Bowdre dolgozott, mint egy cowboy a tanyákon Thomas Yerby és Pete Maxwell, mint a háború ment, valamint, hogy aktív résztvevője. Bowdre néhány hónappal a halála előtt feleségül vett egy huszonöt éves mexikói nőt, Manuela Herrerát.

Manuela nővére volt Doc Scurlock feleségének, Antonia Miguela Herrera, ismert, mint Antonia. Az a tény, hogy nemrég házas volt, amikor meghalt, talán arra utal, hogy kevésbé valószínű, hogy részt vett volna a banda tevékenységében a házassága és halála között eltelt néhány hét alatt.1880 decemberére Charlie Bowdre kész volt abbahagyni a lovaglást Billy a kölyökkel és megadni magát sörétes Roberts meggyilkolásáért, de még mindig csatlakozott a banda többi tagjához, hogy csapdába ejtse Pat Garrettet Fort Sumnerben.

fegyveres csata következett, de Bowdre és a kölyök bandájának legtöbb tagja életben maradt. December 23-án azonban a bandát egy sziklaházban rejtették el Stinking Springs, Új-Mexikó. hajnalban Bowdre előjött, hogy megetesse a lovakat, és Garrett csapata puskacsövekkel tömte tele, amelyek éjjel körülvették az épületet. Később Billy, a kölyök és társai feladták. Miután golyókkal tele volt, visszaesett az ajtóba, ahol Billy, a gyerek sürgetésére, hogy “vigyen magával néhányat, amikor meghal”, Bowdre bátor kijáratot tett.

sajnos ekkor már túl gyenge volt és közel volt a halálhoz, és nem tudta kivenni a fegyverét a pisztolytáskájából. Élete utolsó másodperceiben megbotlott és Garrett felé esett, megismételve a következő mondatot: “bárcsak…Bárcsak…”

maradványait visszaadták a feleségének, és Tom O ‘ Folliard, Billy bandájának egy másik tagja mellett temették el. Később Billy is csatlakozott hozzájuk, miután 1881 júliusában megölték.