Philip született május 21-én 1527 a Palacio de Pimental Valladolid. A burgundi nevet kapta Fülöp, Charles apja után. A kasztíliai udvarban nevelkedett anyja és Don Juan de Zuniga, az egyik keresztapja és Károly bizalmasa felügyelete alatt, aki Isabella 1539-ben bekövetkezett halála után nagyobb befolyással bírt. Arra ösztönözte Fülöpöt, hogy élvezze a szabadtéri, fizikai tevékenységeket – hawking, lovaglás, kardharc–, amelyben kitűnt. Charles később heti korlátot szabott az elpusztítható állatok számára! Spanyolország legjobb akadémikusai közül sokan oktatták, bár nem volt természettudós, oktatásában jelentős hiányosságok voltak. A spanyol mellett latinul tanult, azzal az indokkal, hogy ezt egész Európában megértik, de soha nem sajátította el a franciát, a németet vagy az olaszt, ami a jövőben akadályozná. Charles 1539 után is jobban bekapcsolódott a fiába, kezdve a kormányzás művészetének oktatását és a kemény munka szükségességébe vetett hitet. Odafigyelt Fülöp politikai nevelésére.
Fülöpöt először 1543-ban nevezték ki régensnek Spanyolországban, tizenhat éves korában. Károly felismerte ,hogy te még fiatal vagy ahhoz, hogy ilyen terhet viselj, de három okiratot hagyott rá, amelyek a hatásköreit és kötelességeit, e hatáskörök bizonyos korlátozásait tartalmazzák, különösen a kinevezésekben, valamint személyesebb tanácsokat a szerepéről és viselkedéséről a köz-és magánszférában. Felvázolta politikai elképzeléseit, és figyelmeztette, hogy pénzügyi nehézségekre számíthat. (További részletekért lásd: Ch. 22 dinasztia és kötelesség: V. Károly császár és változó világa (1500-1558). Arról is tájékoztatta Fülöpöt, hogy Zunigát arra utasították, hogy ha kell, beszéljen vele élesen, és erős tanácsot nevezett ki fia tanácsára. ugyanebben az évben Fülöp feleségül vette Maria Manuelát, III. János portugál király legidősebb lányát és feleségét, Katalint. Fülöp tizenhét éves volt, Mária pedig csak tizenhat. Kettős unokatestvérek voltak, más szóval unokatestvérek mind apjuk, mind anyjuk oldalán, példa a közeli rokonok közötti házasságra, amely egyre gyakoribbá vált a Habsburg családban. Charles figyelmeztette fiát a túlzott engedetlenségre a házasság örömeiben, mivel ez nemcsak az egészségét károsíthatja….(de) még az életedet is lerövidítetted, utalva Juan herceg (Károly nagybátyja) túlkapásaira, aki 1497-ben feleségül vette Osztrák Margitot, hogy csak hat hónappal később haljon meg. Tudatta Philippel, hogy utasította Zunigát, hogy biztosítsa kívánságainak betartását. Miután a nászéjszakán lefeküdtek, Zuniga két és fél óra múlva egy másik ágykamrába vitte Fülöpöt. Valójában Maria volt az, aki megfizette az árat, miután 1545 júliusában fia, Don Carlos született. Philipet nagyon megrázta a loss.In 1546 – ban és 1547 – ben Fülöp három fő tanácsadója-Tavara, Cobos és Zuniga-meghalt, és Károly felismerte, hogy Fülöp húszéves korára készen áll a nagyobb cselekvési szabadságra. Fülöp ellenállt apja spanyolországi pénzigényének, és saját embereit kezdte kinevezni kormányzati pozíciókba. Az 1540-es évek végére Károly úgy döntött, hogy Fülöp örökölje az alacsony országokat, valamint Spanyolországot, és meghívta, hogy utazzon oda, hogy örökösként elismerjék. Ez volt az első nagy utazása Spanyolországon kívül. 1548 októberében Barcelonából Genovába hajózott, Észak-Itálián át Innsbruckba, majd Münchenbe és Heidelbergbe utazott, április 1-jén érkezett Brüsszelbe. (A júliusban Brüsszelben megrendezett’ Ommegang ‘ verseny az 1549-es ünnepség újragondolása, amelyet Fülöp érkezése után tartottak). Philipet soha nem fogadták el az alacsony országokban. Zárkózottnak és gőgösnek tartották, idegennek, aki nem beszélte nyelvüket, és kevéssé becsülte a tartományok hagyományos intézményeit. Soha nem volt képes legyőzni ezeket a problémákat. Fülöp 1551-ben tért vissza Spanyolországba. Károly megtagadta az engedélyt, hogy csatlakozzon katonai vállalkozásokhoz Olaszországban vagy a franciák ellen Metzben, apja pedig továbbra is pénzért nyomta. Károly ezután utasításokat küldött, hogy Fülöp nagy összegekkel utazzon az alacsony országokba, hogy kifizesse a következő évi katonai hadjáratot a Franciaországgal folytatott háborúban. Fülöp tárgyalásokat kezdett a házasságáról egy másik Máriával, ezúttal nagynénje, Eleanor és első férje, I. Manuel portugáliai lányával, de vi.Eduárd halála Angliában 1553 júliusában megváltoztatta a helyzetet. Edward utódja Mary volt, VIII. Henrik lánya, harminc évvel korábban Charles lehetséges felesége. Amikor ez az elképzelés feltámadt, Károly nem fogadta el, de úgy döntött, hogy Fülöp kiváló párja lesz a katolikus királynőnek, összehozza Angliát és az alacsony országokat, és visszaállítja Angliát a katolikus hitbe. Fülöp 1554 júliusában Angliába utazott, ahol Winchesterben házasodtak össze.
