az 1919-es versenylázadás után, amikor a feketék a vörös nyár folyamán számos városban elkövetett városi erőszak részeként visszavágtak a fehér támadások ellen, Johnson kutatóként dolgozott a nemzeti városi Liga 1921-ben pedig a Liga kutatási igazgatója lett. A National Urban League-nél töltött ideje alatt megalapította a magazint is lehetőség mint a fekete kifejezés kivezetése a művészetekben. Fő kutatója és szerzője volt a Chicago Commission on Race Relations-nek a zavargásról szóló jelentéséért. A korabeli újságok arról számoltak be, hogy a felbujtók nagyrészt etnikai írek voltak, akik megpróbálták fenntartani a gazdasági és társadalmi dominanciát a feketék felett Dél-Chicagóban; Johnson megjegyezte, hogy az afroamerikaiak fellázadtak a gazdasági és társadalmi lehetőségek megtagadása ellen. Munkája alapvető volt a The Negro in Chicago: A Study of Race Relations and a Race Riot számára (1922), amelyet a University of Chicago Press adott ki. Az átfogó bizottsági jelentések klasszikus modelljének tekintették.az 1920-as években Johnson New Yorkba költözött, ahol a nemzeti városi Liga kutatási igazgatója lett. Ő volt a “Harlem reneszánsz vállalkozója”, az akkori afroamerikai írók és művészek kreatív mozgalma. Két folyóiratot szerkesztett, amelyekben a korszak számos írója jelent meg, és díjakat alapított a nemzeti városi Ligában a fiatal írók elismerésére. Harlemben a fekete művészek mellett érvelt, mondván, hogy saját tapasztalataikat kell felhasználniuk kreativitásuk alapjaként, elutasítva az európai normákat. Célja az volt, hogy javítsa a Néger önképét és karakterét, és úgy érezte, hogy az írással ezt elérhetik.
Return to The SouthEdit
Johnson arra vágyott, hogy visszatérjen délre, nem csak a faji kapcsolatok tanulmányozására, hanem azok megváltoztatására is. 1926-ban Nashville-be költözött, a Fisk Egyetem Szociológiai Tanszékének elnöke volt, történelmileg fekete Főiskola. Ott számos tanulmányt írt vagy irányított arról, hogy a jogi, gazdasági és társadalmi tényezők együttesen hogyan hoztak létre elnyomó faji struktúrát. Két műve klasszikus lett: Az ültetvény árnyéka (1934), a fekete övben felnőni (1940).
1929-ben egy amerikai misszionárius Libériában arról számolt be, hogy a libériai tisztviselők katonákat használtak törzsi emberek összegyűjtésére, akiket kényszermunkásként Fernando Po szigetére szállítottak.A Libériai kormány tagadta a vádakat, és felkérte a Népszövetség vizsgálóbizottságát.Nagy-Britannia Cuthbert Christy vezette a Bizottságot.Johnson volt az Egyesült Államok képviselője. Libéria korábbi elnöke, Arthur Barclay képviselte országát. A Bizottság megkezdte munkáját április 8, 1930. A vizsgálatok eredménye egy szeptemberben benyújtott szókimondó jelentés volt 1930.It megállapította, hogy a munkásokat “a rabszolgatartástól és a rabszolgakereskedelemtől alig megkülönböztethető bűnözői kényszer alatt toborozták.”A Christy-jelentés eredményeként Charles D. B. King elnök és Allen N. Yancy alelnök is lemondott.1930-ban Johnson elnyerte a Harmon-díjat a tudományért, munkájáért a Néger az amerikai civilizációban.1946-ban Johnsont nevezték ki a Fisk Egyetem Első fekete elnökévé. Vonzott kiemelkedő oktatók, köztük a szerző Arna Bontemps, James Weldon Johnson, Aaron Douglas és others.In 1946-ban Johnson egyike volt annak a 20 amerikai oktatónak, akiket kiválasztottak, hogy tanácsot adjanak az oktatási reformról a megszállt Japánban. Számos fehér házi konferencia tanácsadója volt az amerikai társadalom ifjúságával kapcsolatban, valamint a Fulbright Program első külföldi Ösztöndíjainak Testületének tagja.
Johnson élt, hogy megünnepelje a mérföldkőnek számító Legfelsőbb Bíróság döntését Brown kontra Oktatási Tanács (1954), amely kimondta, hogy az állami iskolákban a faji szegregáció alkotmányellenes. Kulcsszerepet játszott a döntés végrehajtására irányuló erőfeszítésekben a déli “hatalmas ellenállással” szemben. Munkája és társai is hozzájárultak az 1960-as évek közepének szövetségi polgárjogi jogszabályainak elfogadásához.
tagja volt Alpha Phi Alpha testvériség. Alapító tagja volt a Phi Mu Alpha Sinfonia zenei testvériség Zeta Rho fejezetének is, amelyet 1953-ban béreltek a Fisk-ben.Johnson 1956-ban váratlanul meghalt. Vonattal utazott Nashville-ből New Yorkba, amikor szívrohamot kapott a peronon egy Louisville-i megállóban, Kentucky. 63 éves volt.