Poly[n]catenanes: Syntéza molekulárních propletené řetězy

trochu zinku dělá kroužky odkaz

i když polymeru prameny jsou často neformálně nazývá řetězce, molekulární topologií, které skutečně připomínají rozšířené makroskopické řetězu se ukázaly překvapivě náročné. Většina přístupů se usadila pro uvazování párů vzájemně propojených prstenců uprostřed distančních segmentů. Wu a kol. nyní hlásí úspěšnou syntézu polykatenanů, ve kterých jsou desítky kruhů postupně propojeny. Klíčem bylo použití iontů zinku k šabloně navlékání jednoho prekurzoru makrocyklu skrz lemující předtvarované makrocykly, po kterém katalýza metatézy uzavřela první kroužek,a kov mohl být propláchnut.

Věda, tento problém p. 1434

Abstrakt

Jako makromolekulární verzi mechanicky spojen molekuly, mechanicky spojen polymery jsou slibné kandidáty pro vytvoření sofistikované molekulární stroje a inteligentní měkkých materiálů. Polykatenany, kde molekulární řetězce sestávají výhradně z vzájemně propojených makrocyklů, obsahují jednu z nejvyšších koncentrací topologických vazeb. Jsme zprávu, zde, syntetický přístup k této výrazné polymerní architektury v vysoká vydatnost (~75%), a to prostřednictvím efektivní prsten uzavření racionálně konstruované metallosupramolecular polymerů. Rozptylu světla, hmotnostní spektrometrie a nukleární magnetické rezonance charakteristika frakcionaci vzorků podporu postoupení high–molární hmotnost výrobku (číslo-průměrná molární hmotnost ~21.4 kilogramy na mol) na směs lineárních polykatenanů, rozvětvených polykatenanů a cyklických polykatenanů. Při metalizaci Zn2+byl pozorován zvýšený hydrodynamický poloměr (v roztoku) a teplota skelného přechodu (ve sypkých materiálech).

Mechanicky spojen molekuly (MIMs) jako catenanes, rotaxanes, a uzly jsou přitahuje stále větší pozornost z důvodu jejich estetické topologické struktury (1-3) a jejich potenciál v aplikacích, které sahají od molekulární stroje (4) katalýza (5), léčiv (6), a přepínání ploch (7). Impozantní řadu malých molekul MIMs byl úspěšně syntetizován, a to především prostřednictvím správné orientaci prekurzoru komponent přes noncovalent templating případě, že zaměstnává, například, kov-ligand (1, 2, 8-10), donor-akceptor (11), nebo vodíkové vazby (12) interakce či hydrofobní efekt (3), následuje kovalentní upevnění krok. MIMs s vysokou molární hmotností nebo mechanicky propojené polymery (MIPs), jako jsou polyrotaxany a polykatenany, nabízejí přístup k užitečným vlastnostem pro platformy funkčních měkkých materiálů (13). Snad nejpozoruhodnějším příkladem jsou gely s posuvným kroužkem (podmnožina polyrotaxanů), kde mechanicky propojené prstence fungují jako mobilní síťovací místa. Tyto materiály vykazují vlastnosti proti poškrábání a hojení a byly úspěšně použity jako nátěry proti poškrábání pro mobilní telefony a automobily (14). Jak je zdůrazněno v tomto příkladu, neobvyklé prvky mobility v MIPs (např., nízkoenergetická bariéra pro klouzání prstence podél závitu nebo otáčení kroužků) z nich činí specializovanou třídu polymerů s potenciálem Zobrazit velmi neobvyklou matrici vlastností.

Katenany se skládají z n za sebou vzájemně se uzavírajících kroužků. Polycatenanes jsou polymerní řetězce se skládají výhradně z propletených kroužků a může být myšlenka jako catenanes pro která n je velké a, obecně, dispersity Đ > 1. Tyto vzájemně propojené polymery obsahují velmi vysokou koncentraci topologických vazeb a lze je považovat za molekulární ekvivalent makroskopického řetězce (obr. 1A). Tyto struktury udržet jejich pružnost bez ohledu na to, tuhosti jejich prsten komponenty na účet konformační mobilitu jejich topologické struktury, která umožňuje přístup k oběma vysoká pevnost a vynikající flexibilitu. Obrázek 1B ukazuje hlavní konformační mobilit (rotační, elongational, a houpací pohyby) v páteřní opakovat jednotka jako řetězec pro vhodné velikosti ring (13). Teoretické studie naznačují, že polycatenanes s takovou mobilitu prvků by mohla vykazovat velké ztráty modul pružnosti a nízkou aktivační energii toku a může potenciálně působit jako vyšší energie-tlumení materiálů a/nebo elastomerů s vynikající houževnatost a podněty reagující na mechanické vlastnosti (13, 15, 16).

br. 1 Struktura a konformační mobilita a syntetický přístup k polykatenanům.

(a) schematické znázornění polykatenanové architektury, kterou lze považovat za molekulární ekvivalent robustního a pružného kovového řetězce. B) společné konformační pohyby pozorované u katenanů. C) srovnání kroužkových rotačních mobilit v poly (katenanu) versus polykatenanu. (D) Cílené syntéze polycatenane 3 přes montáž 1 a 2 do metallosupramolecular polymer (MSP), následuje kroužek-zavírání na výnos polycatenate (tj. metallated polycatenane) a demetallation. E) Struktura 1, 2 a 4 (kruhově uzavřený produkt 1). Několik klíčových protonů je označeno modrými velkými písmeny 4 a červenými malými písmeny 2. Krabice zdůrazňuje strukturu skupiny BIP ligand.

syntéza polykatenanů však představuje velkou výzvu. Potvrzená syntéza těchto polymerních topologií s vysokou molární hmotností dosud nebyla hlášena. Většina dřívějších prací na polycatenanes se zaměřuje na poly(catenane)s (obecně přístupné vyvolá bis-funkcionalizovaných catenane) (15, 17-23), poly – a oligocatenanes s nejasně definovanými architektur (24, 25), a polymerní catenanes (tj. dvě propletený cyklické polymery) (26). Tyto materiály poskytly vhled do potenciálně užitečných vlastností MIPs. Například poly(catenane)s prokázaly, konformační flexibilitu podél polymerního řetězce v roztoku (indikováno Kuhn délka segmentu, který je kratší než délka jeho catenane část) (15) a teplotně závislé pohybu kroužků v řešení (18) nebo v sypké materiály (22). Nicméně, na účet kovalentní propojení jednotek přítomných v poly(catenane) páteř, stupeň otáčení kroužku komponenty v catenane složek je omezen (Obr. 1C). Polycatenanes, na druhé straně, mají kroužky spojeny výhradně topologické vazby, což umožňuje plnou rotační pohyblivosti každý prsten (s dostatečnou velikost prstenu), a jako takové by měly vykazovat větší konformační flexibilitu. Jeden z nejúspěšnějších pokusů o přístup oligocatenanes s alespoň sedmi propletené kroužky bylo v poslední době dosaženo prostřednictvím ring-opening polymerace metalo-catenanes tím, Meijer, Di Stefano, a co-pracovníků (25). Specifická Architektura produktu však nemohla být jasně definována. K dnešnímu dni je nejdelším blokovaným molekulárním řetězcem s jasně definovanou strukturou lineární katenan (olympiadan) hlášený Stoddartem a spolupracovníky (27) a nedávno Iwamoto et al. (28), a to jak postupnými přístupy. Stoddart a spolupracovníci také použili podobnou strategii pro přístup k rozvětvenému catenanu (29). Tyto postupné strategie však nejsou účinnými metodikami pro syntézu polykatenanů s dlouhým řetězcem. Jednou z klíčových výzev při syntéze polykatenanů jsou konfliktní reakční podmínky pro přístup k makrocyklům (vyžadujícím nízkou koncentraci)a polymerům (vyžadujícím vysokou koncentraci). Takata, Kihara, a co-pracovníků, navrhuje elegantní řešení tohoto konfliktu převedením překlenout poly(catenane) do polycatenane (20), ale k dnešnímu dni neexistuje žádná zpráva o polycatenane syntetizovány prostřednictvím této trasy.

