Pane C. Wyville Thomson, v plné Sir Charles Wyville Thomson, (narozen 5. Března 1830, Bonsyde, West Lothian, Skotsko—zemřel 10. Března 1882, Bonsyde), Skotský přírodovědec, který byl jedním z prvních mořských biologů popsat život v hlubinách oceánu.
Po studiu medicíny na Univerzitě v Edinburghu, Thomson přednášel botaniku na Univerzitě v Aberdeenu (1850-51) a Marischal College (1851-52), ale soustředil se stále více na zoologii po svém jmenování do židle přírodních věd na Cork a Belfastu (1853-68), v Irsku.
Když byl jmenován profesorem přírodní historie v Edinburghu (1870), Thomson již obrátil svou pozornost výhradně na studium mořských bezobratlých. Na palubě dvou hlubinných bagrování expedice na sever Skotska (1868-69), objevil širokou škálu bezobratlých forem života—mnozí původně domnívali, že vyhynul—do hloubky 650 sáhů. Zjistil také, že hlubinné teploty nejsou tak konstantní, jak se předpokládalo, což naznačuje přítomnost oceánského oběhu. Thomson popsal tyto nálezy v hlubinách moře (1873).
v roce 1872 se pustil do průzkumu na palubě HMS Challenger. Posádka z pozorování a měření ze tří velkých oceánských pánví na 362 stanic během velmi úspěšné obeplutí 68,890 námořních mil (127,600 kilometrů). Thomson byl po svém návratu v roce 1876 povýšen na rytíře.