus) polikatenánokat tartalmaznak, legfeljebb 27 (átlagos DP = 11) (ábra. S15C) és 20 (átlagos DP = 8) (ábra. S15D) reteszelt gyűrűk, ill. A négy frakció adatai alapján megbecsülhetjük, hogy az elágazó, lineáris és ciklikus polikatenánok teljes százaléka ~24, ~60 és ~16%, ami jól illeszkedik a GPC csúcs dekonvolúciós eredményéhez (28, 61, 11%) (ábra. 3A). Ezek az adatok együttesen összhangban vannak azzal, hogy a polikatenán 3 elágazó polikatenánok, lineáris polikatenánok és ciklikus polikatenánok keveréke, körülbelül a fent említett arányokban.

ismert, hogy a fém sablonozással előállított catenánok metallo-érzékeny viselkedést mutatnak (36). Mint ilyen, ezeknek a polikatenánoknak a metallo ingerekre reagáló tulajdonságait mind oldatban, mind ömlesztve vizsgáltuk, az Rh hidrodinamikai sugár mérésével (ábra. 4A és fig. S21) és az üveg átmeneti hőmérséklete (Tg) (ábra. 4B és fig. S22). Zn2+ ionok hozzáadása a polikatenánokhoz zárolja a gyűrűk konformációs mozgását, ezáltal váltást vált ki egy nagyon rugalmas polimerről egy félmerev polimerre, ahol a rugalmasság elsősorban a tetraetilénglikol (TEG) részekből származik (ábra. 4A). Túlnyomórészt lineáris polikatenánok (3C, átlagos DP = 11) esetén a Zn2+ hozzáadása jelentős (~70%) Rh növekedést mutat 3,9-ről 6,6 nm-re (ábra. 4A). Ez az eredmény jól illeszkedik a metallált lineáris polikatenán összes atom molekuladinamikai szimulációihoz (lásd kiegészítő anyagok). A molekulákat az OPLS (optimized potentials for liquid simulations) all-atom erőtérrel (39) szimuláltuk 1,1,2,2-tetraklór-etán oldószerrel, és a polimer tulajdonságait erő-kiterjesztési kísérlet segítségével vizsgáltuk. A polikatenán feszültség alatt történő modellezéséhez a katenánt periodikus határfeltételek révén kötötték magához (ábra. 4C); a hosszabbítást a rendszer (doboz) hosszán keresztül hajtották végre, amelyet szisztematikusan változtattak; és a megfelelő feszültség a nyomástenzorból következik (eq. S9). Az erő-kiterjesztés viselkedését jól leírja az extensible worm-like chain (EWLC) modell (40), amint az ábrán látható. 4C. ezen értelmezés szerint az egyes makrociklusok hozzájárulása a kontúr hosszához, l = 2,40 ~ 0,03 nm, lényegesen kisebb, mint a perzisztencia hossza, lp = 7,46 ~ 2.88 nm, ami egy félig merev polimerre jellemző. Ismét ez a rugalmasság elsősorban a 2. makrociklus TEG szegmenseinek tulajdonítható, amint azt a 2-4 közötti intermetális távolságok nagyobb ingadozása bizonyítja (ábra. S28 és S29). A nem periodikus metallált katenán szimulációi alapján az Rh a végpontok közötti távolság (Ree) ~34%-a. Tetszőleges DP metallált polikatenánja esetén a Ree kiszámítható féregszerű láncstatisztikák (eq. S15) és az erő-kiterjesztési szimulációk eredményei. A 3C frakcióban lévő átlagos polikatenán Rh értéke tehát 6,89 6c (1).38 nm, jó összhangban a DLS eredményekkel (6,6 nm), tovább alátámasztva azt a következtetést, hogy a 3C frakció elsősorban lineáris polikatenán (lásd kiegészítő anyagok). A szimulált szerkezet egy metallált lineáris polikatenán alatt ~15 pN feszültség ábrán látható. 4D, amely 12 összekapcsolt gyűrű szegmensét mutatja.

ábra. 4 kísérleti vizsgálatok és szimuláció a metallált polikatenánok.