syntetická strategie vůči polycatenanům zde popsaná a ilustrovaná na obr. 1D, usiluje o oddělení výše uvedených protichůdných syntetické požadavky prostřednictvím preassembly z metallosupramolecular polymer (MSP) jako šablonu, následuje efektivní ring-closing reakce a demetallation výsledné metallated polycatenane. Propagoval Sauvage a spolupracovníky, koordinace kov-ligand byla jednou z nejúspěšnějších syntetických cest k MIMs (1, 2, 8, 9). Terdentátový ligand, 2,6-bis (N-alkyl-benzimidazolyl)pyridin (Bip) (obr. 1E), který váže ionty přechodných kovů, jako je Zn2+ nebo Fe2 + v a 2:1 stechiometrie, byl vybrán, protože je to již bylo prokázáno, že přístup široký výběr funkčních metallosupramolecular polymery, které vykazují foto-léčení (30), podněty reagovat (31), tvar-paměť (32), a ovládací vlastnosti (33). Dále jsme v nedávné době prokázaly, že catenanes mohou být přístupné prostřednictvím blízkosti kvantitativní ring-closing reakce pseudorotaxane sestaven z monotopic Bip-obsahující macrocycle, Zn2+, a ditopic vlákno (1 s R = hexyl) v poměru 2:2:1 (9).

v návaznosti na tyto studie, zaměřili jsme se na MSP shromáždění racionálně konstruované 68-členný ditopic Bip macrocycle 2 s navlékání molekuly 1 a následné prsten uzavření 1 (Obr. 1E). Po přidání 2 ekvivalenty Zn2+ na 1:1 směs 1 a 2, složky samy organizují do střídavé supramolekulární kopolymerní . Střídání je důsledkem principu maximální webu obsazení (34): Dva Bip složek ve stejné (nebo jiné) macrocycle 2 nelze vázat stejné Zn2+ iontů; proto každý Bip jednotka v 2, musí tvořit 2:1 Bip:Zn2 + iontový komplex s jednotkou Bip v 1 pro maximalizaci entalpického zisku (obr. S2). Tvorba MSP byla potvrzena difúzně uspořádanou spektroskopií (DOSY) (obr. Galaxie). Velké vazebné konstanty (>106 M–1 v acetonitrilu) mezi Shk a Zn2+ (35) udržuje MSP v rámci relativně zředěné podmínky na prospěch prsten-ukončení reakce (i když cyklické MSPs by měly být upřednostňovány pod velmi zředěných podmínek). Reakce metatézy uzavírající prstenec vykazovala vynikající konverzi olefinu při 2,5 mM (vzhledem k 1) (obr. S4) a výsledná reakční směs by mohla být snadno demetalována hydroxidem tetrabutylamonium. Obrázek 2A ukazuje srovnání částečné 1H NMR spektrum demetallated surový produkt (se zaměřením na pyridyl protony HA/a) se všemi možnými noninterlocked vedlejších produktů 4 (macrocycle získané z 1), 2, a 5 . Většina HA/a vrcholky hrubého produktu ukazují dopředu, chemický posun, který neodpovídá žádné z možných noninterlocked druhy, ale je v dobré shodě s chemickými posuny pozorované v předchozích studiích na Bip-obsahující catenanes (9), v souladu s tvorbou propletený struktur. Surový produkt také obsahuje malé procento (~20%) neinterlokovaných molekul, které byly přiřazeny k nezreagované 2 a polymeru/oligomeru 5 na základě jejich chemického posunu 1H NMR.

br. 2 NMR charakterizace a čištění polykatenanů.

(A) Částečné 1H NMR (600 MHz, CDCl3) spektrum HA/regionu přečištěné polycatenane ve srovnání se spektry jednotlivých kroužků 2 a 4 a o-produktu ADMET polymer 5 (pro struktury, viz obr. S5). Žlutá oblast zvýrazňuje protony odpovídající vzájemně propojeným BIP skupinám. B) čištění polykatenanů bez chromatografie selektivní metalizací a extrakcí. C) částečné 1H-1H NOESOVÉ spektrum čištěného roztoku polykatenanu (1% hmotnostních v CDCl3) měřeno při -17°C. Některé Noe křížové vrcholy mezi 2 a 4 části jsou zvýrazněny. Červená a modrá písmena jsou jako na obr. 1E. celé spektrum viz obr. 13.

pro snadné odstranění neinterlokovaného vedlejšího produktu jsme vyvinuli postup (obr. 2B), která využila předorganizované blokované struktury cíleného polykatenanu. Podle provázaného ligandového efektu (tj., catenand efekt) (8, 36), kovové ionty přednostně vázat s mechanicky zajištěným ligandy, spíše než noninterlocked zdarma ligandy z důvodu snížení entropické náklady na výchovu ligandy spolu. 1H NMR titrační studie (obr. S5B) potvrdil, že po přídavku Zn2+ do surového produktu, druhu spojené s dopředu posunuté pyridyl protonů zmizí, když se ~70% Bip skupiny jsou metallated, v souladu s selektivní remetallation z propletený druhů. Na noninterlocked vedlejší produkty zůstaly unmetallated, což jim umožňuje být snadno odděleny kapalina-pevná látka extrakce (s 2:1 v/v. chloroform/hexan), takže čistě polycatenane 3 jako solidní v ~75% výnos. Tento krok čištění také odstraňuje některé oligomerní propletený produktů, a to především z důvodu menšího počtu propletený kov-ion vazebná místa, což je statisticky méně pravděpodobné, že váží dost kovových iontů ke změně jejich rozpustnosti.

všechny NMR píky blokovaného produktu 3 byly přiřazeny na základě dvourozměrných NMR studií (obr. S6 až S8). Spektroskopie potvrzuje, že 3 obsahuje ~50% makrocyklu 2 a ~50% složky (nebo složek) odvozené od 1 (na základě integrace 1H NMR) (obr. S10), což je v souladu s tvorbou cílené střídavé polykatenanové struktury. Blokovaná struktura je dále potvrzena spektroskopií jaderného Overhauserova efektu (NOESY) (obr. 2C). Snížení teploty (-17°C) pro snížení kroužkových pohybů v polykatenanu vede k četným křížovým špičkám NOE ve zředěných (1% w/v) roztocích 3. Zvláště zajímavé jsou interkomponentní Noe křížové vrcholy mezi protony v různých makrocyklech (2 a 4). Ve 3 byly pozorovány nejméně čtyři mezikomponentní křížové vrcholy NOE—včetně například jednoho mezi HL 4 a Hn/o 2 (obr. 2C), ale ne v jednoduchých směsích 2 a 4 nebo 2 a 5 (obr. S11 a S12). Vzhledem k tomu, že NOE signály obvykle nevyžaduje protony. <0,5 nm od sebe, tyto údaje silně naznačují, že macrocycles 2 a 4 musí být zajištěny a že 3 je polycatenane.

