La daltonismo cortical es causada por daño cerebral en los lóbulos occipital y temporal ventromedial. Una posible explicación es que la vía responsable de transmitir información sobre la longitud de onda y su posterior elaboración como color ha sido destruida a nivel cortical. Sin embargo, varios signos de procesamiento cromático persisten en un sujeto acromatópsico que, a pesar de su incapacidad para distinguir los colores, todavía puede detectar bordes cromáticos, percibir la forma del color y discriminar la dirección en la que se mueve un patrón de rayas cuando la determinación de la dirección requiere que el espectador ‘sepa’ qué rayas tienen un color particular. Tal vez solo se ha destruido la información sobre la longitud de onda que conduce a la conciencia del color. No está claro si la acromatopsia incompleta es simplemente una forma menos grave del trastorno o si es cualitativamente diferente, tal vez reflejando una alteración de la constancia del color. En los monos, la eliminación del área cortical V4 perjudica el rendimiento en las tareas de constancia de color, pero, invariablemente, perjudica varios otros aspectos de la percepción visual. Si la lesión que causa la acromatopsia total en sujetos humanos corresponde al área V4 en monos, es un rompecabezas sin resolver que un sujeto totalmente acromatopsico, paradójicamente, demuestre ciertas características de constancia de color, a menos que su desempeño residual refleje la contribución muy subestimada de la retina a la constancia de color.