(a) A rugalmas és félmerev szerkezetek közötti lineáris polikatenán metallo-érzékeny konformációs változásának illusztrációja, amint azt a hidrodinamikai sugár (Rh) változása jelzi (ábra. S21). A fémezett polikatenán rugalmassága elsősorban a makrociklus TEG-részének köszönhető 2. (B) DSC adatok lineáris polikatenánokra (demetallált és metallált) összehasonlítva az ADMET polymer 5 adataival (TG félmagasság-középponttal számítva). Az “Exo Up” azt jelzi, hogy az exoterm hőáramlás iránya felfelé van. (C) szimulált erő-extension görbe által előállított változó a doboz hossza egy metallált lineáris katenán csatlakozik magát keresztül periodikus peremfeltételek A z irányban. A szimulációkból származó adatok (zöld körök, az adatpont mérete hibát tartalmaz) illeszkednek az extensible worm-like chain (EWLC) modellhez (fekete kötőjelek). (D) metallált lineáris polikatenán megjelenítése (12 összekapcsolt gyűrű szegmensét mutatva) ~15 pN feszültség alatt, 1,1,2,2-tetraklór-etán oldószerben végzett összes atomos molekuladinamikai szimulációkból (az oldószer és a hidrogénatomok az egyértelműség kedvéért kihagyva).

a lineáris polikatenánhoz hasonlóan az elágazó polikatenán (3B, átlagos DP = 24,9) Zn2+ metallációval történő metallálása ~50% – os Rh növekedést mutat (5,0-7,6 nm) (ábra. S21B), feltehetően a karjainak meghosszabbítása következtében. A ciklikus polikatenán 7 metallációja (átlagos DP = 6) csak viszonylag kis Rh változást mutat (~10%, 2,4-2,6 nm) (ábra. S21C), amely összhangban van a lánc meghosszabbítását korlátozó ciklikus architektúrájával. A túlnyomórészt lineáris (3C) és elágazó (3B) architektúrájú polikatenán Tg-értékei 97, illetve 104 C, szemben a 137 5-ös (1-es lineáris admet polimer) C-vel . Általánosságban elmondható, hogy a szegmentális mozgás nagyobb szabadságával rendelkező polimerek alacsonyabb Tg értékeket mutatnak, ami összhangban van a polikatenán gerinceken várható könnyebb konformációs molekuláris mozgásokkal. A Zn2+ metalláció rögzíti ezeket a konformációs mozgásokat, és jelentősen csökkenti a polikatenán rugalmasságát; mint ilyen, nem figyelhető meg Tg-érték 160C-ig történő melegítéskor mind a lineáris, mind az elágazó minták esetében (ábra. 4B és fig. S22).

összefoglalva: a főláncú polikatenánok sikeres szintézise MSP sablonos stratégiával ~75%-os hozammal érhető el. Az izolált termékkeverék lineáris polikatenánokat, elágazó polikatenánokat és ciklikus polikatenánokat foglal magában. Ez a szintetikus stratégia megnyitja az ajtót számos új összekapcsolt polimer tervezéséhez és szintéziséhez.

kiegészítő anyagok

www.tudományos magazin.org / tartalom/358/6369/1434/suppl / DC1

anyagok és módszerek

kiegészítő szöveg

füge. S1-S29

táblázatok S1-S3

hivatkozások (41-93)

http://www.sciencemag.org/about/science-licenses-journal-article-reuse

Ez egy cikk, amelyet a Science Journals Default License feltételei szerint terjesztenek.

hivatkozások és megjegyzések

  1. 6.szám
    1. K. S. Chichak,
    2. S. J. Cantrill,
    3. A. R. Pease,
    4. S.-H. Chiu,
    5. G. W. V. barlang,
    6. J. L. Atwood,
    7. J. F. Stoddart

    , molekuláris Borromean gyűrűk. Tudomány 304, 1308-1312 (2004). doi: 10.1126 / tudomány.1096914pmid:15166376

  2. 6.évfolyam
    1. J. J. Danon,
    2. A. KR .. D. A. Leigh,
    3. J. F. Lemonnier,
    4. A. J. Stephens,
    5. I. J. vitorica-yrezabal,
    6. S. L. woltering

    , nyolc kereszteződéssel molekuláris csomót fonva. Tudomány 355, 159-162 (2017). doi: 10.1126 / tudomány.aal1619pmid: 28082585

  3. 6. évfolyam
    1. N. Ponnuswamy,
    2. F. B. L. Cougnon,
    3. J. M. Clough,
    4. G. D. Panto,
    5. J. K. M. Sanders

    , szerves trefoil csomó felfedezése. Tudomány 338, 783-785 (2012). doi: 10.1126 / tudomány.1227032pmid:23139329

  4. 6.évfolyam
    1. S. Erbas-Cakmak,
    2. D. A. Leigh,
    3. C. T. McTernan,
    4. A. L. Nussbaumer

    mesterséges molekuláris gépek. Kémia. Rev. 115, 10081-10206 (2015). doi: 10.1021 / acs.chemrev.5b00146pmid: 26346838

  5. ons
    1. P. Thordarson,
    2. E. J. A. Bijsterveld,
    3. A. E. Rowan,
    4. R. J. M. Nolte

    , polibutadién Epoxidációja a topológiailag kapcsolt katalizátorral. Természet 424, 915-918 (2003). doi:10.1038/nature01925pmid:12931181