Mít potvrzeno, propletená struktura, dále jsme použili gelové permeační chromatografie na výklopný rozptyl světla (GPC-MALS) detektor pro měření absolutní molární hmotnost polymerů (37). GPC chromatogram 3 (obr. 3A, černá čára) vykazuje široký vrchol odpovídající průměrné molární hmotnosti Mn = 21,4 kg / mol a disperzi Đ = 1,44 (Tabulka 1). Při každém objemu eluce je absolutní molární hmotnost znázorněna jako červená tečkovaná čára, což naznačuje, že distribuce produktu 3 obsahuje druhy s molární hmotností do ~200 kg / mol, což odpovídá polykatenanu. Dekonvoluce širokého píku v chromatogramu poskytuje tři subpeaky (I až III), což znamená, že produkt polykatenanu může obsahovat tři různé architektury. Naměřené absolutní molární hmotností (od MALS) tyto tři vrcholy jsou o 20 až 200 10 až 40, a 6 až 10 kg/mol, což by odpovídalo polycatenanes, polycatenanes, a polycatenanes, resp. Relativní procento tří vrcholů se odhaduje (na základě oblastí špiček) na 28, 61 a 11%.

br. 3 molární hmota a architektura charakterizace polykatenanů.

(a) chromatogram GPC, měření absolutní molární hmotnosti MALS a maximální dekonvoluce 3. a. u., libovolné jednotky. (B) Navrhované architektury odpovídající tři deconvoluted vrcholy, mechanismu tvorby, a odpovídající průměrný počet řetězec končí (NC). RCM, metatéza uzavírající prstenec. (C), GPC chromatogramy frakcionované polycatenane frakce (3a až 3d, intenzity normalizovány podle jejich relativní hmotnosti v procentech) ve srovnání s nefrakcionovaným polycatenane 3. Jsou také zobrazeny rozsahy objemu eluce tří dekonvolutovaných vrcholů (I až III). (D) MALDI-TOF spektra polykatenanové frakce 3b. dolní vrcholy (označené hvězdičkami) jsou z násobně nabitých molekulárních iontů. m / z, poměr hmotnost/náboj. E) částečná 1H NMR (500 MHz, CDCl3) spektra ukazující oblast HA/a 3a až 3d ve srovnání se dvěma kontrolami: katenanem (6) a cyklickým polykatenanem (7). Jsou definovány čtyři oblasti (α, β, γ, δ). Vrcholy řetězce a specifické vrcholy pro cyklické katenany jsou zvýrazněny žlutě a zeleně.

Tabulka 1 Molární hmotnost a architektury 3 a 3a až 3d.

Mn, číslo-průměrná molární hmotnost; DP, stupeň polymerace; Đ, dispersity; NC, průměrný počet řetězec končí; NCEx, průměrný počet řetězec končí pro acyklické polycatenanes.

Embedded Image
Zobrazit tato tabulka:

  • Zobrazit popup
  • Zobrazit inline

Jedním z možných vysvětlení pro vrcholy I, ii a III je tvorba rozvětvené, lineární a cyklické architektury, respektive, jak je znázorněno na Obr. 3B. Kromě cílené lineární polycatenanes, to je jistě možné, že interchain reakce (dimerizace a oligomeraci 4) může dojít, což vede k vyšší molární hmotnost rozvětvené polycatenanes. Dále je také možné, že procento MSP jsou cyklické struktury s nižší molární hmotností, což by zase vedlo k cyklickým polykatenanům. Jedním důkazem naznačujícím cyklické polykatenany je pozorovaný přechodový vrchol mezi vrcholy II a III při měření absolutní molární hmotnosti (obr. 3A, při ~9,2 ml). Pokud pík III odpovídá cyklické geometrii, očekávali bychom, že tyto kompaktnější struktury budou koelutovat s lineárními polymery s nižší molární hmotností (38).

více plně charakterizovat polycatenane směsi, jsme provedli preparativní GPC na 3, získávání čtyři zlomky 3a až 3d. 1H NMR studie potvrdily, že všechny čtyři frakce obsahují ~50% macrocycle 2, v souladu s nimi se všemi, že polycatenanes (obr. S14). GPC-MALS každé frakce potvrdila úspěšnou separaci založenou na velikosti (obr. 3C a obr. S15) a čtyři frakce vykazovaly klesající molární hmotnost (Tabulka 1) s relativně úzkým Đ (1,11 až 1,18) (Tabulka 1). Na základě eluční časy, zlomky 3a a 3b většinou odpovídají vrcholu jsem, 3c převážně odpovídá peak II, a 3d obsahuje směs vrcholy II a III. Matricí asistované laserové desorpce/ionizace–time-of-flight (MALDI-TOF) hmotnostní spektrometrie potvrdila přítomnost vysoce molární hmotnost polymery s molekulární ion vrcholy odpovídající až polycatenane v 3b (Obr. 3D) a až do polykatenanu pro 3c (obr. S16).

Jeden způsob, jak charakterizovat architektur (rozvětvené a lineární, nebo cyklický) polycatenanes ve zlomcích 3a až 3d je objasnit průměrný počet řetězec končí (NC) polymerů v každé frakci. Podle definice se NC rovná 0 pro cyklické polykatenany, 2 pro lineární polykatenany a ≥4 pro rozvětvené polykatenany (obr. 3B). S absolutní molární hmotnost jednotlivých frakcí k dispozici od MALS, jejich stupně polymerizace (DPs, který definujeme zde jako ekvivalent k n) lze snadno vypočítat pomocí MMALS/1544 (výsledky uvedeny v Tabulce 1), kde MMALS je molární hmotnost z GPC-MALS a 1544 g/mol je střední molární hmotnost 2 a 4 (za předpokladu, že poměr 1:1 v polymeru). Poté je možné vypočítat NC kombinací těchto dat s analýzou NMR chain-end (eq. S1). Klíčem k těmto výpočtům je nalezení diagnostických špiček polykatenanů na konci řetězce v 1H NMR spektrech. Za tímto účelem byl a (převážně) katenan 6 cílen a syntetizován reakcí 1 v přítomnosti dvou ekvivalentů iontů 2 a Zn2+ (obr. S17) a jeho NMR spektrum bylo porovnáno s 3A a 3d na obr. 3E. tři skupiny vrcholů pro HA / a 6 s ~1:1:1 vrcholové oblasti (obr. S17) byly pozorovány a definovány jako oblasti α (8.235 až 8.270 ppm), β (8.195 až 8.235 ppm) a γ (8.150 až 8.195 ppm). Nižší intenzita oblasti α v 3a až 3d, ve srovnání s intenzitou v 6, spolu s delší dobou relaxace NMR protonů v oblasti α (obr. S18), potvrzuje, že tato oblast odpovídá konci řetězce (viz doplňkové materiály). Při tomto přiřazení lze průměrný počet konců řetězců, NC, vypočítat pomocí Eq. 1Embedded Image(1)kde IA/to je celkem vrchol integrace HA/a a Ia je řetěz-end integraci píků HA/rok (tj. regionu α; viz nek. S1 až S3 pro odvození detailů). Výsledky výpočtů NC pro 3 A 3a až 3d jsou shrnuty v tabulce 1. Frakce 3a (NC = 8.7) a 3b (NC = 4.7) jsou převážně rozvětvené, zatímco 3c (NC = 1.7) a 3d (NC = 1.2) zdá se, že obsahují různá množství cyklických polykatenanů, které vedou k NC < 2. K identifikaci podílu cyklických polykatenanů v těchto posledních frakcích byly provedeny další studie zaměřené na specificky zaměřený cyklický polykatenan 7. Toho bylo dosaženo provedením tvorby MSP (za použití Fe2+ jako kovového iontu) a reakcí uzavírající kruh při mnohem nižších koncentracích (viz doplňkové materiály a obr. S19). Porovnání oblasti HA / a v 1H NMR spektrech (obr. 3E) frakcí obsahujících cyklický polykatenan (3c, 3d a 7) ukazuje další posun nahoru na 8,06 až 8,15 ppm (obr. 3e, zelená oblast), která je definována jako oblast δ. Naproti tomu vzorky obsahující acyklický polykatenan (3a, 3b a 6) nemají v této oblasti žádné píky. Proto je rozumné dospět k závěru, že oblast δ je specifická pro cyklické polykatenany. Ve srovnání s acyklické polycatenanes (3a a 3b) nebo catenane 6, zdá se, že ~50% A/A vrcholky cyklické polycatenane 7 jsou posunuty více dopředu. Jedním z možných vysvětlení je, že cyklická Architektura omezuje konformační mobilitu, což má za následek kompaktnější molekulu (obr. S19E) a umožňující další stínící účinky ze sousedních aromatických skupin. Vzhledem k tomu, že integrál HA / a v 7 ukazuje, že ~50% jeho HA/a protonů je přítomno v oblasti δ (obr. S20), je možné stanovit průměrný počet konců řetězců pro acyklické polykatenany (NCEx) přítomné v každé frakci Eq. 2 (odvození viz eqs. S3 až S5)vložený obraz(2), kde Iδ je špičková integrace oblasti δ v NMR spektrech (obr. 3E). Výsledky těchto výpočtů ukazují, že oba 3c a 3d se NCEx ≈ 2 (NC < 2), v souladu se skutečností, že oba obsahují směs lineárních a cyklických polycatenanes s procentem cyklické polycatenanes v 3c a 3d je ~15 ~34%, respektive (vypočteno pomocí eq. S6). Tabulka 1 shrnuje molární hmotnost a architektonická data 3 a čtyř frakcí 3a až 3d. Frakce s nejvyšší molární hmotností (3a)je přiřazena vysoce rozvětveným polykatenanům (na základě analýzy MALS) (obr. S15A) s průměrným DP = 55. Frakce 3b sestává z nižšího stupně větvení polykatenanů s průměrným DP = 25. Frakce 3c a 3d obsahují hlavně lineární (s některými cyklickými) polykatenany s až 27 (průměrný DP = 11) (obr. S15C) a 20 (průměrný DP = 8) (obr. S15d) blokované kroužky, resp. Na základě dat ze čtyř frakcí, můžeme odhadnout, že celkový podíl rozvětvené, lineární a cyklické polycatenanes je ~24, ~60 a ~16%, respektive, což odpovídá dobře s GPC špičkový výsledek dekonvoluce (28, 61, 11%, respektive) (Obr. 3A). Dohromady jsou tyto údaje v souladu s tím, že polykatenan 3 je směsí rozvětvených polykatenanů, lineárních polykatenanů a cyklických polykatenanů, přibližně ve výše uvedených poměrech.

