Estoy analizando algunas reacciones de Diels-Alder y Povarov mediante cálculos de QM (DFT, realizado en Jaguar por Schrodinger). Estoy tratando de considerar cada producto posible para recopilar más datos de antemano a la luz de una posible variación asimétrica, por lo que para cada reacción tengo 4 TS (cada una con una sola frecuencia negativa que involucra a los átomos correctos y confirmada por IRC):
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endo + re lado del dienófilo
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endo + si lado del dienófilo
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exo + re lado del dienófilo
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exo + si lado del dienófilo
Usaré sus energías usando la ecuación de Eyring, para esperemos determinar una preferencia isomérica.
Estoy solo en este lado del proyecto, ya que el PI computacional con el que estoy en contacto se encarga principalmente de los proyectos de descubrimiento de medicamentos y medchem, no es un experto en cálculos de QM, por lo que en la práctica soy autodidacta. Me gustaría discutir algunas cosas con todos ustedes:
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Es mi enfoque correcto en absoluto?
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¿hay alguna modificación que podría hacer?
Ahora la pregunta real.
estoy tratando de reproducir los resultados experimentales obtenidos. Sin embargo, constantemente obtengo energías de TS más bajas del EXOTSS, mientras que ambos endo-TSs tienen una energía ligeramente más alta, mientras que debería ser al revés, ya que hasta donde sé, el endo TS debería ser el más bajo en energía pero conducir al producto termodinámicamente menos estable. Estoy buscando una relación endo / exo que oscila entre 3: 1 y 7:1. ¿Es la diferencia demasiado pequeña para detectarla computacionalmente?. He probado algunas combinaciones de funcionales de DFT, conjuntos de bases y condiciones de cálculo, ya que la reacción se realiza en tolueno a -30 ° C (4x2x4 = 32):