  • 6.évfolyam
    1. K. K. cot 6, M. E. Belowich, M. Liong, M. W. Ambrogio,
    2. Y. A. Lau,
    3. /it> H. A. Khatib,

    4. J. I. zink,
    5. N. M. khashab,

    6. J. F. Stoddart

    , gépesített nanorészecskék a gyógyszer szállításához. Nanoméretű 1, 16-39 (2009). pmid: 20644858

  • 6
    1. J. J. Davis,
    2. G. A. Orlowski, H. ritkán, P. D. Beer

    , mechanikusan összekapcsolt és kapcsolható molekulák a felületeken. Kémia. Joint. 46, 54-63 (2010). doi:10.1039/B915122Bpmid:20024293

  • 6.évfolyam
    1. C. O. Dietrich-Buchecker,
    2. J. P. Sauvage,
    3. J. P. Kintzinger

    , a molekulák új családja metallo-catenanes. Tetraéder Lett. 24, 5095-5098 (1983). doi: 10.1016/S0040-4039(00)94050-4

  • 6
    1. R. J. Wojtecki,
    2. Q. Wu,
    3. J. C. Johnson, D. G. Ray,
    4. L. T. J. Korley,
    5. S. J. Rowan

    , a 2,6-bisz(n-alkil-benzimidazolil)piridin-tartalmú katenátok képződésének optimalizálása komponens tervezéssel. Kémia. Sci. 4, 4440 (2013). doi:10.1039/c3sc52082j

  • GmbH,
  • H. Lahlali,
  • K. Jobe,
  • M. Watkinson,
  • S. M. Goldup
  • , a Makrociklus mérete számít: “kicsi” funkcionalizált rotaxánok kiváló hozammal a CuAAC segítségével aktív sablon megközelítés. Angew. Kémia. Int. Szerk. 50, 4151–4155 (2011). doi: 10.1002 / anie.201100415pmid:21462287

  • 6
    1. P. R. Ashton,
    2. T. T. Goodnow,
    3. A. E. Kaifer,
    4. M. V. Reddington,
    5. A. M. Z. Slawin,
    6. N. Spencer,
    7. J. F. Stoddart,
    8. C. Vicent,
    9. D. J. Williams

    , rendelésre készült Katenán. Angew. Kémia. Int. Szerk. Engl. 28, 1396–1399 (1989). doi: 10.1002 / anie.198913961

  • 6.évfolyam
    1. G. A. Breault,
    2. C. A. Hunter,
    3. P. C. Mayers

    , szupramolekuláris topológia. Tetraéder 55, 5265-5293 (1999). doi:10.1016/S0040-4020(99)00282-3

  • 6.szám,
    1. Z. Niu, H. W. Gibson

    , Polycatenanes. Kémia. Rev. 109, 6024-6046 (2009). doi: 10.1021 / cr900002hpmid: 19670889

  • 6
    1. Y. Noda,
    2. Y. Hayashi, K. Ito

    , a topológiai gélektől a csúszógyűrűs anyagokig. J. Appl. Polym. Sci. 131, 40509 (2014). doi: 10.1002 / kb.40509

  • ons
    1. J. L. Weidmann,
    2. J. Kern,
    3. J. P. Sauvage, D. Muscat, S. Mullins,
    4. W. K Enterprisehler,
    5. C. Rosenauer,
    6. H. J. R Xhamsterer,
    7. K. Martin,
    8. Y. Geerts

    , váltakozó topológiai és kovalens kötéseket tartalmazó Polikatenánok és ciklikus oligokatenánok: szintézis és jellemzés. Kémia 5, 1841-1851 (1999). doi: 10.1002/(SICI)1521-3765 (19990604)5:6<1841::AID-CHEM1841>3.0.CO; 2-Q

    1. T. Pakula,
    2. K. Jeszka

    , egyetlen komplex makromolekulák szimulációja. 1. A katenánok szerkezete és dinamikája. Makromolekulák 32, 6821-6830 (1999). doi:10.1021/ma990248c

  • 6.
    1. J. Weidmann,
    2. J. M. Kern,
    3. J. Sauvage,
    4. Y. Geerts,
    5. D. Muscat,
    6. K. M. Xhamllen

    , váltakozó topológiai és kovalens kötéseket tartalmazó polikatenánok. Kémia. Commun. 1996, 1243–1244 (1996). doi: 10.1039/CC9960001243

  • 6. évfolyam
    1. C. Hamers,
    2. F. M. Raymo,
    3. J. F. Stoddart

    , Főláncú és függő poli(katenán)s, amely komplementer, elektronban gazdag és hiányos komponenseket tartalmaz. Eur. J. Org. Kémia. 1998, 2109-2117 (1998). doi:10.1002/(SICI)1099-0690(199810)1998:10<2109::TÁMOGATÁS-EJOC2109>3.0.CO;2-M

