Chemické Entity Biologické Zájmu, také známý jako ChEBI, je chemická databáze a ontologie molekulární subjekty zaměřené na „malé“ chemické sloučeniny, která je součástí Otevřené Biomedicínské Ontologie (OBO) úsilí na Evropské Bioinformatics Institute (EBI). Termín „molekulární entita“ označuje jakýkoli “ ústavně nebo izotopicky odlišný atom, molekula, ion, iontový pár, radikál, radikální iont, komplex,konformátor, atd., identifikovatelné jako Samostatně rozlišitelná entita“. Dotyčné molekulární entity jsou buď přírodní produkty, nebo syntetické produkty, které mají potenciální bioaktivitu. Molekuly přímo kódované genomem, jako jsou nukleové kyseliny, proteiny a peptidy odvozené od proteinů proteolytickým štěpením, nejsou zpravidla zahrnuty do ChEBI.

Chemické Entity Biologické Zájmu (ChEBI)

Content

Description

Chemical database

Data types
captured

Small chemical compounds

Contact

Research center

European Molecular Biology Laboratory

Laboratory

European Bioinformatics Institute

Primary citation

de Matos et al

Access

Website

www.ebi.ac.uk/chebi

Download URL

ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi

Web service URL

www.ebi.ac.uk/chebi/webServices.do

Sparql endpoint

BIO2RDF

Tools

Web

www.ebi.ac.uk/chebi

Různé

Data vydání
frekvence

měsíční

Curation politiky

Ručně kurátor

ChEBI používá nomenklatury, symbolika a terminologie schválená Mezinárodní Unií Čisté a Aplikované Chemie (IUPAC) a nomenklatury výboru Mezinárodní Unie Biochemie a Molekulární Biologie (NC-IUBMB).