Antes de que se implementara el Draft de la CFL, los equipos seleccionaban a los jugadores en función de los derechos territoriales. En aras de una competencia leal, se celebraría un proyecto para garantizar una representación equitativa de jugadores y talentos. Un draft experimental se llevó a cabo en 1952 por lo que entonces era la Unión Interprovincial de Rugby (ahora la División Este de la CFL); el primer draft formal de fútbol canadiense se llevó a cabo al año siguiente. La selección se limitó a jugadores de cinco universidades de Ontario y Quebec: McGill University, Queen’s University, University of Toronto, University of Western Ontario y McMaster University. Los Alouettes de Montreal seleccionaron a Doug McNichol del oeste de Ontario, convirtiéndose en el primer jugador de fútbol canadiense en ser reclutado.
En 1956, con el establecimiento del Consejo Canadiense de Fútbol, se estableció un draft nacional, con los cinco equipos de la Unión Interprovincial Occidental de Fútbol que ahora participan y jugadores de todas las universidades canadienses que son elegibles. Además, la conferencia que contó con el equipo perdedor en la Copa Gris tendría a su equipo con el récord más pobre seleccionado primero. Dos años más tarde, se completó la formación de la actual Liga de Fútbol Canadiense.
Otras modificaciones a la estructura del draft tuvieron lugar en el Draft de la CFL de 1973, ya que jugadores canadienses de escuelas estadounidenses serían elegibles para el draft. Antes de esto, a los equipos se les otorgaban derechos territoriales para jugadores no importados de escuelas con sede en Estados Unidos basadas en el territorio en el que estaba domiciliado. Debido a que esto eliminaría casi cualquier exención geográfica, a los equipos también se les permitiría hacer dos exenciones territoriales por borrador, independientemente de la ubicación de la escuela, a partir de 1973.
Las exenciones territoriales se abolieron en 1985, introduciendo la era moderna del Proyecto CFL, aunque se restablecieron en 2019. En 1986, el proyecto se redujo de nueve a ocho rondas y se redujo a siete rondas en 1993. En 1997, el Draft de la CFL constaba de solo seis rondas, que era un formato que se utilizó hasta que se cambió en 2013, cuando se expandió a siete rondas. Para el Draft de la CFL de 2016, el formato se cambió para incluir ocho rondas de selecciones.