    1. D. Muscat,
    2. W. Kohler, H. J. Räder, K. Martin, S. Mullins, B. Müller, K. Müllen,
    3. Y. Geerts

    , merev katenánszegmenseket tartalmazó poli-katenánok szintézise és jellemzése. Makromolekulák 32, 1737-1745 (1999). doi:10.1021/ma981077z

  • ons
    1. N. Watanabe,
    2. Y. Ikari,
    3. N. Kihara,
    4. T. Takata

    , áthidalt polikatenán. Makromolekulák 37, 6663-6666 (2004). doi: 10.1021 / ma048782u

    1. C. Hamers,
    2. O. Kocian,
    3. F. M. Raymo,
    4. J. F. Stoddart

    , egy poli (vizcatenán), amely kovalens, mechanikai és koordinációs kötések kombinációját tartalmazza. ADV. Matuka. 10, 1366–1369 (1998). doi: 10.1002/(SICI)1521-4095(199811)10:16<1366::AID-ADMA1366>3.0.CO;2-D

  • 6
    1. C. A. Fustin,
    2. C. Bailly,
    3. G. J. Clarkson,
    4. P. De Groote,
    5. T. H. Galow,
    6. D. A. Leigh,
    7. D. Robertson,
    8. li>

    9. A. M. Z. slawin,
    10. J. K. Y. Wong

    , mechanikusan kapcsolt polikarbonát. J. Am. Kémia. Soc. 125, 2200–2207 (2003). doi: 10.1021 / ja0292546pmid: 12590548

  • 6. évfolyam
    1. B. N. Ahamed,
    2. P. Van Velthem,
    3. K. Robeyns,
    4. C. A. Fustin

    egyetlen katenán hatása a mechanikusan kapcsolt polimerek szilárdtest tulajdonságairól. ACS Macro Lett. 6, 468–472 (2017). doi: 10.1021 / acsmacrolett.7b00204

  • ons
    1. K. Endo,
    2. T. Shiroi,
    3. N. Murata,
    4. G. Kojima,
    5. T. Yamanaka

    , poli(1,2-Ditian) szintézise és jellemzése. Makromolekulák 37, 3143-3150 (2004). doi:10.1021/ma021237d

  • 6
    1. J. A., Berrocal,
    2. L. M. Pitet,
    3. M. M. L. Nieuwenhuizen,
    4. L. Mandolini,
    5. E. W. Meijer,
    6. Szent István

    diolefin-katenán-réz(i) komplex gyűrűnyitó metatézis polimerizációja: könnyű út a polikatenánokhoz. Makromolekulák 48, 1358-1363 (2015). doi: 10.1021 / ma502392v

  • } Advincula
  • , Katenált Pol ((CAPR makromolekulák 48, 3825-3833 (2015). doi: 10.1021 / acs.makromol.5b00470

  • 6.évfolyam
    1. D. B. Amabilino,
    2. P. R. Ashton,
    3. A. S. Reder,
    4. N. Spencer,
    5. J Angew Chem. Int.Szerk. Engl. 33, 1286–1290 (1994). doi: 10.1002 / anie.199412861
  • 6. évfolyam
    1. H. Iwamoto,
    2. S. Tafuku,
    3. Y. Sato,
    4. W. Takizawa,
    5. W. Katagiri,
    6. E. Tayama,
    7. E. Hasegawa,
    8. Y. Fukazawa,
    9. T. Haino

    , lineáris katenánok szintézise katenánból és másodlagos ammóniumsóból álló pszeudorotaxánok olefin metatézis dimerizációjával. Kémia. Commun. 52, 319–322 (2016). doi:10.1039/C5CC07562Apmid:26515104

  • xhamsterl
    1. D. B. Amabilino,
    2. PR Ashton,
    3. S. E. Boyd,
    4. J. Y. Lee,
    5. S. Menzer,
    6. li>

    7. J. F. Stoddart,
    8. D. J. Williams

    , egy elágazó heptakatenán ötfokozatú önszerelése. Angew. Kémia. Int. Szerk. Engl. 36, 2070–2072 (1997). doi: 10.1002 / anie.199720701

  • 6.évfolyam
    1. M. Burnworth,
    2. L. Tang,
    3. J. R. Kumpfer,
    4. A. J. Duncan,
    5. F. L. Beyer,
    6. G. L. Fiore,
    7. S. J. rowan,
    8. C. weder

    , optikailag gyógyítható szupramolekuláris polimerek. Természet 472, 334-337 (2011). doi: 10.1038 / nature09963pmid: 21512571

  • 6. évfolyam
    1. R. J. Wojtecki,
    2. M. A. Meador,
    3. S. J. Rowan

    , a dinamikus kötést használva makroszkopikusan reagáló szerkezetileg dinamikus polimerek eléréséhez. Nat. Matuka. 10, 14–27 (2011). doi: 10.1038/nmat2891pmid:21157495