je známo, že katenany připravené pomocí kovových šablon vykazují metalo-citlivé chování (36). Jako takové byly zkoumány vlastnosti těchto polykatenanů reagujících na metallo podněty v roztoku i ve velkém množství měřením hydrodynamického poloměru Rh (obr. 4A a obr. S21) a teplota skelného přechodu (Tg) (obr. 4B a obr. S22), resp. Kromě Zn2+ iontů do polycatenanes by měl zamknout konformační pohyby kroužky, čímž přiměje přejít od vysoce flexibilní polymery semi-rigidní polymerní, kde flexibilitu pochází především z tetraetylenglykol (TEG) skupiny (Obr. 4A). U převážně lineárních polykatenanů (3c, průměrný DP = 11) vykazuje přidání Zn2+ podstatné (~70%) zvýšení Rh z 3, 9 na 6, 6 nm (obr. 4A). Tento výsledek dobře souhlasí se simulacemi molekulární dynamiky všech atomů metalizovaného lineárního polykatenanu(viz doplňkové materiály). Molekuly byly simulovány s OPLS (optimized potentials for liquid simulations) all-atom silové pole (39) s 1,1,2,2-tetrachloroethane jako rozpouštědlo a vlastnosti polymeru zkoumali pomocí force-rozšíření experimentu. Pro modelování polycatenanu pod napětím byl katenan připojen k sobě prostřednictvím periodických okrajových podmínek (obr. 4C); prodloužení bylo vynuceno délkou systému (box), která je systematicky měněna; a odpovídající napětí vyplývá z tlakového tenzoru (eq. S9). Chování při prodlužování síly je dobře popsáno modelem (40) roztažitelného šnekového řetězce (EWLC), jak je znázorněno na obr. 4C. Podle této interpretace, každý macrocycle příspěvek na obrys délka, l = 2.40 ± 0.03 nm, je podstatně menší než vytrvalost délka lp = 7.46 ± 2.88 nm, což je charakteristické pro polotuhý polymer. Tato flexibilita může být opět primárně přičítána Teg segmentům makrocyklu 2, o čemž svědčí větší fluktuace v intermetálních vzdálenostech pro 2 versus 4 (obr. S28 a S29). Na základě simulací neperiodického metalizovaného katenanu je Rh ~34% koncové vzdálenosti (Ree). Pro metalizovaný polykatenan libovolného DP lze Ree vypočítat pomocí statistik řetězců podobných červům (eq. S15) a výsledky simulací rozšíření síly. Rh pro průměrný polykatenan ve frakci 3c se tedy odhaduje na 6,89 ± 1.38 nm, v dobré shodě s výsledky DLS (6,6 nm), což dále podporuje závěr, že frakce 3c je primárně lineární polykatenan (viz doplňkové materiály). Simulovaná struktura metalizovaného lineárního polykatenanu pod ~15 PN napětím je znázorněna na obr. 4D, zobrazující segment 12 vzájemně propojených kroužků.

br. 4 experimentální studie a simulace metalizovaných polykatenanů.

(A) Ilustrace metalo-citlivý konformační změna lineární polycatenane mezi flexibilní a semi-rigidní struktury, jak je uvedeno hydrodynamický poloměr (Rh) změna (obr. S21). Flexibilita metalizovaného polykatenanu je primárně způsobena Teg mocí makrocyklu 2. B) údaje DSC pro lineární polykatenany (demetalované a metalizované) ve srovnání s údaji pro Admet polymer 5 (Tg vypočtené polovinou výšky středu). „Exo Up“ znamená, že směr exotermického tepelného toku je nahoru. (C) simulovaná křivka prodloužení síly vytvořená změnou délky krabice metalizovaného lineárního katenanu připojeného k sobě prostřednictvím periodických okrajových podmínek ve směru z. Data ze simulací (zelené kruhy, velikost datového bodu obsahuje chybu) jsou vhodné extensible červ-jako řetězce (EWLC) model (černé čárky). (D) Vizualizace metallated lineární polycatenane (ukazuje segmentu 12 propletené kroužky) pod napětí ~15 pN ze všech-atom molekulární dynamiky, simulace v 1,1,2,2-tetrachloroethane rozpouštědla (rozpouštědla a vodíkové atomy vynechány pro přehlednost).