sokan úgy vélték, hogy Fülöp még mindig nem volt független, és csak Károly utasításait követte. Spanyolországból való távozásakor azonban figyelmen kívül hagyta apja távollétében a régensséggel kapcsolatos kívánságait, és kinevezte fiatal nővérét, Juanát, aki nemrég megözvegyült Portugáliában. Számos kinevezést tett a tanácsba, valamint más közigazgatási és egyházi tisztségeket is, így biztosítva, hogy távollétében továbbra is ellenőrzése alatt tartsa Spanyolországot. Angliában töltött ideje azonban nem volt sikeres, annak ellenére, hogy Philip pozitív politikai eredményre vágyott. Annak ellenére, hogy jelentős erőfeszítéseket tett a jó kapcsolatok kialakítására és kötelességének teljesítésére, a távollétében kötött házassági megállapodás korlátozta hatalmát Angliában, az angolok általában ellenségesek voltak, és nehezen tudta viszonozni Mary vonzalmát. 1555 szeptemberében elhagyta az országot, és részt vett Károly lemondási ünnepségén a következő hónapban. 1556 januárjában Fülöp hivatalosan király lett Fülöp II, de az alacsony országokban maradt, amikor Károly az év későbbi részében Spanyolországba hajózott. Még mindig háborúban áll Franciaországgal, Fülöp csapatai 1557 augusztusában nagy győzelmet arattak St. Quentinnél, de Calais elvesztése, 1347 óta Angol kézben, 1558 januárjában nagy csapást jelentett Máriára. Az angol királynő azt hitte, hogy 1555-ben terhes, de nem volt gyermeke. 1557 végén, most negyvenkét éves, még egyszer bejelentette a terhességet. 1558 áprilisára, kilenc hónappal azután, hogy Fülöp utoljára elhagyta Angliát, világossá vált, hogy ismét tévedett. Egészsége megromlott, és November 17-én halt meg, kevesebb mint két hónappal Philip apja után.
1558 után
a halál állandó jellemző volt Philip személyes életében. Még kétszer kellett férjhez mennie. 1559-ben feleségül vette Valois Erzsébetet, II. Henrik és Medici Katalin legidősebb lányát a Cateau-Cambresi szerződés részeként a francia királlyal. Két túlélő gyermekük született, nagyon szeretett lányuk, Isabella és Catherine. Fülöp első házasságából származó fia, Don Carlos már korán megbízhatatlannak bizonyult, és csalódást okozott apjának. 1568 januárjában letartóztatták és bebörtönözték, hat hónappal később pedig tisztázatlan körülmények között halt meg. Elizabeth ugyanabban az évben később szülésben halt meg. 1570-ben Fülöp feleségül vette unokahúgát, ausztriai Annát, Maximilianus császár és Mária, Fülöp nővérének lányát. Négy fiuk és egy lányuk született, akik közül négyen nyolcéves koruk előtt haltak meg, így a legfiatalabb fiú, Philip, aki 1578-ban született, húsz évvel később apja utódja lett. Anne 1580-ban halt meg.Fülöp uralkodása nagy részében Spanyolországban maradt, Madridot fővárosává tette, és felépítette a kolostort és a San Lorenzo de El Escorial királyi palotát, ahol ideje nagy részét nem Madridban vagy Aranjuez-I palotájában töltötte. Hosszú órákat dolgozott, állami újságokat olvasott, utasításokat adott ki, és gyakran elmerült a számos kérdés részleteiben, amelyekkel Spanyolország, az alacsony országok, Olaszország és Amerika nagy részének uralkodójaként kellett foglalkoznia. 1580-ban Portugália királya lett. Hatalmas pénzügyi nehézségekkel kellett megküzdenie, számos alkalommal csődöt nyilvánítva Spanyolországot.
Philip továbbra is ellentmondásos figura. Néha pusztán vallási bigottnak tekintik, aki felelős a folyamatos inkvizícióért és a protestánsok üldözéséért. Negyven éves uralkodása alatt csak kilenc hónap volt, amikor birodalmának valamely részén nem volt háború. A legkárosabb volt a lázadás az alacsony országokban, politikai és vallási kérdésekben, amelyeket nem tudott elfojtani, és halála után végül a spanyolok által ellenőrzött területre és a független Egyesült tartományokra (ma Hollandia) való felosztáshoz vezetett. Legismertebb Angliában a balsorsú Armada I. Erzsébet ellen 1588-ban, de valószínűleg jelentősebb volt az Oszmán haditengerészet veresége a lepantói csata 1571-ben. Uralkodása megszilárdította a Habsburg hatalmat Európában is, és gyakran Spanyolország aranykorának nevezik, annak ellenére, hogy saját hanyatlásának magjai voltak. Geoffrey Parker 2014-es életrajza, az Imprudent King: A New Life of Philip II alapos és elgondolkodtató vizsgálatot nyújt az életéről.