  • 6.
    1. J. R. Kumpfer,
    2. S. J. Rowan

    , foto-, foto-és kemo-érzékeny alakmemória tulajdonságok foto-térhálósított metallo-szupramolekuláris polimerekből. J. Am. Kémia. Soc. 133, 12866–12874 (2011). doi: 10.1021 / ja205332wpmid: 21790172

  • 6. évfolyam
    1. B. T. Michal,
    2. B. M. McKenzie,
    3. S. E. Felder,
    4. S. J. Rowan

    , Metallo-, thermo-és fotorezponensív alakmemória és működtető folyadékkristályos elasztomerek. Makromolekulák 48, 3239-3246 (2015). doi: 10.1021 / acs.makromol.5b00646

  • ons
    1. R. Kramer,
    2. J. M. Lehn,
    3. A. Marquis-Rigault

    , önfelismerés a helikát önszerelésben: spirális fémkomplexek spontán képződése ligandumok és fémionok keverékéből. Proc. NAT. Acad. Sci. U. S. A. 90, 5394-5398 (1993). doi: 10.1073/pnas.90.12.5394 pmid:11607405

  • ons
    1. S. J. Rowan,
    2. J. B. Beck

    , fém-ligandum indukálta szupramolekuláris polimerizáció: a reagáló anyagok útja. Faraday Beszélni. 128, 43–53 (2005). doi: 10.1039 / B403135Kpmid: 15658766

  • 6
    1. J. E. M. Lewis,
    2. M. Galli,
    3. S. M. Goldup

    , a mechanikusan összekapcsolt ligandumok tulajdonságai és új alkalmazásai. Kémia. Commun. 53, 298–312 (2016). doi:10.1039/C6cc07377hpid: 27819362

  • 6. évfolyam
    1. P. J. Wyatt

    , fényszórás és a makromolekulák abszolút jellemzése. Anális. Chim. Acta 272, 1-40 (1993). doi: 10.1016 / 0003-2670 (93) 80373-s

  • ons
    1. C. W. Bielawski,
    2. D. Benitez,
    3. R. H. Grubbs

    , egy “végtelen” út a ciklikus polimerekhez. Tudomány 297, 2041-2044 (2002). doi: 10.1126 / tudomány.1075401pmid: 12242440

  • 6. évfolyam
    1. W. L. Jorgensen,
    2. D. S. Maxwell,
    3. J. Tirado-Rives

    , Opls all-atom erőtér fejlesztése és tesztelése a konformációs Energetikáról és a szerves folyadékok tulajdonságairól. J. Am. Kémia. Soc. 118, 11225–11236 (1996). doi: 10.1021 / ja9621760

  • 6.szám,
    1. T. Odijk

    , merev láncok és szálak feszültség alatt. Makromolekulák 28, 7016-7018 (1995). doi: 10.1021 / ma00124a044

  • GmbH M. P. Sibi,
  • G. Petrovic
  • , Enantioszelektív gyökös reakciók: a fém triflimidek Lewis-savakként való alkalmazása. Tetraéder ASM Mmetria doi:10.1016/S0957-4166(03)00543-3

    1. B. M. McKenzie,
    2. A. K. Miller,
    3. R. J. Wojtecki,
    4. J. C. Johnson,
    5. K. A., Burke,
    6. K. A., Tzeng,
    7. P. T. Mather,
    8. S. J. rowan

    a funkcionalizált mezogén 2,6-biszbenzimidazolilpiridin ligandumok jobb szintézise. Tetraéder 64, 8488-8495 (2008). doi: 10.1016 / t2008.05. 075

    1. H. Sashia Roy

    , a kitozán 11 kémiai módosítása: kitozán-dendrimer hibrid, mint faszerű molekula. Carbohydr. Polym. 49, 195–205 (2002). doi: 10.1016 / S0144-8617(01) 00322-8

  • F. Heatley, a polimerek NMR Spektroszkópiájában (Springer, 1993), 1-49.
    1. M. Enamullah,
    2. W. Linert

    , szubsztituens – és oldószer-hatások a vas(II)-4-X-2,6-bisz-(benzimidazol-2′-Il)piridin komplexek stabilitására, amelyek spin-crossover-t mutatnak az oldatban. J. Coord. Kémia. 40, 193–201 (1996). doi:10.1080/00958979608024344

    1. H. J. C. Berendsen, D. Van der Spoel,
    2. R. van Drunen

    , GROMACS: üzenetátadó párhuzamos molekuláris dinamika megvalósítás. Comput. Phys. Joint. 91, 43-56 (1995). doi:10.1016/0010-4655(95)00042-e