Podobné lineární polycatenane, metallation rozvětvených polycatenane (3b, průměr DP = 24.9) s Zn2+ ukazuje ~50% nárůst v Rh na metallation (5.0 až 7,6 nm) (obr. S21B), pravděpodobně v důsledku prodloužení svých paží. Metalizace cyklického polykatenanu 7 (Průměrná DP = 6) vykazuje pouze relativně malou změnu Rh (~10%, od 2,4 do 2,6 nm) (obr. S21C), což je v souladu s jeho cyklickou architekturou omezující Rozšíření řetězce. V hromadné, Tg hodnoty polycatenane s převážně lineární (3c) a rozvětvené architektur (3b) bylo zjištěno, že 97° a 104°C, respektive, ve srovnání s 137°C po dobu 5 (lineární ADMET polymer 1) . Obecně platí, že polymery s větší svobodu segmentální pohyb ukazují nižší hodnoty Tg, což je v souladu s více povrchní konformační molekulární pohyby očekává, že na celém polycatenane páteř. Metalizace Zn2+ blokuje tyto konformační pohyby a podstatně snižuje pružnost polykatenanu; jako takové nejsou pozorovány žádné hodnoty Tg při zahřátí na 160°C pro lineární i rozvětvené vzorky (obr. 4B a obr. S22).

Závěrem lze říci, že úspěšné syntézy polycatenanů s hlavním řetězcem pomocí šablony MSP bylo dosaženo v ~75% výtěžku. Izolovaná směs produktů zahrnuje lineární polykatenany, rozvětvené polykatenany a cyklické polykatenany. Tato syntetická strategie otevírá dveře návrhu a syntéze řady nových vzájemně propojených polymerů.

doplňkové materiály

www.sciencemag.org / obsah/358/6369/1434/suppl / DC1

materiály a metody

doplňkový Text

obr. S1 až S29

Stoly S1 až S3

Odkazy (41-93)

http://www.sciencemag.org/about/science-licenses-journal-article-reuse

Tohle je článek distribuovaný pod podmínkami vědeckých Časopisů, Default Licence.

Poznámky a Odkazy

    1. K. S. Chichak,
    2. S. J. Cantrill,
    3. A. R. Pease,
    4. S.-H. Chiu,
    5. G. W. V. Jeskyně,
    6. J. L. Atwood,
    7. J. F. Stoddarta

    , Molekulární boromejské kroužky. Věda 304, 1308-1312 (2004). doi: 10.1126 / věda.1096914pmid:15166376

    1. j. J. Danon,
    2. A. Krüger,
    3. D. A. Leigh,
    4. J. F. Lemonnierová,
    5. a. J. Stephens,
    6. I. J. Vitorica-Yrezabal,
    7. S. L. Woltering

    , Pletení molekulární uzel s osmi přechodů. Věda 355, 159-162 (2017). doi: 10.1126 / věda.aal1619pmid:28082585

    1. N. Ponnuswamy,
    2. F. B. L. Cougnon,
    3. J. M. Clough,
    4. G. D. Pantoş,
    5. J. K. M. Sanders

    , objev organického trojlístku. Věda 338, 783-785 (2012). doi: 10.1126 / věda.1227032pmid:23139329

    1. S. Erbas-Cakmak,
    2. D. A. Leigh,
    3. C. T., McTernan,
    4. A. L. Nussbaumer

    , Umělé molekulární přístroje. Cheme. Rev. 115, 10081-10206 (2015). doi: 10.1021 / acs.chemrev.5b00146pmid:26346838

    1. P. Thordarson,
    2. E. J. a. Bijsterveld,
    3. a. E. Rowan,
    4. R. J. M. Nolte

    , Epoxidace polybutadienu topologicky vázaným katalyzátorem. Nature 424, 915-918 (2003). doi:10.1038/nature01925pmid:12931181

    1. K. K. Cotí, a M. E. Belowich, a M. Liong, a M. W. Ambrogio,
    2. Y. a. Lau, a H. a. Khatib,
    3. J. l. Zink, a N. M. Khashab,
    4. J. F. Stoddarta

    , Mechanizované nanočástic pro dodávky drog. Nanoscale 1, 16-39 (2009). pmid:20644858

    1. j. J. Davis,
    2. G. a. Orlowski, h. zřídka, P. D. pivo

    , mechanicky propojené a přepínatelné molekuly na površích. Cheme. Společný. 46, 54-63 (2010). doi:10.1039/B915122Bpmid:20024293

    1. C. O. Dietrich-Buchecker,
    2. J. P. Sauvage,
    3. J. P. Kintzinger

    , Une nouvelle de famille molekuly: metalo-catenanes. Čtyřstěn Lett. 24, 5095-5098 (1983). doi:10.1016/S0040-4039(00)94050-4

    1. R. J. Wojtecki,
    2. Q Wu,
    3. J. C. Johnson, a D. G. Ray,
    4. L. T. J. Korley,
    5. S. J. Rowan

    , Optimalizace vzniku 2,6-bis(N-alkyl-benzimidazolyl)pyridin-obsahující catenates přes component design. Cheme. Věda. 4, 4440 (2013). doi:10.1039/c3sc52082j

    1. H. Lahlali,
    2. K. Jobe,
    3. M. Watkinson,
    4. S. M. Goldup

    , Macrocycle na velikosti záleží: „malé“ funkcionalizovaných rotaxanes ve vynikající výnos pomocí CuAAC aktivní přístup šablony. Angew. Cheme. Int. EDA. 50, 4151–4155 (2011). doi: 10.1002 / anie.201100415pmid:21462287

    1. P. R. Ashton,
    2. T. T. Goodnow,
    3. a. E. Kaifer,
    4. M. Reddington,
    5. A. M. Z. Slawin,
    6. N. Spencer,
    7. J. F. Stoddarta,
    8. C. Vicent,
    9. D. J. Williams

    , catenane na zakázku. Angew. Cheme. Int. EDA. Angl. 28, 1396–1399 (1989). doi: 10.1002 / anie.198913961

    1. G. a. Breault,
    2. C. a. Hunter,
    3. P. C. Mayers

    , Supramolekulární topologie. Čtyřstěn 55, 5265-5293 (1999). doi: 10.1016 / S0040-4020 (99)00282-3

    1. z. Niu, HW Gibson

    , Polycatenany. Cheme. Rev. 109, 6024-6046 (2009). doi:10.1021/cr900002hpmid:19670889

    1. Y. Noda,
    2. Y. Hayashi, a K. Ito

    , Z topologické gely na snímek-kroužek materiálů. J.Appl. Polym. Věda. 131, 40509 (2014). doi: 10.1002 / aplikace.40509

    1. J. L., Weidmann,
    2. J. Kern,
    3. J. P. Sauvage, a D Muscat, a . Mullins,
    4. W. Köhler,
    5. C. Rosenauer,
    6. H. J. Räder,
    7. K. Martin,
    8. Y. Geerts

    , Polycatenanes a cyklické oligocatenanes obsahující střídavý topologické a kovalentní vazby: Syntéza a charakterizace. Chemie 5, 1841-1851 (1999). doi:10.1002/(SICI)1521-3765(19990604)5:6<1841::AID-CHEM1841>3.0.CO;2-Q

    1. T. Pakula,
    2. K. Jeszka

    , Simulace jediné komplexní makromolekuly. 1. Struktura a dynamika katenanů. Makromolekuly 32, 6821-6830 (1999). doi:10.1021/ma990248c

    1. J. Weidmann,
    2. J. M. Kern,
    3. J. Sauvage,
    4. Y. Geerts,
    5. D Muscat,
    6. K. Müllen

    , Poly-catenanes obsahující střídavý topologické a kovalentní vazby. Cheme. Komunista. 1996, 1243–1244 (1996). doi:10.1039/CC9960001243

    1. C. Hamers,
    2. F. M. Raymo,
    3. J. F. Stoddart

    , Main-chain a pendant poly(catenane) s obsahující komplementární π-elektronově bohaté a-deficitní složky. Euro. J.Org. Cheme. 1998, 2109-2117 (1998). doi:10.1002/(SICI)1099-0690(199810)1998:10<2109::AID-EJOC2109>3.0.CO;2-M

