Stručný popis dvou typů programované buněčné smrti-apoptózy a autofagie
Apoptóza, nebo typ I programované buněčné smrti, je nejvíce široce studoval formy buněčné smrti. Jeho morfologické vlastnosti mohou být identifikovány pod světelným mikroskopem, a patří mobilní smrštění, lisování chromatinu, blebbing cytoplazmatické membrány, a, konečně, vznik apoptotických těla (Obrázek 1). Biochemically, apoptosis is characterized by the participation of proteases called caspases, orderly internucleosomal DNA fragmentation, phosphatidylserine externalization, changes in mitochondrial membrane permeability, and the participation of members of the Bcl-2 protein family.
Caspases jsou cysteinyl-aspartát-specifické proteázy, které jsou syntetizován v neaktivní formě jako zymogens tzv. pro-caspases (Obrázek 2). Tato neaktivní forma umožňuje řízené provádění procesu buněčné smrti. Kaspázy byly poprvé identifikovány u hlístic Ceanorhabditis elegans, ale homologní formy jsou přítomny u savců .
charakteristické znaky apoptózy, jako je fragmentace DNA a zhutněný chromatin, jsou výsledkem aktivity kaspázy. Během apoptózy je DNA fragmentována na velikost nukleosomu (200 bp). Faktor zodpovědný za fragmentaci DNA během apoptózy je specifické Dnázy (CAD, kaspázy aktivované Dnázy), který je aktivován aktivní kaspázy-3 . Aktivní kaspázy-3, v pořadí, se podílí na morfologické změny buněk během apoptózy, kde se štěpí rho-associated kinase-1 (ROCK-1) s cílem aktivovat a to, konečně, ovlivňuje cytoskeletární uspořádání způsobující apoptotických smrštění morfologie .
apoptotickou smrt buněk je vysoce regulována členové B-buněčného lymfomu 2 (Bcl-2) rodiny . Členové rodiny Bcl-2 byli klasifikováni jako antiapoptotické a proapoptotické proteiny podle jejich homologie Bcl-2 (BH)a organizace domény (obrázek 3). Přítomnost domén BH1, BH2, BH3 a BH4 odpovídá skupině, která inhibuje apoptózu. Pro-apoptotická skupina je naproti tomu rozdělena do dvou skupin: těch s doménami BH1, BH2 a BH3 a těch s doménami BH3 (definovanými pouze jako BH3; viz recenze v). Tato rodina proteinů plní své funkce na intracelulární úrovni uvnitř mitochondrií, což je klíčový prvek apoptózy.
apoptózu lze zahájit dvěma dobře popsanými cestami: vnější a vnitřní dráhy (obrázek 4). Vnější aktivace se provádí prostřednictvím účasti smrt ligandy (např. tumor nekrotizující faktor – TNF – nadčeleď, a TNF-související apoptózy indukované ligandy, nebo STOPA) s jejich příbuzný buněčné povrchové receptory smrti (jako TNF receptor 1, Fas, TRAIL receptor 1, nebo TRAIL receptor 2) (přezkoumána v ). Jakmile se ligand rozpozná a vazby na své receptory, série intracelulární komplexy jsou tvořeny aktivovat iniciátorem caspases (například -8 a -10), které pak aktivuje kata caspases (např. -3, -6 a -7). In their activated form, these executioner caspases cleave multiple intracellular targets.
vnitřní apoptotických dráhy, v kontrastu, může být aktivován různými stimuly, včetně poškození DNA, růstový faktor hladovění, a oxidační stres . Během expozice buněk těmto podnětům jsou ovlivněny mitochondrie, protože je aktivováno několik členů rodiny Bcl-2 a podporuje permeabilizaci vnější membrány mitochondrií (MOMP). Prostoupená vnější mitochondriální membrána umožňuje uvolňování cytochromu c (cyt c), který je spojen s proteinem Apaf-1. Na cyt c a Apaf-1 unie pak dluhopisů iniciátorem kaspázy-9 tvoří komplex, který představuje apoptosome, který má schopnost aktivovat iniciátorem caspases, že plní své funkce tím, že štěpí specifické buněčné substráty.
druhý proces buněčné smrti autofagie, je geneticky naprogramován a evolučně zachovaných proces, který způsobuje degradaci zastaralé organely a proteiny. Aktivuje se takovými extracelulárními podněty, jako je hladovění živin, hypoxie, vysoká teplota a změněné intracelulární stavy, včetně akumulace poškozených nebo nadbytečných organel (přezkoumáno v ).
v eukaryotických organismech byly popsány tři typy autofagie: mikroautofagie, makroautofagie (běžně nazývaná jednoduše autofagie) a autofagie zprostředkovaná chaperonem (obrázek 5). Microautophagy zahrnuje zaplavovat cytoplazmatických komponent přímo na úrovni lysosome prostřednictvím invaginací proces, zatímco macroautophagy zahrnuje vytvoření dvojité membránové vezikuly, které obsahují buněčné složky, které se spojí s lyzosomem tvořit autophagolysosome. Uvnitř autofagolysozomu jsou intra-vezikulární složky degradovány a pokud možno recyklovány buňkou (přezkoumáno v ). Chaperonem zprostředkovaná autofagie nakonec zahrnuje účast chaperonů na rozpoznávání proteinů určených k eliminaci lysozomy .
Autofagie je v režii Atg(Autofagie) geny, které jsou nutné k aktivaci signalizační komplex, který spouští tvorbu autophagosomes . Atggeny byly objeveny v kvasinkách, ale mnoho z nich má ortology ve vyšších eukaryotách (obrázek 6). Autophagosome tvorba zahrnuje účast na cytoplazmatický protein LC3 (Atg8), která prochází lipidation tím, fosfatidylethanolaminu, a je pak přijati do rodící se autophagosome membrány (Obrázek 7). Akumulace lipidovaného proteinu LC3 (známého jako LC3-II) se používá jako marker autofagie .
Autofagická buněčná smrt nebo programovaná buněčná smrt typu II je charakterizována masivním pohlcením cytoplazmy autofagickými vezikuly. Tato intenzivní autofagická aktivita se podstatně liší od autofagie, která se vyskytuje nepřetržitě na bazálních úrovních. Ultrastrukturální studie u Drosophily odhalily akumulaci autofagických vakuol ve většině larválních tkání. Tento typ programované buněčné smrti začíná degradace cytoplazmatických organel prostřednictvím autofagie, když cytoskeletální elementy jsou zachovány až do pozdních fázích procesu (přezkoumána v ).