    1. M. J. Abraham, T. Murtola,
    2. R. Schulz, S. P. O. C. Smith,
    3. B. Hess, E. Lindahl

    , GROMACS: Nagy teljesítményű molekuláris szimulációk többszintű párhuzamosságon keresztül a laptopoktól a szuperszámítógépekig. SoftwareX 1-2, 19-25 (2015). doi:10.1016 / j. softx.2015.06.001

    1. N. A. McDonald,
    2. W. L. Jorgensen

    , all-atom erőtér fejlesztése heterociklusok számára. Folyékony pirrol, furán, diazolok és oxazolok tulajdonságai. J. Phys. Kémia. B 102, 8049-8059 (1998). doi: 10.1021 / jp981200o

    1. W. L. Jorgensen,
    2. N. A. McDonald

    , egy teljes atom erőtér fejlesztése heterociklusok számára. Folyékony piridin és diazének tulajdonságai. J. Mol. Struct. THEOCHEM 424, 145-155 (1998). doi: 10.1016 / S0166-1280 (97)00237-6

    1. W. L. Jorgensen,
    2. J. Tirado-Rives

    , potenciális energia függvények víz, szerves és biomolekuláris rendszerek atomi szintű szimulációihoz. Proc. NAT. Acad. Sci. U. S. A. 102, 6665-6670 (2005). doi: 10.1073/pnas.0408037102pmid: 15870211

    1. M. K. Dahlgren,
    2. P. Schyman,
    3. J. Tirado-Rives,
    4. W. L. Jorgensen

    , a biaril torziós energetika jellemzése és kezelése OPLS all-atom erőterekben. J. Kémia. Inf. Modell. 53, 1191–1199 (2013). doi: 10.1021 / ci4001597pmid: 23621692

  • M. P. Allen, D. J. Tildesley, folyadékok számítógépes szimulációja (Oxford Science Publications, 1989).
    1. T. Darden,
    2. D. York,
    3. L. Pedersen

    , részecske háló Ewald: N-log(N) módszer Ewald-összegekre nagy rendszerekben. J. Kémia. Phys. 98, 10089-10092 (1993). doi: 10.1063 / 1.464397

    1. U. Essmann, L. Perera, M. L. Berkowitz, T. Darden, H. Lee, L. G. kp

    , a sima részecske háló Ewald módszer. J. Kémia. Phys. 103, 8577-8593 (1995). doi: 10.1063/1.470117

    1. S. nos ons

    , a kanonikus együttes szimulációinak molekuláris dinamikai módszere. Mol. Phys. 52, 255-268 (1984). doi: 10.1080 / 00268978400101201

    1. W. G. Hoover

    , kanonikus dinamika: egyensúlyi fázis-téreloszlások. Phys. Rev. A 31, 1695-1697 (1985). doi: 10.1103 / PhysRevA.31.1695 pmid: 9895674

    1. M. Parrinello,
    2. A. Rahman

    , polimorf átmenetek egykristályokban: új molekuláris dinamikai módszer. J. Appl. Phys. 52, 7182–7190 (1981). doi:10.1063/1.328693

  • Y. Markus, az oldószerek tulajdonságai (Wiley, 1998).

    1. C. Caleman,
    2. P. J. van Maaren,
    3. M. Hong,
    4. J. S. Hub,
    5. L. T. Costa,
    6. D. Van der Spoel

    , szerves folyadékok erőtér-referenciaértéke: sűrűség, párolgási entalpia, hőkapacitások, felületi feszültség, izotermikus összenyomhatóság, térfogati tágulási együttható és dielektromos állandó. J. Kémia. Elmélet Comput. 8, 61–74 (2012). doi:10.1021/ct200731vpmid:22241968

    1. B. Hess,

    2. H. Bekker,
    3. H. J. C. Berendsen,
    4. J. G. E. M. Fraaije
    5. , Lincs: lineáris kényszer-megoldó molekuláris szimulációkhoz. J. Számítás. Kémia. 18, 1463–1472 (1997). doi: 10.1002/(SICI)1096-987X (199709)18:12<1463::AID-JCC4>3.0.CO;2-H

    1. B. Hess

    , P-LINCS: párhuzamos lineáris kényszermegoldó molekuláris szimulációhoz. J. Kémia. Elmélet Comput. 4, 116–122 (2008). doi: 10.1021 / ct700200bpmid: 26619985

    1. W. F. Van Gunsteren,
    2. H. J. C. Berendsen

    , molekuláris dinamika számítógépes szimulációja: módszertan, alkalmazások és perspektívák a kémiában. Angew. Kémia. Int. Szerk. Engl. 29, 992–1023 (1990). doi:10.1002.199009921

    1. w Mol grafikon. 14, 33–38 (1996). doi: 10.1016 / 0263-7855 (96) 00018-5pmid:8744570
    1. G. Bussi,
    2. D. Donadio,
    3. M. Parrinello