    1. D Muscat,
    2. W. Kohler, a H. J. Räder, a K. Martin, a S. Mullins, a B. Müller, a K. Müllen,
    3. Y. Geerts

    , syntéza a charakterizace poly-katenanů obsahujících tuhé katenanové segmenty. Makromolekuly 32, 1737-1745 (1999). doi:10.1021/ma981077z

    1. N. Watanabe,
    2. Y. Ikari,
    3. N. Kihara,
    4. T. Takata

    , Překlenul polycatenane. Makromolekuly 37, 6663-6666 (2004). doi:10.1021/ma048782u

    1. C. Hamers,
    2. O. Kocian,
    3. F. M. Raymo,
    4. J. F. Stoddart

    , poly (biscatenan) obsahující kombinaci kovalentních, mechanických a koordinačních vazeb. ADV.Mater. 10, 1366–1369 (1998). doi:10.1002/(SICI)1521-4095(199811)10:16<1366::AID-ADMA1366>3.0.CO;2-D

    1. C. a. Fustin,
    2. C. Bailly,
    3. G. J. Clarkson,
    4. P. De Groote,
    5. T. H. Galow,
    6. D. A. Leigh,
    7. D. Robertson,
    8. A. M. Z. Slawin,
    9. J. K. Y. Wong

    , Mechanicky spojeny polykarbonátu. J.Am. Cheme. SOC. 125, 2200–2207 (2003). doi:10.1021/ja0292546pmid:12590548

    1. B. N. Ahamed,
    2. P. Van Velthem,
    3. K. Robeyns,
    4. C. a. Fustin

    , Vliv jednoho catenane na solid-state vlastností mechanicky spojeny polymerů. ACS Macro Lett. 6, 468–472 (2017). doi: 10.1021 / acsmacrolett.7b00204

    1. K. Endo,
    2. T. Shiroi,
    3. N. Murata,
    4. G. Kojima,
    5. T. Yamanaka

    , Syntéza a charakterizace poly(1,2-dithiane). Makromolekuly 37, 3143-3150 (2004). doi:10.1021/ma021237d

    1. J. a., Berrocal,
    2. L. M. Pitet,
    3. M. M. L. Nieuwenhuizen,
    4. L. Mandolini,
    5. E. W. Meijer,
    6. St. Stephen

    Ring-opening metathesis polymerací diolefinic -catenane–copper(i) complex: snadná cesta k polycatenanes. Makromolekuly 48, 1358-1363 (2015). doi: 10.1021 / ma502392v

  1. ↵ Advincula

, Catenated Pol ((CAPR Makromolekul 48, 3825-3833 (2015). doi: 10.1021 / acs.makromol.5b00470

    1. D. B. Amabilino,
    2. P. R. Ashton,
    3. A. S. Reder,
    4. N. Spencer,
    5. J Angew Chem. Int.EDA. Angl. 33, 1286–1290 (1994). doi: 10.1002 / anie.199412861
    1. h. Iwamoto,
    2. s. Tafuku,
    3. y. Sato,
    4. W. Takizawa,
    5. W. Katagiri,
    6. E. Tayama,
    7. E. Hasegawa,
    8. Y. Fukazawa,
    9. T. Haino

    , Syntéza lineárních catenanes přes olefin metathesis dimerizace pseudorotaxanes skládá z catenane a sekundární amonné soli. Cheme. Komunista. 52, 319–322 (2016). doi:10.1039/C5CC07562Apmid:26515104

    1. D. B. Amabilino,
    2. P. R. Ashton,
    3. S. E. Boyd,
    4. J. Y. Lee,
    5. S. Menzer,
    6. J. F. Stoddarta,
    7. D. J. Williams

    , pětistupňová vlastní montáž rozvětveného heptakatenanu. Angew. Cheme. Int. EDA. Angl. 36, 2070–2072 (1997). doi: 10.1002 / anie.199720701

    1. M. Burnworth,
    2. L. Tang,
    3. J. R. Kumpfer,
    4. a. J. Duncan,
    5. F. L. Beyer,
    6. G. L. Fiore,
    7. S. J. Rowan,
    8. C. Weder

    , Opticky healable supramolekulární polymery. Příroda 472, 334-337 (2011). doi:10.1038/nature09963pmid:21512571

    1. R. J. Wojtecki,
    2. M. a. Meador,
    3. S. J. Rowan

    , Pomocí dynamické vazba na přístup makroskopicky citlivý strukturálně dynamické polymery. Adresa. Matry. 10, 14–27 (2011). doi:10.1038/nmat2891pmid:21157495

    1. J. R. Kumpfer,
    2. S. J. Rowan

    , Termo-, foto-, chemo-citlivý tvar-paměť vlastnosti z foto-cross-linked metalo-supramolekulární polymery. J.Am. Cheme. SOC. 133, 12866–12874 (2011). doi:10.1021/ja205332wpmid:21790172

    1. B. T. Michal,
    2. B. M. McKenzie,
    3. s. e. Felder,
    4. S. J. Rowan

    , Metallo -, termo-a fotoreportivní tvarová paměť a ovládání kapalných krystalických elastomerů. Makromolekuly 48, 3239-3246 (2015). doi: 10.1021 / acs.makromol.5b00646

    1. R. Kramer,
    2. J. M. Lehn,
    3. A. Marquis-Rigault

    , Self-uznání v helicate self-montáž: Spontánní vznik spirálových kovových komplexů ze směsí ligandů a kovové ionty. Proc. Natle. Acad. Věda. U.S. A. 90, 5394-5398 (1993). doi: 10.1073 / pnas.90.12.5394 pmid:11607405

    1. S. J. Rowan,
    2. J. B. Beck

    , Kov-ligand vyvolané supramolekulární polymerizace: cesta k citlivé materiály. Faraday Diskutovat. 128, 43–53 (2005). doi:10.1039/B403135Kpmid:15658766

    1. J. E. M. Lewis,
    2. M. Galli,
    3. S. M. Goldup

    , Vlastnosti a rozvíjejících se aplikací mechanicky spojen ligandy. Cheme. Komunista. 53, 298–312 (2016). doi:10.1039/C6CC07377Hpmid:27819362

    1. P. J. Wyatt

    , rozptyl světla a absolutní charakterizace makromolekul. Anální. Chime. Acta 272, 1-40 (1993). doi:10.1016/0003-2670(93)80373-S

    1. C. W. Bielawski,
    2. D. Benitez,
    3. R. H. Grubbs

    , „nekonečné“ cestě do cyklické polymery. Věda 297, 2041-2044 (2002). doi: 10.1126 / věda.1075401pmid:12242440

    1. W. L. Jorgensen,
    2. D. S. Maxwell,
    3. J. Tirado-Rives

    , vývoj a testování all-atomového silového pole OPLS na konformační energetiku a vlastnosti organických kapalin. J.Am. Cheme. SOC. 118, 11225–11236 (1996). doi: 10.1021/ja9621760

    1. T. Odijk

    , tuhé řetězy a vlákna pod napětím. Makromolekuly 28, 7016-7018 (1995). doi:10.1021/ma00124a044

    1. M. P Sibi,
    2. G. Petrovic

    , Enantioselektivní radikální reakce: použití kovových triflimides jako Lewis kyselin. Čtyřstěn ASM Mmetry doi:10.1016/S0957-4166(03)00543-3

    1. B. M. McKenzie,
    2. A. K. Miller,
    3. R. J. Wojtecki,
    4. J. C. Johnson,
    5. K. a., Burke,
    6. K. a., Tzeng,
    7. P. T. Mather,
    8. S. J. Rowan

    Lepší syntéza funkcionalizovaných mesogenic 2,6-bisbenzimidazolylpyridine ligandy. Čtyřstěn 64, 8488-8495 (2008). doi: 10.1016 / t2008.05.075

    1. h. Sashia Roy

    , chemická modifikace chitosanu 11: chitosan-dendrimer hybrid jako stromová molekula. Karbohydr. Polym. 49, 195–205 (2002). doi:10.1016/S0144-8617(01)00322-8

  • F. Heatley, v NMR Spektroskopie Polymerů (Springer, 1993), s. 1-49.

