Kentucky cave rejer blev registreret som en truet art under Endangered Species Act i 1983 og blev inkluderet på IUCN rødliste som truet i 1994. Der er i øjeblikket kun flere tusinde tilbage. Det er for det meste truet af forurenet grundvand, der løber ind i dets habitat. Flere nærliggende samfund har enten utilstrækkelige spildevandsbehandlingsfaciliteter eller mangler helt sådanne faciliteter. En yderligere potentiel trussel er indtrængen af forurenende stoffer fra trafikulykker og vejvirksomheder. En hændelse i 1979 forårsagede døden af akvatiske huleorganismer i en del af Mammoth Cave system, og i en hændelse fra 1980 væltede en lastbil med giftige cyanidsalte på Interstate 65, lige syd for Mammoth Cave National Park.
en genopretningsplan er i gang, som omfatter:
- kortlægning af placeringen og omfanget af alle områder, der støtter rejer
- gennemførelse af livshistorie og anden forskning, der kræves for at bestemme, hvad der udgør en levedygtig befolkning
- overvågning af befolkningsstatus
- opretholdelse af tilstrækkelig vandkvalitet;
- beskyttelse af rejer fra introducerede rovdyr
- produktion og gennemførelse af offentlige uddannelsesprogrammer.