    , kanonikus mintavételezés átméretezési sebességgel. Em PHS 126, 014101 (2007). doi: 10.1063/1.2408420 pmid:17212484

    1. H. Ber van Gunsteren,
    2. A. DiNola,
    3. J. R. Haak

    , molekuláris dinamika külső fürdőhöz való csatlakozással. J. Kémia. Phys. 81, 3684–3690 (1984). doi: 10.1063/1.448118

    1. D. Van der Spoel,
    2. P. J. van Maaren,
    3. C. Caleman

    , GROMACS molekula & folyékony adatbázis. Bioinformatika 28, 752-753 (2012). doi: 10.1093 / bioinformatika / bts020pmid: 22238269

    1. B. J. Palmer

    , keresztirányú áramú autokorreláció-a molekuláris folyadékok nyírási viszkozitásának függvényszámítása. Phys. Rev. E 49, 359-366 (1994). doi: 10.1103 / PhysRevE.49.359 pmid: 9961225

    1. W. F. Van Gunsteren,
    2. H. J. C. Berendsen

    , a leap-frog algoritmus sztochasztikus dinamika. Mol. Simul. 1, 173–185 (1988). doi: 10.1080/08927028808080941

  • M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. R. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, X. J. V. Ortiz, A. F. Izmaylov, J. L. Sonnenberg, D. Williams-Young, F. Ding, F. Lipparini, F. Egidi, J. Goings, B. Peng, A. Petrone, T. Henderson, D. Ranasinghe, V. G. Zakrzewski, J. Gao, N. Rega, G. Zheng, W. Liang, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, K. Throssell, J. A. Montgomery Jr., J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Testvérek, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, T. Keith, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, J. M. Millam, M. Klene, C. Adamo, R. Cammi, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, O. Farkas, J. B. Foresman, D. J. Fox, Gaussian 09, revision A. 02 (Gaussian, Inc., 2009).
    1. R. Krishnan,
    2. J. S. Binkley,
    3. R. Seeger,
    4. J. A. Pople

    , Önkonzisztens molekuláris orbitális módszerek. XX. a korrelált hullámfüggvények alapja. J. Kémia. Phys. 72, 650–654 (1980). doi:10.1063 / 1.438955

    1. R. A. Kendall,
    2. T. H. Dunning Jr..,
    3. R. J. Harrison

    , az első sor atomjainak elektron affinitása megújult. Szisztematikus alapkészletek és hullámfüggvények. J. Kémia. Phys. 96, 6796–6806 (1992). doi: 10.1063/1.462569

    1. A. W. Sche Xhamstertelkopf,
    2. D. M. F. van Aalten

    , PRODRG: eszköz a fehérje-ligandum komplexek nagy áteresztőképességű kristályosításához. Acta Crystallogr. D 60, 1355-1363 (2004). doi: 10.1107 / S0907444904011679pmid:15272157

    1. P. It,
    2. K. M. Merz Jr.

    ,., Fémion modellezés klasszikus mechanikával. Kémia. Rev.117, 1564-1686 (2017). doi: 10.1021 / acs.chemrev.6b00440pmid: 28045509

    1. R. H. Stote, M. Karplus

    , Cinkkötés fehérjékben és oldatban: egyszerű, de lehetséges pontos, nem kötött ábrázolás. Fehérjék 23, 12-31 (1995). doi: 10.1002 / prot.340230104pmid: 8539245

    1. X. rajongó,
    2. J. Yuan,
    3. Y. Bai,
    4. J. Kong,
    5. H. Wu

    , Biszink-dipikrát-metanol-diszolvát. Acta Crystallogr. E E68, m1072 (2012). doi: 10.1107 / S1600536812031443

    1. T. G. A. Youngs,
    2. C. Hardacre

    , statikus töltésátvitel alkalmazása Ionos-folyékony erőtérben és annak hatása a szerkezetre és a dinamikára. ChemPhysChem 9, 1548-1558 (2008). doi:10.1002 / cphc.200800200pmid:18613196

    1. J. Schmidt,
    2. C. Krekeler,
    3. F. Dommert,
    4. Y. Zhao,
    5. R. Berger,
    6. L. Delle Site,
    7. C. Holm

    , Ionos töltéscsökkentés és atomi parciális töltések az 1,3-dimetil-imidazolium-klorid első elvi számításaiból. J. Phys. Kémia. B 114, 6150-6155 (2010). doi:10.1021/jp910771qpmid:20397676

    1. W. Beichel,
    2. N. Trapp,
    3. C. Hauf,
    4. O. Kohler,
    5. G. Eickerling,
    6. W. Scherer,
    7. I. krossing

    , töltésmérési hatás Ionos folyadékokban az N,N’-dimetil-imidazolium-metil-szulfát töltéssűrűség-elemzéséből. Angew. Kémia. Int. Szerk. 53, 3143–3146 (2014). doi: 10.1002 / anie.201308760pmid: 24677323

