rakenteellinen analogi (Commonwealth English analogi), joka tunnetaan myös kemiallisena analogina tai yksinkertaisesti analogina, on yhdiste, jonka rakenne on samanlainen kuin toisen yhdisteen, mutta eroaa siitä tietyn komponentin suhteen.

se voi erota yhdestä tai useammasta atomista, funktionaalisesta ryhmästä tai alirakenteesta, jotka korvautuvat toisilla atomeilla, ryhmillä tai alirakenteilla. Rakenteellisen analogin voidaan kuvitella muodostuvan ainakin teoriassa toisesta yhdisteestä. Rakenteelliset analogit ovat usein isoelektronisia.

suuresta kemiallisesta samankaltaisuudesta huolimatta rakenteelliset analogit eivät välttämättä ole toiminnallisia analogeja ja niillä voi olla hyvin erilaisia fysikaalisia, kemiallisia, biokemiallisia tai farmakologisia ominaisuuksia.

huumeiden löytämisessä joko luodaan suuri sarja alkuperäisen lyijy–yhdisteen rakenteellisia analogeja ja testataan osana rakenne-aktiivisuussuhdetutkimusta tai seulotaan tietokanta lyijy-yhdisteen rakenteellisille analogeille.

laittomien lääkkeiden kemiallisia analogeja kehitetään ja myydään lakien kiertämiseksi. Tällaisia aineita kutsutaan usein muuntohuumeiksi. Tämän vuoksi Yhdysvalloissa säädettiin Federal Analogue Act vuonna 1986. Tässä lakiehdotuksessa kiellettiin sellaisten kemiallisten analogien valmistus, jotka sisältävät I tai II luokan aineita, joilla on olennaisesti samanlaiset farmakologiset vaikutukset, tarkoituksenaan käyttää niitä ihmisravinnoksi.