El objetivo de este estudio es investigar la influencia de la arquitectura del grupo cabeza de ceramida y los ácidos grasos libres (otra clase principal de lípidos del estrato córneo) o proteínas (queratina), en la organización lamelar de la ceramida auto-asociada en películas modelo que imitan la organización de los lípidos dentro del estrato córneo. La espectroscopia FTIR es una técnica poderosa para investigar la estructura de tales sistemas. Esta técnica ya se ha utilizado para caracterizar transiciones de fase de la CE y de sistemas modelo relacionados. Como se sabe que la temperatura modifica el orden conformacional de los lípidos, la usamos como parámetro variable para monitorear las diferencias en la estabilidad conformacional de las ceramidas. Nuestro estudio incluyó cuatro ceramidas: ceramida 2, 3, 5 y 6 que difieren por su arquitectura de grupo de cabeza. Se estudiaron dos tipos de interacciones lipídicas-lipídicas: no polares y polares. Se observaron algunos factores estructurales que participaron en el comportamiento organizacional: insaturación de la cadena alquilo, alfa-hidroxilo en la fracción de ácidos grasos y el grupo cabeza de esfingosina o fitoesfingosina. Hay una interacción directa del ácido palmítico en la organización de las cadenas alquilo y una interacción débil con el grupo de cabeza polar en presencia de queratina, ambos provocando una desestabilización de la organización ortorrómbica ceramídica.