    1. M. Enamullah,
    2. W. Linert

    , Substituent a rozpouštědel-vliv na stabilitu železa(II)-4-X-2,6-bis-(benzimidazol-2′-yl)pyridin komplexy ukazuje spin-crossover v roztoku. J. Coord. Cheme. 40, 193–201 (1996). doi: 10.1080/00958979608024344

    1. H. J. C. Berendsen, a D. van der Spoel,
    2. R. van Drunen

    , GROMACS: vzkaz-absolvování molekulární dynamiky paralelní provádění. Comput. Phys. Společný. 91, 43-56 (1995). doi:10.1016/0010-4655(95)00042-E

    1. M. J. Abraham, a T Murtola,
    2. R. Schulz, a S. Páll,
    3. J. C. Smith, a B. Hess, a , E. Lindahl

    , GROMACS: Vysoce výkonné molekulární simulace prostřednictvím víceúrovňového paralelismu od notebooků po superpočítače. SoftwareX 1-2, 19-25 (2015). doi: 10.1016 / j. softx.2015.06.001

    1. N. a. McDonald,
    2. W. L. Jorgensen

    , pedago-atom silové pole pro heterocykly. Vlastnosti kapalného pyrrolu, Furanu, diazolů a oxazolů. J.Phys. Cheme. B 102, 8049-8059 (1998). doi:10.1021/jp981200o

    1. W. L. Jorgensen,
    2. N. a. McDonald

    , vývoj celoatomového silového pole pro heterocykly. Vlastnosti kapalného pyridinu a diazenů. J. Mol. Struct. THEOCHEM 424, 145-155 (1998). doi:10.1016/S0166-1280(97)00237-6

    1. W. L. Jorgensen,
    2. J. Tirado-Rives

    , Potenciální energie funkcí pro atomové úrovni simulace vody a organických a biomolekulárních systémů. Proc. Natle. Acad. Věda. USA 102, 6665-6670 (2005). doi: 10.1073 / pnas.0408037102pmid: 15870211

    1. M. K. Dahlgren,
    2. p. Schyman,
    3. J. Tirado-Rives,
    4. W. L. Jorgensen

    , Charakterizace biaryl torzní energetika a její léčba v OPLS all-atom silová pole. J. Chem. Inf. Model. 53, 1191–1199 (2013). doi:10.1021/ci4001597pmid:23621692

  • M. P. Allen, D. J. Tildesley, Počítačové Simulace Kapalin (Oxford Science Publications, 1989).

    1. T. Darden,
    2. D Yorku,
    3. L. Pedersen

    , Particle mesh Ewald: N-log(N) metody pro Ewald částky ve velkých systémech. J. Chem. Phys. 98, 10089-10092 (1993). doi:10.1063/1.464397

    1. U Essmann, , L. Perera, a M. L. Berkowitz, a T Darden, a H. Lee, , L. G. Kp

    , Hladké particle mesh Ewald metoda. J. Chem. Phys. 103, 8577-8593 (1995). doi: 10.1063/1.470117

    1. s.Nosé

    , metoda molekulární dynamiky pro simulace v kanonickém souboru. Molo. Phys. 52, 255-268 (1984). doi: 10.1080/00268978400101201

    1. w. g. Hoover

    , kanonická dynamika: rovnovážné rozdělení fázového prostoru. Phys. Rev. A 31, 1695-1697 (1985). doi: 10.1103 / PhysRevA.31.1695 pmid:9895674

    1. M. Parrinello,
    2. A. Rahman

    , Polymorfní přechody v jednotlivých krystalů: nová metoda molekulární dynamiky. J.Appl. Phys. 52, 7182–7190 (1981). doi: 10.1063 / 1.328693

  • y.Markus, vlastnosti rozpouštědel (Wiley, 1998).

    1. C. Caleman,
    2. P. J. van Maarenovi,
    3. M. Hong,
    4. J. S. Náboje,
    5. L. T. Costa,
    6. D. van der Spoel

    , Silové pole, měřítko organické kapaliny: Hustota, výparné entalpie, tepelné kapacity, povrchové napětí, izotermická stlačitelnost, objemové roztažnosti, a dielektrické konstanty. J. Chem. Teorie Comput. 8, 61–74 (2012). doi:10.1021/ct200731vpmid:22241968

    1. B. Hess,
    2. H. Bekker,
    3. H. J. C. Berendsen,
    4. J. G. E. M. Fraaije

    , LINCS: lineární omezení solver pro molekulární simulace. J. Cheme. 18, 1463–1472 (1997). doi:10.1002/(SICI)1096-987X(199709)18:12<1463::AID-JCC4>3.0.CO;2-H

    1. B. Hess

    , P-LINCS: paralelní lineární omezení solver pro molekulární simulace. J. Chem. Teorie Comput. 4, 116–122 (2008). doi:10.1021/ct700200bpmid:26619985

    1. W. F. van Gunsteren,
    2. H. J. C. Berendsen

    , Počítačové simulace, molekulární dynamika: metodika, aplikace a perspektivy v chemii. Angew. Cheme. Int. EDA. Angl. 29, 992–1023 (1990). doi:10.1002 / anie.199009921

    1. W mol Graf. 14, 33–38 (1996). doi:10.1016 / 0263-7855(96) 00018-5pmid:8744570
    1. G. Bussi,
    2. D. Donadio,
    3. M. Parrinello

    , Kanonické odběru prostřednictvím změny měřítka rychlost. Em PHS 126, 014101 (2007). doi: 10.1063 / 1.2408420 pmid: 17212484

    1. h. Ber van Gunsteren,
    2. a. DiNola,
    3. J. R. Haak

    , molekulární dynamika s vazbou na vnější lázeň. J. Chem. Phys. 81, 3684–3690 (1984). doi:10.1063/1.448118

    1. D. van der Spoel,
    2. P. J. van Maarenovi,
    3. C. Caleman

    , GROMACS molekula & tekuté databáze. Bioinformatika 28, 752-753 (2012). doi:10.1093/bioinformatika/bts020pmid:22238269

    1. B. J. Palmer

    , výpočty autokorelační funkce příčného proudu smykové viskozity pro molekulární kapaliny. Phys. Rev. E 49, 359-366 (1994). doi: 10.1103 / PhysRevE.49.359 pmid:9961225

    1. W. F. Van Gunsteren,
    2. H. J. C. Berendsen

    , leap-frog algoritmus pro stochastické dynamiky. Molo. Simule. 1, 173–185 (1988). doi:10.1080/08927028808080941

  • M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. a. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, G. Petersson, H. Nakatsuji, X. Li, M. Caricato, A. Marenich, J. Bloino, B. G. Janesko, R. Gomperts, B. Mennucci, H. P. Hratchian, J. V. Ortiz, A. F. Izmaylov, J. L. Sonnenberg, D. Williams-Mladý, F. Ding, F. Lipparini, F. Egidi, J. Odchody, B. Peng, A. Petrone, T. Henderson, D. Ranasinghe, V. G. Zakrzewski, J. Gao, J. N Rega, G. Zheng, W. Liang, M. Hadač, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, K. Throssell, J. A. Montgomery Jr., J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E., Bratři, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, T. Keith, R., Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, J. M. Millam, M Klene, C. Adamo, R. Cammi, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, O. Farkas, J. B. Foresman, D. J. Fox, Gaussian 09, revize A. 02 (Gaussian, Inc., 2009).

