opbevaring og hentningredit

en primær anvendelse af keminformatik er opbevaring, indeksering og søgning af information vedrørende kemiske forbindelser. Den effektive søgning af sådanne lagrede oplysninger inkluderer emner, der behandles inden for datalogi, såsom data mining, informationssøgning, informationsekstraktion og maskinindlæring. Relaterede forskningsemner inkluderer:

Filformatredit

in silico-repræsentationen af kemiske strukturer bruger specialiserede formater som f.eks. Disse repræsentationer bruges ofte til opbevaring i store kemiske databaser. Mens nogle formater er velegnede til visuelle repræsentationer i to – eller tre-dimensioner, er andre mere velegnede til at studere fysiske interaktioner, modellering og dockingstudier.

virtuelle bibliotekeredit

kemiske data kan vedrøre virkelige eller virtuelle molekyler. Virtuelle biblioteker af forbindelser kan genereres på forskellige måder for at udforske kemisk rum og antage nye forbindelser med ønskede egenskaber. Virtuelle biblioteker af klasser af forbindelser (stoffer, naturlige produkter, mangfoldighedsorienterede syntetiske produkter) blev for nylig genereret ved hjælp af FOG (fragment optimeret vækst) algoritme. Dette blev gjort ved at bruge keminformatiske værktøjer til at træne overgangssandsynligheder for en Markov-kæde på autentiske klasser af forbindelser og derefter bruge Markov-kæden til at generere nye forbindelser, der lignede træningsdatabasen.

virtuel screeningredit

i modsætning til screening med høj kapacitet involverer virtuel screening beregningsmæssig Skærmning i silicobiblioteker af forbindelser ved hjælp af forskellige metoder, f.eksdocking, at identificere medlemmer, der sandsynligvis vil have ønskede egenskaber, såsom biologisk aktivitet mod et givet mål. I nogle tilfælde anvendes kombinatorisk kemi i udviklingen af biblioteket for at øge effektiviteten i minedrift af det kemiske rum. Mere almindeligt screenes et forskelligt bibliotek med små molekyler eller naturlige produkter.

kvantitativ struktur-aktivitetsforhold Rediger

Dette er beregningen af kvantitativ struktur–aktivitetsforhold og kvantitative strukturegenskabsforholdsværdier, der bruges til at forudsige aktiviteten af forbindelser fra deres strukturer. I denne sammenhæng er der også et stærkt forhold til kemometri. Kemiske ekspertsystemer er også relevante, da de repræsenterer dele af kemisk viden som en in silico-repræsentation. Der er et relativt nyt koncept med matchet molekylær paranalyse eller forudsigelsesdrevet mmpa, som er koblet med Ksar-model for at identificere aktivitetsklippe.