ChEBI

biologista merkitystä omaavat kemialliset entiteetit, tunnetaan myös nimellä ChEBI, on ”pieniin” kemiallisiin yhdisteisiin keskittyvien molekyyliyksiköiden kemiallinen tietokanta ja ontologia, joka on osa Euroopan bioinformatiikan instituutin (EBI) avointa biolääketieteellistä ontologiaa (obo). Termillä ” molekyyli entiteetti ”tarkoitetaan mitä tahansa” perustuslaillisesti tai isotopisesti erillistä atomia, molekyyliä, Ionia, ioniparia, radikaali -, radikaali-Ionia, kompleksia, konformeria jne., tunnistettavissa erikseen erotettavissa olevana yksikkönä”. Kyseiset molekyyliyksiköt ovat joko luonnon tuotteita tai synteettisiä tuotteita, joilla on potentiaalista bioaktiivisuutta. Suoraan genomin koodaamat molekyylit, kuten nukleiinihapot, proteiinit ja proteiineista proteolyyttisellä pilkkoutumisella johdetut peptidit, eivät pääsääntöisesti kuulu Chebiin.

Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI)

ChEBI logo.png

Content

Description

Chemical database

Data types
captured

Small chemical compounds

Contact

Research center

European Molecular Biology Laboratory European Union

Laboratory

European Bioinformatics Institute United Kingdom

Primary citation

de Matos et al

Access

Website

www.ebi.ac.uk/chebi

Download URL

ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi

Web service URL

www.ebi.ac.uk/chebi/webServices.do

Sparql endpoint

BIO2RDF

Tools

Web

www.ebi.ac.uk/chebi

sekalaiset

tietojen julkaisu
frekvenssi

kuukausittain

Kuratointipolitiikka

käsin kuratoitu

chebi käyttää nimikkeistöä, symboliikkaa ja terminologiaa, jotka ovat kansainvälisen puhtaan ja sovelletun kemian liiton (IUPAC) ja kansainvälisen biokemian ja molekyylibiologian liiton (NC-iubmb) nimistökomitean hyväksymiä.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.