    1. F. M .. Mlller-Plate,
    2. W. F. Van Gunsteren

    , számítógépes szimuláció egy polimer elektrolit: lítium-jodid amorf poli(etilén-oxid). J. Kémia. Phys. 103, 4745–4756 (1995). doi: 10.1063/1.470611

    1. K. J. Lin,
    2. J. K. Maranas

    , a csökkenő ion-ion asszociáció javítja a kation mobilitást az egyes ionvezetőkben? Phys. Kémia. Kémia. Phys. 15, 16143–16151 (2013). doi: 10.1039 / c3cp51661jpmid:23986076

    1. B. M. Savoie,
    2. M. A. Webb,
    3. T. F. Miller III

    , a Kationdiffúzió fokozása és az aniondiffúzió elnyomása Lewis-savas polimer elektrolitokon keresztül. J. Phys. Kémia. Lett. 8, 641–646 (2017). doi: 10.1021 / acs.jpclett.6b02662pmid: 28075599

    1. H. Lee,
    2. R. M. Venable,
    3. A. D. Mackerell Jr..,
    4. R. W. Pastor

    , polietilén-oxid és polietilén-glikol molekuláris dinamikai vizsgálata: hidrodinamikai sugár és alak anizotrópia. Biophys. J. 95, 1590–1599 (2008). doi: 10.1529 / biophysj.108.133025 pmid: 18456821

    1. I. C. Yeh,
    2. G. Hummer

    , a diffúziós együtthatók és a viszkozitások rendszerméret-függősége a molekuláris dinamikai szimulációktól periodikus határfeltételekkel. J. Phys. Kémia. B 108, 15873-15879 (2004). doi: 10.1021 / jp0477147

  • P. G. de Gennes, skálázási fogalmak a polimer fizikában (Cornell Univ. Sajtó, 1979).

    1. M. D. Wang,
    2. H. Yin,
    3. R. Landick,
    4. J. Gelles,
    5. S. M. blokk

    , DNS nyújtása optikai csipesszel. Biophys. J. 72, 1335-1346 (1997). doi: 10.1016 / S0006-3495(97) 78780-0pmid:9138579

  • M. Frenkel, K. N. Marsh, Szerk., A Halohidrokarbonok sűrűsége (vol. 8J of Landolt-B Enterprnstein-IV. csoport fizikai kémiai sorozat, Springer, 2003).

  • fizikai tulajdonságok tervező Intézete, 801. projekt (Amerikai Vegyészmérnöki Intézet, 2010); www.aiche.org/dippr/projects/801.

  • O. Madelung, Szerk., Tiszta folyadékok és bináris folyékony keverékek statikus dielektromos állandói (vol. A Landolt – B 6.csoportja, a IV. fizikai kémiai sorozat, Springer, 1991).
  • C. L. Yaws, Yaws kézikönyve a kémiai vegyületek termodinamikai és fizikai tulajdonságairól (Knovel, 2003).
  • D. R. Lide, CRC kémiai és fizikai kézikönyv (CRC Press, Szerk. 90, 2009).

    1. G. Sivaramprasad,
    2. M. V. Rao,
    3. D. H. L. Prasad

    , Density and viscosity of ethanol + 1,2-dichloroethane, ethanol + 1,1,1-trichloroethane, and ethanol + 1,1,2,2-tetrachloroethane binary mixtures. J. Chem. Eng. Data 35, 122–124 (1990). doi:10.1021/je00060a006

    1. G. Pranami,
    2. M. H. Lamm

    , Estimating error in diffusion coefficients derived from molecular dynamics simulations. J. Chem. Theory Comput. 11, 4586–4592 (2015). doi:10.1021/acs.jctc.5b00574pmid:26889517

  • M. Rubinstein, R. H. Colby, Polymer Physics (Oxford Univ. Sajtó, Szerk. 1, 2003).

  • köszönetnyilvánítások: köszönjük K. Herbert segítségét az ábra tervezésében és a DSC adatelemzéssel kapcsolatos javaslatait, P. Agrawal a DOSY mérésekért és F. Etheridge a hasznos beszélgetésekért. Külön köszönet S. Shang a kép az ő karkötő ábra. 1a és R. Rauscher segítséget több számok. Ezt a munkát az NSF a Che 1700847, a CHE 1402849 és a CHE 1151423 támogatások, valamint a Chicagói Egyetem Anyagkutatási tudományos és mérnöki központja finanszírozza, amelyet az NSF a DMR-1420709 díjszám alatt Finanszíroz. További adatok a kiegészítő anyagokban találhatók.

    Vélemény, hozzászólás?

    Az e-mail-címet nem tesszük közzé.