    1. R. Krishnan,
    2. J. S. Binkley,
    3. R. Seeger,
    4. J. a. Pople

    , Self-konzistentní molekulární orbitální metody. XX. báze pro korelované vlnové funkce. J. Chem. Phys. 72, 650–654 (1980). doi: 10.1063/1.438955

    1. R. a. Kendall,
    2. T. H. Dunning Jr..,
    3. R. J. Harrison

    , elektronové afinity atomů první řady revisted. Systematické množiny bází a vlnové funkce. J. Chem. Phys. 96, 6796–6806 (1992). doi:10.1063/1.462569

    1. a. W. Schüttelkopf,
    2. D. M. F. van Aalten

    , PRODRG: nástroj pro high-propustnost krystalografie protein-ligand komplexů. Acta Crystallogr. D 60, 1355-1363 (2004). doi: 10.1107/S0907444904011679pmid:15272157

    1. P. It,
    2. k. M. Merz Jr.

    , ., Modelování iontů kovů pomocí klasické mechaniky. Cheme. Rev. 117, 1564-1686 (2017). doi: 10.1021 / acs.chemrev.6b00440pmid: 28045509

    1. Rh Stote, m. Karplus

    , vazba zinku v proteinech a roztoku: jednoduchá, ale možná přesná nebondovaná reprezentace. Proteiny 23, 12-31 (1995). doi: 10.1002 / prot.340230104pmid:8539245

    1. X Ventilátor,
    2. J. Yuan,
    3. Y. Bai,
    4. J. Kong,
    5. h. Wu

    , Biszinc dipikrát methanol-disolvát. Acta Crystallogr. E E68, m1072 (2012). doi:10.1107/S1600536812031443

    1. T. G. A. Youngs,
    2. C. Hardacre

    , Aplikace statické přenosu náboje v iontové-liquid silové pole a jeho vliv na strukturu a dynamiku. ChemPhysChem 9, 1548-1558 (2008). doi: 10.1002 / cphc.200800200pmid:18613196

    1. J. Schmidt,
    2. C. Krekeler,
    3. F. Dommert,
    4. Y. Zhao,
    5. R. Berger,
    6. L. Delle Site,
    7. C. Holm

    , redukce iontového náboje a atomové parciální náboje z výpočtů 1,3-dimethylimidazoliumchloridu z prvních principů. J.Phys. Cheme. B 114, 6150-6155 (2010). doi:10.1021/jp910771qpmid:20397676

    1. W. Beichel,
    2. N. Trapp,
    3. C. Hauf,
    4. O. Kohler,
    5. G. Eickerling,
    6. W. Scherer,
    7. I. Krossing

    , Nabíjení-měřítko efekt v iontové kapaliny z poplatku-hustota analýza N,N‘-dimethylimidazolium methylsulfát. Angew. Cheme. Int. EDA. 53, 3143–3146 (2014). doi: 10.1002 / anie.201308760pmid:24677323

    1. F. Müller-Plathe,
    2. W. F. van Gunsteren

    , Počítačové simulace polymerních elektrolytů: Lithium jodid v amorfní poly(ethylen oxid). J. Chem. Phys. 103, 4745–4756 (1995). doi:10.1063/1.470611

    1. K. J., Lin,
    2. J. K. Maranas

    , snížení ion-ion sdružení zlepšení mobility kationtů v jediném iontové vodiče? Phys. Cheme. Cheme. Phys. 15, 16143–16151 (2013). doi: 10.1039 / c3cp51661jpmid:23986076

    1. B. M. Savoie,
    2. M. a. Webb,
    3. T. F. Miller III

    , Posílení kationt difuze a potlačení difúze aniontů přes Lewis-Kyselé polymerní elektrolyty. J.Phys. Cheme. Lette. 8, 641–646 (2017). doi: 10.1021 / acs.jpclett.6b02662pmid:28075599

    1. H. Lee,
    2. R. M. Venable,
    3. a. D. Mackerell Jr..,
    4. R. W. Pastor

    Molekulární dynamiky studie polyethylenoxid a polyethylenglykol: Hydrodynamický poloměr a tvar anizotropie. Biophys. J. 95, 1590–1599 (2008). doi: 10.1529 / biophysj.108.133025 pmid:18456821

    1. I. C. Yeh,
    2. G. Hummer

    , Systém-velikost závislost difúzních koeficientů a viskozity z molekulární dynamiky simulace s periodické okrajové podmínky. J.Phys. Cheme. B 108, 15873-15879 (2004). doi:10.1021/jp0477147

  • P. G. de obci gennes, Škálování Pojmy v Polymerní Fyziky (Cornell Univ. Press, 1979).

    1. M. D. Wang,
    2. h. Yin,
    3. R. Landick,
    4. J. Gelles,
    5. S. M. blok

    , protahování DNA optickými pinzety. Biophys. J. 72, 1335-1346 (1997). doi:10.1016/S0006-3495(97)78780-0pmid:9138579

  • M. Frankel, K. N. Marsh, Eds., Hustoty Halohydrouhlovodíků (vol . 8J série fyzikální chemie Landolt-Börnstein – skupina IV, Springer, 2003).

  • Design Institut pro Fyzikální Vlastnosti, Projekt 801 (Americký Institut pro Chemické Inženýrství, 2010); www.aiche.org/dippr/projects/801.

  • O. Madelung, Ed., Statické dielektrické konstanty čistých kapalin a binárních kapalných směsí (sv. 6 série fyzikální chemie Landolt-Börnstein – skupina IV, Springer, 1991).

  • . C. L Obrací, Frambézie‘ Handbook of Termodynamické a Fyzikální Vlastnosti Chemických Sloučenin (Knovel, 2003).

  • D. R. Lide, CRC Handbook of Chemistry and Physics (CRC Press, ed. 90, 2009).

    1. G. Sivaramprasad,
    2. M. V. Rao,
    3. D. H. L. Prasad

    , Density and viscosity of ethanol + 1,2-dichloroethane, ethanol + 1,1,1-trichloroethane, and ethanol + 1,1,2,2-tetrachloroethane binary mixtures. J. Chem. Eng. Data 35, 122–124 (1990). doi:10.1021/je00060a006

    1. G. Pranami,
    2. M. H. Lamm

    , Estimating error in diffusion coefficients derived from molecular dynamics simulations. J. Chem. Theory Comput. 11, 4586–4592 (2015). doi:10.1021/acs.jctc.5b00574pmid:26889517

  • M. Rubinstein, R. H. Colby, Polymer Physics (Oxford Univ. Tisk, Ede. 1, 2003).

  • Poděkování: děkujeme K. Herbert o pomoc s postavou design a návrhy na DSC analýzy dat, P. Agrawal pro DOSY měření, a F. Etheridge za užitečné diskuse. Zvláštní poděkování s. Shangovi za obrázek jejího náramku pro Obr. 1A a R. Rauscher pro pomoc s několika postavami. Tato práce je financována NSF v rámci grantů CHE 1700847, CHE 1402849, a CHE 1151423 a na University of Chicago Materials Research Science and Engineering Center, který je financovaný NSF, pod award počet DMR-1420709. Další údaje jsou k dispozici v doplňkových materiálech.

    Napsat komentář

    Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.